seq1 = pF1KB7301.tfa, 2553 bp
seq2 = pF1KB7301/gi568815578r_13614926.tfa (gi568815578r:13614926_13883140), 268215 bp

>pF1KB7301 2553
>gi568815578r:13614926_13883140 (Chr20)

(complement)

1-637  (100001-100637)   100% ->
638-1035  (106871-107268)   100% ->
1036-1149  (107871-107984)   100% ->
1150-1250  (110526-110626)   100% ->
1251-1403  (111658-111810)   100% ->
1404-1518  (113120-113234)   100% ->
1519-1666  (116217-116364)   100% ->
1667-1828  (123288-123449)   100% ->
1829-1950  (149299-149420)   100% ->
1951-2038  (154676-154763)   100% ->
2039-2115  (164157-164233)   100% ->
2116-2262  (165627-165773)   100% ->
2263-2553  (167974-168264)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCATCCAAACAAGAAATAATGAGTGACCAGCGGTTTAGACGGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCATCCAAACAAGAAATAATGAGTGACCAGCGGTTTAGACGGGTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGGACCCGAGATTTTGGGAAATGCCAGAAAAGGATCGAAAAGTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGGACCCGAGATTTTGGGAAATGCCAGAAAAGGATCGAAAAGTCAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGACAAGAGATTTCGAGCCATGTTTCATGACAAGAAGTTCAAGTTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGACAAGAGATTTCGAGCCATGTTTCATGACAAGAAGTTCAAGTTGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATGCCGTGGATAAAAGAGGGCGCCCCATTAGCCATAGCACTACAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATGCCGTGGATAAAAGAGGGCGCCCCATTAGCCATAGCACTACAGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTGAAGCGTTTTTACGACCTTTCAGATTCTGATTCCAATCTCTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTGAAGCGTTTTTACGACCTTTCAGATTCTGATTCCAATCTCTCTGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGATAGCAAAGCATTGAGTCAAAAGAAAATAAAGAAGAAAAAAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGATAGCAAAGCATTGAGTCAAAAGAAAATAAAGAAGAAAAAAACCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTAAAAAAGAAATCGATTCAAAAAATCTAGTTGAGAAAAAGAAAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTAAAAAAGAAATCGATTCAAAAAATCTAGTTGAGAAAAAGAAAGAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAGAAGGCTAATCACAAGGGTTCTGAAAATAAAACTGATTTAGATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAGAAGGCTAATCACAAGGGTTCTGAAAATAAAACTGATTTAGATAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTATAGGAATTAAAAAAATGAAAACCTCATGTAAATTTAAGATAGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTATAGGAATTAAAAAAATGAAAACCTCATGTAAATTTAAGATAGATTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACATAAGTCCGAAGAAGGATAGCAAAGAATTTACACAAAAAAATAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACATAAGTCCGAAGAAGGATAGCAAAGAATTTACACAAAAAAATAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAGAAAAAAAACATTGTTCAACATACTACAGACTCTTCTCTCGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAGAAAAAAAACATTGTTCAACATACTACAGACTCTTCTCTCGAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACAAAGGACATTAGACTCAGGCACCTCTGAAATTGTGAAATCTCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACAAAGGACATTAGACTCAGGCACCTCTGAAATTGTGAAATCTCCCAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCGAGTGTTCTAAGACAAGAAGAGAAATGCAATCAG         TGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100601 ATCGAGTGTTCTAAGACAAGAAGAGAAATGCAATCAGGTA...CAGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCAACTCATAATGACAAGAGACAGTGATGGTTATGAAAACTCAACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106875 TCAACTCATAATGACAAGAGACAGTGATGGTTATGAAAACTCAACAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GTGAAATGTGTGACAAAGATGCTCTGGAGGAAGATTCAGAAAGCGTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106925 GTGAAATGTGTGACAAAGATGCTCTGGAGGAAGATTCAGAAAGCGTTAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAAATAGGAAGTGATGAGGAATCTGAAAATGAAATTACAAGTGTTGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106975 GAAATAGGAAGTGATGAGGAATCTGAAAATGAAATTACAAGTGTTGGTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGCTTCAGGTGATGACGATGGAAGTGAAGATGATGAAGAGGAGGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107025 AGCTTCAGGTGATGACGATGGAAGTGAAGATGATGAAGAGGAGGATGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATGAAGAGGAGGATGAAGATGAGGATAGTGAGGATGATGATAAAAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107075 ATGAAGAGGAGGATGAAGATGAGGATAGTGAGGATGATGATAAAAGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGTGGCCCTGATCTTGCAAGGGGTAAAGGAAATATAGAAACTAGTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107125 AGTGGCCCTGATCTTGCAAGGGGTAAAGGAAATATAGAAACTAGTTCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AGATGAAGATGATACGGCAGATTTGTTTCCAGAAGAATCTGGTTTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107175 AGATGAAGATGATACGGCAGATTTGTTTCCAGAAGAATCTGGTTTTGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATGCTTGGAGAGAATTAGATAAAGATGCTCCTCGTGCTGATGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107225 ATGCTTGGAGAGAATTAGATAAAGATGCTCCTCGTGCTGATGAGGTA...