Result of SIM4 for
pF1KB7326
seq1 = pF1KB7326.tfa, 3645 bp
seq2 = pF1KB7326/gi568815587f_33186415.tfa (gi568815587f:33186415_33453565), 267151 bp
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>gi568815587f:33186415_33453565 (Chr11)
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0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCTCACAAGTCTTGGTCTACCCACCATATGTTTATCAAACTCAGTC
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100001 ATGGCCTCACAAGTCTTGGTCTACCCACCATATGTTTATCAAACTCAGTC
50 . : . : . : . : . :
51 AAGTGCCTTTTGTAGTGTGAAGAAACTCAAAGTAGAGCCAAGCAGTTGTG
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100051 AAGTGCCTTTTGTAGTGTGAAGAAACTCAAAGTAGAGCCAAGCAGTTGTG
100 . : . : . : . : . :
101 TATTCCAGGAAAGAAACTATCCACGGACCTATGTGAATGGTAGAAACTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TATTCCAGGAAAGAAACTATCCACGGACCTATGTGAATGGTAGAAACTTT
150 . : . : . : . : . :
151 GGAAATTCTCATCCTCCCACTAAGGGTAGTGCTTTTCAGACAAAGATACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGAAATTCTCATCCTCCCACTAAGGGTAGTGCTTTTCAGACAAAGATACC
200 . : . : . : . : . :
201 ATTTAATAGACCTCGAGGACACAACTTTTCATTGCAGACAAGTGCTGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 ATTTAATAGACCTCGAGGACACAACTTTTCATTGCAGACAAGTGCTGTTG
250 . : . : . : . : . :
251 TTTTGAAAAACACTGCAGGTGCTACAAAGGTCATAGCAGCTCAGGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 TTTTGAAAAACACTGCAGGTGCTACAAAGGTCATAGCAGCTCAGGCACAG
300 . : . : . : . : . :
301 CAAGCTCACGTGCAGGCACCTCAGATTGGGGCGTGGCGAAACAGATTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CAAGCTCACGTGCAGGCACCTCAGATTGGGGCGTGGCGAAACAGATTGCA
350 . : . : . : . : . :
351 TTTCCTAGAAGGCCCCCAGCGATGTGGATTGAAGCGCAAGAGTGAGGAGT
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100351 TTTCCTAGAAGGCCCCCAGCGATGTGGATTGAAGCGCAAGAGTGAGGAGT
400 . : . : . : . : . :
401 TGGATAATCATAGCAGCGCAATGCAGATTGTCGATGAATTGTCCATACTT
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100401 TGGATAATCATAGCAGCGCAATGCAGATTGTCGATGAATTGTCCATACTT
450 . : . : . : . : . :
451 CCTGCAATGTTGCAAACCAACATGGGAAATCCAGTGACAGTTGTGACAGC
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100451 CCTGCAATGTTGCAAACCAACATGGGAAATCCAGTGACAGTTGTGACAGC
500 . : . : . : . : . :
501 TACCACAGGATCAAAACAGAATTGTACCACTGGAGAAGGTGACTATCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 TACCACAGGATCAAAACAGAATTGTACCACTGGAGAAGGTGACTATCAGT
550 . : . : . : . : . :
551 TAGTACAGCATGAAGTCTTATGCTCCATGAAAAATACTTACGAAGTCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TAGTACAGCATGAAGTCTTATGCTCCATGAAAAATACTTACGAAGTCCTT
600 . : . : . : . : . :
601 GATTTTCTTGGTCGAGGCACGTTTGGCCAGGTAGTTAAATGCTGGAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GATTTTCTTGGTCGAGGCACGTTTGGCCAGGTAGTTAAATGCTGGAAAAG
650 . : . : . : . : . :
651 AGGGACAAATGAAATTGTAGCAATCAAAATTTTGAAGAATCATCCTTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 AGGGACAAATGAAATTGTAGCAATCAAAATTTTGAAGAATCATCCTTCTT
