seq1 = pF1KB7318.tfa, 3543 bp
seq2 = pF1KB7318/gi568815579f_55899726.tfa (gi568815579f:55899726_56161525), 261800 bp

>pF1KB7318 3543
>gi568815579f:55899726_56161525 (Chr19)

1-62  (100001-100062)   100% ->
63-442  (103991-104370)   100% ->
443-508  (109063-109128)   100% ->
509-565  (116017-116073)   100% ->
566-622  (119617-119673)   100% ->
623-2219  (127188-128784)   100% ->
2220-2390  (132886-133056)   100% ->
2391-2558  (133817-133984)   100% ->
2559-2729  (138300-138470)   100% ->
2730-2900  (141197-141367)   100% ->
2901-3071  (150693-150863)   100% ->
3072-3242  (153913-154083)   100% ->
3243-3413  (158515-158685)   100% ->
3414-3543  (161671-161800)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTTGCAGGAGGACTTGAACTTGGAGCTGCTGCTCTGCTCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTTGCAGGAGGACTTGAACTTGGAGCTGCTGCTCTGCTCTCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCACCACGTGC         TCTTGTCACTCTTTCCACAGGTCCTACTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCACCACGTGCGTC...AAGTCTTGTCACTCTTTCCACAGGTCCTACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTCTATATTACCAAAGAATCCACTTTTCCCCCAAAACCTGAGCTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104020 GCTCTATATTACCAAAGAATCCACTTTTCCCCCAAAACCTGAGCTCTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTTGTATCAAGATGGAAGGAGACAAATCGCTCACCTTTTCCAGCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104070 CCTTGTATCAAGATGGAAGGAGACAAATCGCTCACCTTTTCCAGCTACGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGCAATGGTGTCTCTATGAGCTAGACAAGGAAGAATTTCAGACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104120 GCTGCAATGGTGTCTCTATGAGCTAGACAAGGAAGAATTTCAGACATTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAATTACTAAAGAAGAAATCTTCAGAATCGACCACATGCTCTATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104170 AGGAATTACTAAAGAAGAAATCTTCAGAATCGACCACATGCTCTATTCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGTTTGAAATCGAGAATGCCAACGTGGAATGTCTGGCACTCCTCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104220 CAGTTTGAAATCGAGAATGCCAACGTGGAATGTCTGGCACTCCTCTTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAGTATTATGGAGCATCGCTGGCCTGGGCTACGTCCATTAGCATCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104270 TGAGTATTATGGAGCATCGCTGGCCTGGGCTACGTCCATTAGCATCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAAACATGAACCTGCGAACCCTCTCGGAGAAGGCACGGGATGACATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104320 AAAACATGAACCTGCGAACCCTCTCGGAGAAGGCACGGGATGACATGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 A         GACATTCACCAGAAGATCCTGAAGCAACGATGACTGACCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104370 AGTA...CAGGACATTCACCAGAAGATCCTGAAGCAACGATGACTGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGGACCAAGCAAGGAAAAAGTGCCAG         GAATTTCACAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109103 AGGACCAAGCAAGGAAAAAGTGCCAGGTT...CAGGAATTTCACAAGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCAACAAGATAGTGCCACAGCTGCAGAGACAAAAGAACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 116032 TGCAACAAGATAGTGCCACAGCTGCAGAGACAAAAGAACAAGGTG...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    566  AAATTTCACAAGCTATGGAACAAGAAGGTGCCACAGCAGCAGAGACAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119616 GAAATTTCACAAGCTATGGAACAAGAAGGTGCCACAGCAGCAGAGACAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAACAAG         GACATGGAGGTGACACATGGGACTACAAGAGTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 119666 AGAACAAGGTG...CAGGACATGGAGGTGACACATGGGACTACAAGAGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACGTGATGACCAAATTCGCTGAGGAGGAGGATGTACGTCGTAGTTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127221 ACGTGATGACCAAATTCGCTGAGGAGGAGGATGTACGTCGTAGTTTTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACACTGCTGCTGACTGGCCGGAAATGCAAACGTTGGCTGGTGCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127271 AACACTGCTGCTGACTGGCCGGAAATGCAAACGTTGGCTGGTGCTTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTCAGACCGGTGGGGCTTCCGGCCTCGCACGGTGGTTCTGCACGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127321 