seq1 = pF1KB7305.tfa, 2430 bp
seq2 = pF1KB7305/gi568815597r_92413659.tfa (gi568815597r:92413659_92892394), 478736 bp

>pF1KB7305 2430
>gi568815597r:92413659_92892394 (Chr1)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-281  (155768-155997)   100% ->
282-471  (187651-187840)   100% ->
472-696  (188776-189000)   100% ->
697-771  (190180-190254)   100% ->
772-897  (194410-194535)   100% ->
898-1041  (196942-197085)   100% ->
1042-1131  (198007-198096)   100% ->
1132-1229  (198496-198593)   100% ->
1230-1290  (215177-215237)   100% ->
1291-1344  (226403-226456)   100% ->
1345-1479  (256059-256193)   100% ->
1480-1620  (266461-266601)   100% ->
1621-1779  (268061-268219)   100% ->
1780-1926  (284668-284814)   100% ->
1927-2022  (286993-287088)   100% ->
2023-2118  (328658-328753)   100% ->
2119-2430  (378425-378736)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTACCAACAAAATGACTGCTGCCTTTAGAAACCCTAGTGGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTACCAACAAAATGACTGCTGCCTTTAGAAACCCTAGTGGGAAACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GTGGCGACAGACAAAGTTGCAGAAAAGCTGAGCTCTACTC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTA...TAGGTGGCGACAGACAAAGTTGCAGAAAAGCTGAGCTCTACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTCATGGGTGAAGAACACAGTATCGCATACAGTCAGTCAGATGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155808 TCTCATGGGTGAAGAACACAGTATCGCATACAGTCAGTCAGATGGCCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGGTGGCAAGTCCATCTACTTCATTACATACCACATCCTCATCTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155858 CAGGTGGCAAGTCCATCTACTTCATTACATACCACATCCTCATCTACCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTATCAACACCAGCCCTTTCACCATCTTCCCCATCACAGTTGAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155908 ACTATCAACACCAGCCCTTTCACCATCTTCCCCATCACAGTTGAGTCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGACTTAGAACTCCTGGCTAAACTGGAAGAACAGAATAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 155958 ACGACTTAGAACTCCTGGCTAAACTGGAAGAACAGAATAGGTG...TAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGTTAGAAACGGATAGTAAGTCTTTAAGATCTGTAAATGGGTCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187652 TTGTTAGAAACGGATAGTAAGTCTTTAAGATCTGTAAATGGGTCAAGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAACAGTGGCTCTTCTCTTGTGTCGAGTTCATCAGCCTCTAGCAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187702 AAACAGTGGCTCTTCTCTTGTGTCGAGTTCATCAGCCTCTAGCAACCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCACCTTGAAGAAGATTCTTGGATTCTTTGGGGAAGAATTGTTAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187752 GTCACCTTGAAGAAGATTCTTGGATTCTTTGGGGAAGAATTGTTAATGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGGAAGATGTACGCAAAAAGAAGGAAAAGCAAGTTAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 187802 TGGGAAGATGTACGCAAAAAGAAGGAAAAGCAAGTTAAGGTA...TAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTTGTTCATAAAGGGATACCCCATCACTTTAGAGCAATAGTTTGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188778 ACTTGTTCATAAAGGGATACCCCATCACTTTAGAGCAATAGTTTGGCAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTTATGCAGTGCACAAAGTATGCCAATTAAGGATCAGTATTCAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188828 TTTTATGCAGTGCACAAAGTATGCCAATTAAGGATCAGTATTCAGAACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGAAAATGACCTCGCCTTGTGAAAAATTGATCCGAAGGGACATTGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188878 CTGAAAATGACCTCGCCTTGTGAAAAATTGATCCGAAGGGACATTGCTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AACTTACCCTGAACACAACTTTTTTAAGGAAAAAGATAGCCTTGGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188928 AACTTACCCTGAACACAACTTTTTTAAGGAAAAAGATAGCCTTGGACAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGTTTTATTTAATGTAATGAAG         GCTTACTCTTTAGTAGAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 188978 