700 . : . : . : . : . :
701 ATGCCCGTCAAGGTCAAATAGAAGTGAGCATATTAGCAAGGCTCAGTACT
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100701 ATGCCCGTCAAGGTCAAATAGAAGTGAGCATATTAGCAAGGCTCAGTACT
750 . : . : . : . : . :
751 GAAAATGCTGATGAATATAACTTTGTACGAGCTTATGAATGCTTTCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 GAAAATGCTGATGAATATAACTTTGTACGAGCTTATGAATGCTTTCAGCA
800 . : . : . : . : . :
801 CCGTAACCATACTTGTTTAGTCTTTGAGATGCTGGAACAAAACTTGTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CCGTAACCATACTTGTTTAGTCTTTGAGATGCTGGAACAAAACTTGTATG
850 . : . : . : . : . :
851 ACTTTCTGAAACAAAATAAATTTAGTCCCCTGCCACTAAAAGTGATTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 ACTTTCTGAAACAAAATAAATTTAGTCCCCTGCCACTAAAAGTGATTCGG
900 . : . : . : . : . :
901 CCCATTCTTCAACAAGTGGCCACTGCACTGAAAAAATTGAAAAGTCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 CCCATTCTTCAACAAGTGGCCACTGCACTGAAAAAATTGAAAAGTCTTGG
950 . : . : . : . : . :
951 TTTAATTCATGCTGATCTCAAGCCAGAGAATATTATGTTGGTGGATCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 TTTAATTCATGCTGATCTCAAGCCAGAGAATATTATGTTGGTGGATCCTG
1000 . : . : . : . : . :
1001 TTCGGCAGCCTTACAGGGTTAAAGTAATAGACTTTGGGTCGGCCAGTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 TTCGGCAGCCTTACAGGGTTAAAGTAATAGACTTTGGGTCGGCCAGTCAT
1050 . : . : . : . : . :
1051 GTATCAAAGACTGTTTGTTCAACATATCTACAATCTCGGTACTACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
101051 GTATCAAAGACTGTTTGTTCAACATATCTACAATCTCGGTACTACAGGTA
1100 . : . : . : . : . :
1098 AGCTCCAGAGATTATATTGGGGTTGCCATTTTGTGAAGCCATAG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 ...CAGAGCTCCAGAGATTATATTGGGGTTGCCATTTTGTGAAGCCATAG
1150 . : . : . : . : . :
1142 ACATGTGGTCATTGGGATGTGTGATTGCAGAATTATTTCTTGGATGGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142140 ACATGTGGTCATTGGGATGTGTGATTGCAGAATTATTTCTTGGATGGCCG
1200 . : . : . : . : . :
1192 CTCTACCCAGGAGCCTTGGAGTATGATCAG ATTCGATACAT
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142190 CTCTACCCAGGAGCCTTGGAGTATGATCAGGTA...CAGATTCGATACAT
1250 . : . : . : . : . :
1233 TTCTCAGACTCAAGGTTTGCCAGGAGAACAGTTGTTAAATGTGGGTACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150672 TTCTCAGACTCAAGGTTTGCCAGGAGAACAGTTGTTAAATGTGGGTACTA
1300 . : . : . : . : . :
1283 AATCCACAAGATTTTTTTGCAAAGAAACAGATATGTCTCATTCTGGTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150722 AATCCACAAGATTTTTTTGCAAAGAAACAGATATGTCTCATTCTGGTTGG
1350 . : . : . : . : . :
1333 AGATTAAAG ACATTGGAAGAGCATGAGGCAGAGACAGGAAT
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150772 AGATTAAAGGTA...AAGACATTGGAAGAGCATGAGGCAGAGACAGGAAT
1400 . : . : . : . : . :
1374 GAAGTCTAAAGAAGCCAGAAAATACATTTTCAACAGTCTGGATGATGTAG
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152375 GAAGTCTAAAGAAGCCAGAAAATACATTTTCAACAGTCTGGATGATGTAG
1450 . : . : . : . : . :
1424 CGCAT GTGAACACAGTGATGGATTTGGAAGGAAGTGATCTT