TTCAGACCGGTGGGGCTTCCGGCCTCGCACGGTGGTTCTGCACGGAAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGGAATTGGGAAATCGGCTCTAGCCAGAAGGATCGTGCTGTGCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127371 CAGGAATTGGGAAATCGGCTCTAGCCAGAAGGATCGTGCTGTGCTGGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAAGGTGGACTCTACCAGGGAATGTTCTCCTACGTCTTCTTCCTCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127421 CAAGGTGGACTCTACCAGGGAATGTTCTCCTACGTCTTCTTCCTCCCCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TAGAGAGATGCAGCGGAAGAAGGAGAGCAGTGTCACAGAGTTCATCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127471 TAGAGAGATGCAGCGGAAGAAGGAGAGCAGTGTCACAGAGTTCATCTCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGGAGTGGCCAGACTCCCAGGCTCCGGTGACGGAGATCATGTCCCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127521 GGGAGTGGCCAGACTCCCAGGCTCCGGTGACGGAGATCATGTCCCGACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAAAGGCTGTTGTTCATCATTGACGGTTTCGATGACCTGGGCTCTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127571 GAAAGGCTGTTGTTCATCATTGACGGTTTCGATGACCTGGGCTCTGTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAACAATGACACAAAGCTCTGCAAAGACTGGGCTGAGAAGCAGCCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127621 CAACAATGACACAAAGCTCTGCAAAGACTGGGCTGAGAAGCAGCCTCCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TCACCCTCATACGCAGTCTGCTGAGGAAGGTCCTGCTCCCTGAGTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127671 TCACCCTCATACGCAGTCTGCTGAGGAAGGTCCTGCTCCCTGAGTCCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CTGATCGTCACCGTCAGAGACGTGGGCACAGAGAAGCTCAAGTCAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127721 CTGATCGTCACCGTCAGAGACGTGGGCACAGAGAAGCTCAAGTCAGAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CGTGTCTCCCCGTTACCTGTTAGTTAGAGGAATCTCCGGGGAACAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127771 CGTGTCTCCCCGTTACCTGTTAGTTAGAGGAATCTCCGGGGAACAAAGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCCACTTGCTCCTTGAGCGCGGGATTGGTGAGCATCAGAAGACACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127821 TCCACTTGCTCCTTGAGCGCGGGATTGGTGAGCATCAGAAGACACAAGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TTGCGTGCGATCATGAACAACCGTGAGCTGCTCGACCAGTGCCAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127871 TTGCGTGCGATCATGAACAACCGTGAGCTGCTCGACCAGTGCCAGGTGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CGCCGTGGGCTCTCTCATCTGCGTGGCCCTGCAGCTGCAGGACGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127921 CGCCGTGGGCTCTCTCATCTGCGTGGCCCTGCAGCTGCAGGACGTGGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GGGAGAGCGTCGCCCCCTTCAACCAAACGCTCACAGGCCTGCACGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127971 GGGAGAGCGTCGCCCCCTTCAACCAAACGCTCACAGGCCTGCACGCCGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TTTGTGTTTCATCAGCTCACCCCTCGAGGCGTGGTCCGGCGCTGTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128021 TTTGTGTTTCATCAGCTCACCCCTCGAGGCGTGGTCCGGCGCTGTCTCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TCTGGAGGAAAGAGTTGTCCTGAAGCGCTTCTGCCGTATGGCTGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128071 TCTGGAGGAAAGAGTTGTCCTGAAGCGCTTCTGCCGTATGGCTGTGGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 GAGTGTGGAATAGGAAGTCAGTGTTTGACGGTGACGACCTCATGGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128121 GAGTGTGGAATAGGAAGTCAGTGTTTGACGGTGACGACCTCATGGTTCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GGACTCGGGGAGTCTGAGCTCCGTGCTCTGTTTCACATGAACATCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128171 GGACTCGGGGAGTCTGAGCTCCGTGCTCTGTTTCACATGAACATCCTTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CCCAGACAGCCACTGTGAGGAGTACTACACCTTCTTCCACCTCAGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128221 CCCAGACAGCCACTGTGAGGAGTACTACACCTTCTTCCACCTCAGTCTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AGGACTTCTGTGCCGCCTTGTACTACGTGTTAGAGGGCCTGGAAATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128271 