AGGTTTTATTTAATGTAATGAAGGTA...TAGGCTTACTCTTTAGTAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CGTGAGGTTGGTTACTGTCAAGGAAGTGCTTTTATAGTTGGATTGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190198 CGTGAGGTTGGTTACTGTCAAGGAAGTGCTTTTATAGTTGGATTGTTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATGCAG         ATGCCAGAAGAAGAAGCTTTCTGTGTATTTGTTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190248 TATGCAGGTA...TAGATGCCAGAAGAAGAAGCTTTCTGTGTATTTGTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AATTAATGCAAGATTATAGACTTCGTGAACTTTTTAAACCAAGTATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194444 AATTAATGCAAGATTATAGACTTCGTGAACTTTTTAAACCAAGTATGGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAATTGGGCCTTTGTATGTACCAGTTTGAATGTATGATACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 194494 GAATTGGGCCTTTGTATGTACCAGTTTGAATGTATGATACAGGTA...TA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    898  GAGCATCTTCCAGAGCTCTTTGTACATTTTCAATCTCAGAGTTTTCATA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196941 GGAGCATCTTCCAGAGCTCTTTGTACATTTTCAATCTCAGAGTTTTCATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCTCAATGTATGCATCATCCTGGTTTCTGACTATCTTTCTTACAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196991 CCTCAATGTATGCATCATCCTGGTTTCTGACTATCTTTCTTACAACTTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCACTACCAATTGCAACAAGGATATTTGATATCTTTATGTCTGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 197041 CCACTACCAATTGCAACAAGGATATTTGATATCTTTATGTCTGAGGTA..

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042     GGTTTAGAAATAGTGTTTCGTGTAGGATTAGCACTTCTTCAGATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197091 .CAGGGTTTAGAAATAGTGTTTCGTGTAGGATTAGCACTTCTTCAGATGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATCAGGCAGAACTGATGCAACTTGACATGGAAGGGATGTTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 198053 ATCAGGCAGAACTGATGCAACTTGACATGGAAGGGATGTTACAGGTA...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132    CACTTTCAAAAGGTCATTCCACATCAGTTTGATGGTGTCCCAGACAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198493 TAGCACTTTCAAAAGGTCATTCCACATCAGTTTGATGGTGTCCCAGACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCTAATCCAAGCAGCTTACCAAGTCAAATACAATTCAAAAAAAATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198543 GCTAATCCAAGCAGCTTACCAAGTCAAATACAATTCAAAAAAAATGAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 A         GCTTGAAAAGGAATACACTACAATAAAAACGAAAGAAATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198593 AGTA...TAGGCTTGAAAAGGAATACACTACAATAAAAACGAAAGAAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GAAGAGCAAGTTGAAATTAAA         AGGTTACGCACAGAAAATAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 215217 GAAGAGCAAGTTGAAATTAAAGTA...CAGAGGTTACGCACAGAAAATAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 ACTTTTAAAACAGCGCATCGAGACATTAGAAAAA         CATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 226423 ACTTTTAAAACAGCGCATCGAGACATTAGAAAAAGTA...TAGCATAAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GCAGTTCCAACTACAACGAAGATTTTGTGCTACAGCTAGAGAAGGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256066 GCAGTTCCAACTACAACGAAGATTTTGTGCTACAGCTAGAGAAGGAATTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTCCAAGCCCGACTGAGTGAAGCTGAGTCTCAGTGTGCATTAAAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256116 GTCCAAGCCCGACTGAGTGAAGCTGAGTCTCAGTGTGCATTAAAAGAGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCAGGATAAAGTCTTGGATATAGAGAAG         AGGAATAACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 256166 GCAGGATAAAGTCTTGGATATAGAGAAGGTA...TAGAGGAATAACTCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TTCCTGATGAGAATAATATTGCAAGGCTTCAGGAAGAACTCATTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266474 TTCCTGATGAGAATAATATTGCAAGGCTTCAGGAAGAACTCATTGCTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AAACTTAGAGAAGCAGAAGCCATTATGGGTTTGAAAGAACTTAGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266524 