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152425 CGCATGTG...TAGGTGAACACAGTGATGGATTTGGAAGGAAGTGATCTT
1500 . : . : . : . : . :
1465 TTGGCTGAGAAAGCTGATAGAAGAGAATTTGTTAGTCTGTTGAAGAAAAT
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152972 TTGGCTGAGAAAGCTGATAGAAGAGAATTTGTTAGTCTGTTGAAGAAAAT
1550 . : . : . : . : . :
1515 GTTGCTGATTGATGCAGATTTAAGAATTACTCCAGCTGAGACCCTGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153022 GTTGCTGATTGATGCAGATTTAAGAATTACTCCAGCTGAGACCCTGAACC
1600 . : . : . : . : . :
1565 ATCCTTTTGTTAATATGAAACATCTTCTAGATTTCCCTCATAGCAACCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
153072 ATCCTTTTGTTAATATGAAACATCTTCTAGATTTCCCTCATAGCAACCAG
1650 . : . : . : . : . :
1614 TGTAAAGTCCTGTTTTCATATTATGGATATTTGTAAGTCCCA
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153122 TA...CAGTGTAAAGTCCTGTTTTCATATTATGGATATTTGTAAGTCCCA
1700 . : . : . : . : . :
1656 CCTAAATTCATGTGACACAAATAATCACAACAAAACTTCACTTTTAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154596 CCTAAATTCATGTGACACAAATAATCACAACAAAACTTCACTTTTAAGAC
1750 . : . : . : . : . :
1706 CAGTTGCTTCAAGCAGTACTGCTACACTGACTGCAAATTTTACTAAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154646 CAGTTGCTTCAAGCAGTACTGCTACACTGACTGCAAATTTTACTAAAATC
1800 . : . : . : . : . :
1756 GGAACATTAAGAAGTCAG GCATTGACCACATCTGCTCATTC
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154696 GGAACATTAAGAAGTCAGGTA...CAGGCATTGACCACATCTGCTCATTC
1850 . : . : . : . : . :
1797 AGTTGTGCACCATGGAATACCTCTGCAGGCAGGAACTGCTCAGTTTGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155172 AGTTGTGCACCATGGAATACCTCTGCAGGCAGGAACTGCTCAGTTTGGTT
1900 . : . : . : . : . :
1847 GTGGTGATGCTTTTCAGCAGACATTGATTATCTGTCCCCCAGCTATTCAA
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155222 GTGGTGATGCTTTTCAGCAGACATTGATTATCTGTCCCCCAGCTATTCAA
1950 . : . : . : . : . :
1897 G GTATTCCTGCAACACATGGTAAACCCACCAGTTATTCAAT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155272 GGTA...CAGGTATTCCTGCAACACATGGTAAACCCACCAGTTATTCAAT
2000 . : . : . : . : . :
1938 AAGGGTAGATAATACAGTTCCACTTGTAACTCAGGCCCCAGCTGTGCAGC
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160919 AAGGGTAGATAATACAGTTCCACTTGTAACTCAGGCCCCAGCTGTGCAGC
2050 . : . : . : . : . :
1988 CACTACAGATCCGACCAGGAGTTCTTTCTCAG ACGTGGTCT
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160969 CACTACAGATCCGACCAGGAGTTCTTTCTCAGGTT...CAGACGTGGTCT
2100 . : . : . : . : . :
2029 GGTAGAACACAGCAGATGCTGGTGCCTGCCTGGCAACAGGTGACACCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161224 GGTAGAACACAGCAGATGCTGGTGCCTGCCTGGCAACAGGTGACACCCCT
2150 . : . : . : . : . :
2079 GGCTCCTGCTACTACTACACTAACTTCTGAGAGTGTGGCTGGTTCACACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161274 GGCTCCTGCTACTACTACACTAACTTCTGAGAGTGTGGCTGGTTCACACA
2200 . : . : . : . : . :
2129 GGCTTGGAGACTGGGG GAAGATGATTTCATGCAGCAATCAT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
161324 GGCTTGGAGACTGGGGGTA...TAGGAAGATGATTTCATGCAGCAATCAT