AGGACTTCTGTGCCGCCTTGTACTACGTGTTAGAGGGCCTGGAAATCGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CCAGCTCTCTGCCCTCTGTACGTTGAGAAGACAAAGAGGTCCATGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128321 CCAGCTCTCTGCCCTCTGTACGTTGAGAAGACAAAGAGGTCCATGGAGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TAAACAGGCAGGCTTCCATATCCACTCGCTTTGGATGAAGCGTTTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128371 TAAACAGGCAGGCTTCCATATCCACTCGCTTTGGATGAAGCGTTTCTTGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TTGGCCTCGTGAGCGAAGACGTAAGGAGGCCACTGGAGGTCCTGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128421 TTGGCCTCGTGAGCGAAGACGTAAGGAGGCCACTGGAGGTCCTGCTGGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 TGTCCCGTTCCCCTGGGGGTGAAGCAGAAGCTTCTGCACTGGGTCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128471 TGTCCCGTTCCCCTGGGGGTGAAGCAGAAGCTTCTGCACTGGGTCTCTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GTTGGGTCAGCAGCCTAATGCCACCACCCCAGGAGACACCCTGGACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128521 GTTGGGTCAGCAGCCTAATGCCACCACCCCAGGAGACACCCTGGACGCCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 TCCACTGTCTTTTCGAGACTCAAGACAAAGAGTTTGTTCGCTTGGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128571 TCCACTGTCTTTTCGAGACTCAAGACAAAGAGTTTGTTCGCTTGGCATTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 AACAGCTTCCAAGAAGTGTGGCTTCCGATTAACCAGAACCTGGACTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128621 AACAGCTTCCAAGAAGTGTGGCTTCCGATTAACCAGAACCTGGACTTGAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 AGCATCTTCCTTCTGCCTCCAGCACTGTCCGTATTTGCGGAAAATTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128671 AGCATCTTCCTTCTGCCTCCAGCACTGTCCGTATTTGCGGAAAATTCGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TGGATGTCAAAGGGATCTTCCCAAGAGATGAGTCCGCTGAGGCATGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128721 TGGATGTCAAAGGGATCTTCCCAAGAGATGAGTCCGCTGAGGCATGTCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 GTGGTCCCTCTATG         GATGCGGGATAAGACCCTCATTGAGGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128771 GTGGTCCCTCTATGGTG...TAGGATGCGGGATAAGACCCTCATTGAGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 GCAGTGGGAAGATTTCTGCTCCATGCTTGGCACCCACCCACACCTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132913 GCAGTGGGAAGATTTCTGCTCCATGCTTGGCACCCACCCACACCTGCGGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2297 AGCTGGACCTGGGCAGCAGCATCCTGACAGAGCGGGCCATGAAGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132963 AGCTGGACCTGGGCAGCAGCATCCTGACAGAGCGGGCCATGAAGACCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347 TGTGCCAAGCTGAGGCATCCCACCTGCAAGATACAGACCCTGAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 133013 TGTGCCAAGCTGAGGCATCCCACCTGCAAGATACAGACCCTGATGTA...

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2391    GTTTAGAAATGCACAGATTACCCCTGGTGTGCAGCACCTCTGGAGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133814 CAGGTTTAGAAATGCACAGATTACCCCTGGTGTGCAGCACCTCTGGAGAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2438 TCGTCATGGCCAACCGTAACCTAAGATCCCTCAACTTGGGAGGCACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133864 TCGTCATGGCCAACCGTAACCTAAGATCCCTCAACTTGGGAGGCACCCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2488 CTGAAGGAAGAGGATGTAAGGATGGCGTGTGAAGCCTTAAAACACCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133914 CTGAAGGAAGAGGATGTAAGGATGGCGTGTGAAGCCTTAAAACACCCAAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2538 ATGTTTGTTGGAGTCTTTGAG         GCTGGATTGCTGTGGATTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 133964 ATGTTTGTTGGAGTCTTTGAGGTA...CAGGCTGGATTGCTGTGGATTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2579 CCCATGCCTGTTACCTGAAGATCTCCCAAATCCTTACGACCTCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138320 CCCATGCCTGTTACCTGAAGATCTCCCAAATCCTTACGACCTCCCCCAGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629 CTGAAATCTCTGAGCCTGGCAGGAAACAAGGTGACAGACCAGGGAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138370 