AAACTTAGAGAAGCAGAAGCCATTATGGGTTTGAAAGAACTTAGACAGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGTCAAGGATTTAGAGGAACACTGGCAG         CGCCACTTAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 266574 AGTCAAGGATTTAGAGGAACACTGGCAGGTA...TAGCGCCACTTAGCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 GTACTACTGGGAGATGGAAAGACCCACCCAAGAAAAATGCTATGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268074 GTACTACTGGGAGATGGAAAGACCCACCCAAGAAAAATGCTATGAATGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TTACAAGATGAACTGATGACCATTCGACTTAGAGAAGCTGAAACACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268124 TTACAAGATGAACTGATGACCATTCGACTTAGAGAAGCTGAAACACAAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AGAAATAAGAGAAATAAAACAAAGGATGATGGAAATGGAAACACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 268174 AGAAATAAGAGAAATAAAACAAAGGATGATGGAAATGGAAACACAGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1780      AACCAGATCAATAGTAACCATCTTCGAAGAGCAGAACAAGAGGTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268224 ..TAGAACCAGATCAATAGTAACCATCTTCGAAGAGCAGAACAAGAGGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 ATTAGCCTACAGGAGAAAGTGCAGTATCTTTCTGCACAGAACAAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284713 ATTAGCCTACAGGAGAAAGTGCAGTATCTTTCTGCACAGAACAAAGGACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CCTTACTCAATTAAGTGAAGCAAAGCGTAAACAAGCAGAGATTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284763 CCTTACTCAATTAAGTGAAGCAAAGCGTAAACAAGCAGAGATTGAATGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AG         AATAAGGAAGAAGTGATGGCTGTGAGGCTTCGGGAAGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284813 AGGTA...TAGAATAAGGAAGAAGTGATGGCTGTGAGGCTTCGGGAAGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GATAGCATAGCTGCTGTGGCTGAACTACGACAACACATTGCTGAGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287032 GATAGCATAGCTGCTGTGGCTGAACTACGACAACACATTGCTGAGCTTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 AATCCAG         AAAGAAGAAGGAAAGCTTCAAGGACAGCTTAACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287082 AATCCAGGTA...CAGAAAGAAGAAGGAAAGCTTCAAGGACAGCTTAACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 AGTCTGATTCTAACCAGTATATTGGGGAACTGAAAGATCAGATAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 328692 AGTCTGATTCTAACCAGTATATTGGGGAACTGAAAGATCAGATAGCAGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CTGAATCATGAG         CTCAGGTGCCTAAAAGGCCAGAGGGGCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 328742 CTGAATCATGAGGTA...CAGCTCAGGTGCCTAAAAGGCCAGAGGGGCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTCAGGCCAACCTCCTTTTGATGGAATCCACATTGTCAACCATTTAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378454 CTCAGGCCAACCTCCTTTTGATGGAATCCACATTGTCAACCATTTAATAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 GAGATGATGAATCATTCCATTCCTCCGATGAAGATTTTATAGATAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378504 GAGATGATGAATCATTCCATTCCTCCGATGAAGATTTTATAGATAATTCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TTACAGGAAACTGGTGTTGGTTTTCCTTTGCACGGAAAATCTGGTTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378554 TTACAGGAAACTGGTGTTGGTTTTCCTTTGCACGGAAAATCTGGTTCGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GTCTTTGGACCCCGCAGTGGCAGATGGTAGTGAGAGCGAAACAGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378604 GTCTTTGGACCCCGCAGTGGCAGATGGTAGTGAGAGCGAAACAGAAGACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GTGTGCTGGAGACCAGAGAGAGCAACCAAGTGGTTCAAAAGGAGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 378654 GTGTGCTGGAGACCAGAGAGAGCAACCAAGTGGTTCAAAAGGAGCGGCCC

   2550     .    :    .    :    .    :
   2398 CCGAGAAGAAGAGAGTCGTATTCAACCACTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 378704 CCGAGAAGAAGAGAGTCGTATTCAACCACTGTC