2250 . : . : . : . : . :
2170 TATAACTCAGTGATGCCGCAGCCTCTTCTGACCAATCAGATAACTTTATC
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161463 TATAACTCAGTGATGCCGCAGCCTCTTCTGACCAATCAGATAACTTTATC
2300 . : . : . : . : . :
2220 TGCCCCTCAGCCAGTTAGTGTGGGGATTGCACATGTTGTCTGGCCTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161513 TGCCCCTCAGCCAGTTAGTGTGGGGATTGCACATGTTGTCTGGCCTCAGC
2350 . : . : . : . : . :
2270 CTGCCACTACCAAGAAAAATAAACAGTGCCAGAACAG AGGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
161563 CTGCCACTACCAAGAAAAATAAACAGTGCCAGAACAGGTT...CAGAGGT
2400 . : . : . : . : . :
2311 ATTTTGGTAAAACTAATGGAATGGGAGCCAGGAAGAGAGGAAATAAATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161756 ATTTTGGTAAAACTAATGGAATGGGAGCCAGGAAGAGAGGAAATAAATGC
2450 . : . : . : . : . :
2361 TTTCAGTTG GAGTAATTCATTACAGAATACCAATATCCCAC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
161806 TTTCAGTTGGTA...CAGGAGTAATTCATTACAGAATACCAATATCCCAC
2500 . : . : . : . : . :
2402 ATTCAGCATTTATTTCTCCAAAGATAATTAATGGGAAAGATGTCGAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162140 ATTCAGCATTTATTTCTCCAAAGATAATTAATGGGAAAGATGTCGAGGAA
2550 . : . : . : . : . :
2452 GTAAGTTGTATAGAAACACAGGACAATCAGAACTCAGAAGGAGAGGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162190 GTAAGTTGTATAGAAACACAGGACAATCAGAACTCAGAAGGAGAGGCAAG
2600 . : . : . : . : . :
2502 AAATTGCTGTGAAACATCTATCAGACAGGACTCTGATTCATCAGTTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162240 AAATTGCTGTGAAACATCTATCAGACAGGACTCTGATTCATCAGTTTCAG
2650 . : . : . : . : . :
2552 ACAAACAGCGGCAAACCATCATTATTGCCGACTCCCCGAGTCCTGCAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162290 ACAAACAGCGGCAAACCATCATTATTGCCGACTCCCCGAGTCCTGCAGTG
2700 . : . : . : . : . :
2602 AGTGTCATCACTATCAGCAGTGACACTGATGAGGAAGAGACTTCCCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162340 AGTGTCATCACTATCAGCAGTGACACTGATGAGGAAGAGACTTCCCAGAG
2750 . : . : . : . : . :
2652 ACATTCACTCAGAGA ATGTAAAGGTAGTCTAGATTGTGAAG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
162390 ACATTCACTCAGAGAGTA...TAGATGTAAAGGTAGTCTAGATTGTGAAG
2800 . : . : . : . : . :
2693 CTTGCCAGAGCACTTTGAATATTGATCGGATGTGTTCATTAAGTAGTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162759 CTTGCCAGAGCACTTTGAATATTGATCGGATGTGTTCATTAAGTAGTCCT
2850 . : . : . : . : . :
2743 GATAGTACTCTGAGTACCAGCTCCTCAGGGCAGTCCAGCCCATCCCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162809 GATAGTACTCTGAGTACCAGCTCCTCAGGGCAGTCCAGCCCATCCCCCTG
2900 . : . : . : . : . :
2793 CAAGAGACCGAATAG TATGTCAGATGAAGAGCAAGAAAGTA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
162859 CAAGAGACCGAATAGGTA...TAGTATGTCAGATGAAGAGCAAGAAAGTA
2950 . : . : . : . : . :
2834 GTTGTGATACGGTGGATGGCTCTCCGACATCTGACTCTTCCGGGCATGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165220 GTTGTGATACGGTGGATGGCTCTCCGACATCTGACTCTTCCGGGCATGAC
3000 . : . : . : . : . :