CTGAAATCTCTGAGCCTGGCAGGAAACAAGGTGACAGACCAGGGAGTAAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2679 GCCTCTCAGTGATGCCTTGAGAGTCTCCCAGTGCGCCCTGCAGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138420 GCCTCTCAGTGATGCCTTGAGAGTCTCCCAGTGCGCCCTGCAGAAGCTGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2729 T         ACTGGAGGACTGTGGCATCACAGCCACGGGTTGCCAGAGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138470 TGTG...CAGACTGGAGGACTGTGGCATCACAGCCACGGGTTGCCAGAGT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770 CTGGCCTCAGCCCTCGTCAGCAACCGGAGCTTGACACACCTGTGCCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141237 CTGGCCTCAGCCCTCGTCAGCAACCGGAGCTTGACACACCTGTGCCTATC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2820 CAACAACAGCCTGGGGAACGAAGGTGTAAATCTACTGTGTCGATCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141287 CAACAACAGCCTGGGGAACGAAGGTGTAAATCTACTGTGTCGATCCATGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2870 GGCTTCCCCACTGTAGTCTGCAGAGGCTGAT         GCTGAATCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141337 GGCTTCCCCACTGTAGTCTGCAGAGGCTGATGTG...CAGGCTGAATCAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2911 TGCCACCTGGACACGGCTGGCTGTGGTTTTCTTGCACTTGCGCTTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150703 TGCCACCTGGACACGGCTGGCTGTGGTTTTCTTGCACTTGCGCTTATGGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2961 TAACTCATGGCTGACGCACCTGAGCCTTAGCATGAACCCTGTGGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150753 TAACTCATGGCTGACGCACCTGAGCCTTAGCATGAACCCTGTGGAAGACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3011 ATGGCGTGAAGCTTCTGTGCGAGGTCATGAGAGAACCATCTTGTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150803 ATGGCGTGAAGCTTCTGTGCGAGGTCATGAGAGAACCATCTTGTCATCTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3061 CAGGACCTGGA         GTTGGTAAAGTGTCATCTCACCGCCGCGTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 150853 CAGGACCTGGAGTG...CAGGTTGGTAAAGTGTCATCTCACCGCCGCGTG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3102 CTGTGAGAGTCTGTCCTGTGTGATCTCGAGGAGCAGACACCTGAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153943 CTGTGAGAGTCTGTCCTGTGTGATCTCGAGGAGCAGACACCTGAAGAGCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3152 TGGATCTCACGGACAATGCCCTGGGTGACGGTGGGGTTGCTGCGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153993 TGGATCTCACGGACAATGCCCTGGGTGACGGTGGGGTTGCTGCGCTGTGC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3202 GAGGGACTGAAGCAAAAGAACAGTGTTCTGGCGAGACTCGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 154043 GAGGGACTGAAGCAAAAGAACAGTGTTCTGGCGAGACTCGGGTA...CAG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3243 GTTGAAGGCATGTGGACTGACTTCTGATTGCTGTGAGGCACTCTCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158515 GTTGAAGGCATGTGGACTGACTTCTGATTGCTGTGAGGCACTCTCCTTGG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3293 CCCTTTCCTGCAACCGGCATCTGACCAGTCTAAACCTGGTGCAGAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158565 CCCTTTCCTGCAACCGGCATCTGACCAGTCTAAACCTGGTGCAGAATAAC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3343 TTCAGTCCCAAAGGAATGATGAAGCTGTGTTCGGCCTTTGCCTGTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158615 TTCAGTCCCAAAGGAATGATGAAGCTGTGTTCGGCCTTTGCCTGTCCCAC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3393 GTCTAACTTACAGATAATTGG         GCTGTGGAAATGGCAGTACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 158665 GTCTAACTTACAGATAATTGGGTA...CAGGCTGTGGAAATGGCAGTACC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3434 CTGTGCAAATAAGGAAGCTGCTGGAGGAAGTGCAGCTACTCAAGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161691 CTGTGCAAATAAGGAAGCTGCTGGAGGAAGTGCAGCTACTCAAGCCCCGA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3484 GTCGTAATTGACGGTAGTTGGCATTCTTTTGATGAAGATGACCGGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161741 GTCGTAATTGACGGTAGTTGGCATTCTTTTGATGAAGATGACCGGTACTG

   3650     .    :
   3534 GTGGAAAAAC
        ||||||||||
 161791 GTGGAAAAAC