2884 AGTCCATTTGCAGAGAGCACTTTTGTGGAGGACACTCATGAAAACACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165270 AGTCCATTTGCAGAGAGCACTTTTGTGGAGGACACTCATGAAAACACAGA
3050 . : . : . : . : . :
2934 ATTGGTATCCTCTGCTGACACAGAAACCAAGCCAGCTGTCTGTTCTGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165320 ATTGGTATCCTCTGCTGACACAGAAACCAAGCCAGCTGTCTGTTCTGTTG
3100 . : . : . : . : . :
2984 TGGTGCCACCAGTGGAACTAGAAAATGGCTTAAATGCCGATGAGCATATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165370 TGGTGCCACCAGTGGAACTAGAAAATGGCTTAAATGCCGATGAGCATATG
3150 . : . : . : . : . :
3034 GCAAACACAG ATTCTATATGCCAGCCATTAATAAAAGGACG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
165420 GCAAACACAGGTA...CAGATTCTATATGCCAGCCATTAATAAAAGGACG
3200 . : . : . : . : . :
3075 ATCTGCCCCTGGAAGATTAAACCAGCCTTCTGCAGTGGGTACTCGTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165755 ATCTGCCCCTGGAAGATTAAACCAGCCTTCTGCAGTGGGTACTCGTCAGC
3250 . : . : . : . : . :
3125 AAAAATTGACATCAGCATTCCAGCAGCAGCATTTGAACTTCAGTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
165805 AAAAATTGACATCAGCATTCCAGCAGCAGCATTTGAACTTCAGTCAGGTA
3300 . : . : . : . : . :
3172 GTTCAGCACTTTGGATCTGGGCATCAAGAGTGGAATGGAAACTT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165855 ...TAGGTTCAGCACTTTGGATCTGGGCATCAAGAGTGGAATGGAAACTT
3350 . : . : . : . : . :
3216 TGGGCACAGAAGACAGCAAGCTTATATTCCTACTAGTGTTACCAGTAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166722 TGGGCACAGAAGACAGCAAGCTTATATTCCTACTAGTGTTACCAGTAATC
3400 . : . : . : . : . :
3266 CATTCACTCTTTCTCATGGAAGTCCCAATCACACAGCAGTGCATGCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166772 CATTCACTCTTTCTCATGGAAGTCCCAATCACACAGCAGTGCATGCCCAC
3450 . : . : . : . : . :
3316 CTGGCTGGAAATACACACCTCGGAGGACAGCCTACTCTACTTCCATACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166822 CTGGCTGGAAATACACACCTCGGAGGACAGCCTACTCTACTTCCATACCC
3500 . : . : . : . : . :
3366 ATCATCAGCCACCCTCAGTAGTGCTGCACCAGTGGCCCACCTGTTAGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166872 ATCATCAGCCACCCTCAGTAGTGCTGCACCAGTGGCCCACCTGTTAGCCT
3550 . : . : . : . : . :
3416 CTCCGTGTACCTCAAGACCTATGTTACAGCATCCAACTTATAATATCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166922 CTCCGTGTACCTCAAGACCTATGTTACAGCATCCAACTTATAATATCTCC
3600 . : . : . : . : . :
3466 CATCCCAGTGGCATAGTTCACCAAGTCCCAGTGGGCTTAAATCCCCGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166972 CATCCCAGTGGCATAGTTCACCAAGTCCCAGTGGGCTTAAATCCCCGTCT
3650 . : . : . : . : . :
3516 GTTACCATCCCCAACCATTCATCAGACTCAGTACAAACCAATCTTCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167022 GTTACCATCCCCAACCATTCATCAGACTCAGTACAAACCAATCTTCCCAC
3700 . : . : . : . : . :
3566 CACATTCTTACATTGCAGCATCACCTGCATATACTGGATTTCCACTGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167072 CACATTCTTACATTGCAGCATCACCTGCATATACTGGATTTCCACTGAGT
3750 . : . : . :
3616 CCAACAAAACTCAGCCAGTATCCATATATG
||||||||||||||||||||||||||||||
167122 CCAACAAAACTCAGCCAGTATCCATATATG