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1036    ATTACACGTCGATTAGCAGTTTGTAACATGGACTGGGATAGATTAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107868 CAGATTACACGTCGATTAGCAGTTTGTAACATGGACTGGGATAGATTAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGCAAAAGATTTGCTGGCTCTGTTCAATTCATTTAAACCCAAAGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107918 GGCAAAAGATTTGCTGGCTCTGTTCAATTCATTTAAACCCAAAGGAGGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TAATATTTTCCGTCAAG         ATATATCCTTCAGAATTTGGAAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107968 TAATATTTTCCGTCAAGGTG...TAGATATATCCTTCAGAATTTGGAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGAGGATGAAGGAAGAGCAAGTTCAAGGACCAGTAGAGCTATTAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110550 GAGAGGATGAAGGAAGAGCAAGTTCAAGGACCAGTAGAGCTATTAAGTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TCCTGAAGATGCCCCAGAAAAAGACTG         GACGTCTAGAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 110600 TCCTGAAGATGCCCCAGAAAAAGACTGGTA...TAGGACGTCTAGAGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AATTGAGAGATTATCAATTCAAACGACTGAAGTACTATTATGCAGTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111672 AATTGAGAGATTATCAATTCAAACGACTGAAGTACTATTATGCAGTAGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GACTGTGATTCTCCGGAAACAGCTAGTAAAATTTATGAGGATTGTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111722 GACTGTGATTCTCCGGAAACAGCTAGTAAAATTTATGAGGATTGTGATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CCTGGAATTTGAAAGTAGTTGTTCTTTCATAGATCTAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111772 CCTGGAATTTGAAAGTAGTTGTTCTTTCATAGATCTAAGGTA...TAGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TTATACCAGATGATATTACTTTTGATGATGAGCCTAAGGATGTAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113122 TTATACCAGATGATATTACTTTTGATGATGAGCCTAAGGATGTAGCCTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GAAGTGAATTTAACAGCATATAAACCAAAATATTTCACTTCTGCTGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113172 GAAGTGAATTTAACAGCATATAAACCAAAATATTTCACTTCTGCTGCAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GGGAACATCAACG         GTGGAAATCACTTGGGATGAGACTGATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113222 GGGAACATCAACGGTA...AAGGTGGAAATCACTTGGGATGAGACTGATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ATGAAAGAATTACAATGCTCAACAGGAAGTTTAAAAAGGAAGAGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116245 ATGAAAGAATTACAATGCTCAACAGGAAGTTTAAAAAGGAAGAGCTTTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GACATGGATTTTCAAGCCTACTTAGCTTCCTCTAGTGAAGATGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116295 GACATGGATTTTCAAGCCTACTTAGCTTCCTCTAGTGAAGATGAAGAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GATAGAAGAGGAGCTACAAG         GTGATGATGGAGTCAATGTAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116345 GATAGAAGAGGAGCTACAAGGTA...TAGGTGATGATGGAGTCAATGTAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AAGAAGATGGGAAAACAAAGAAAAGTCAGAAGGATGATGAAGAACAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123309 AAGAAGATGGGAAAACAAAGAAAAGTCAGAAGGATGATGAAGAACAAATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GCTAAATACAGGCAGCTCTTGCAGGTTATTCAAGAAAAAGAAAAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123359 GCTAAATACAGGCAGCTCTTGCAGGTTATTCAAGAAAAAGAAAAGAAAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CAAAGAAAATGATATGGAAATGGAAATTAAATGGGTTCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 123409 CAAAGAAAATGATATGGAAATGGAAATTAAATGGGTTCCAGGTA...CAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 GTCTTAAAGAAAGTGCAGAAGAGATGGTCAAAAACAAATTGGAAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149299 GTCTTAAAGAAAGTGCAGAAGAGATGGTCAAAAACAAATTGGAAGGAAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GATAAACTGACCCCTTGGGAACAATTTTTAGAGAAGAAGAAAGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149349 GATAAACTGACCCCTTGGGAACAATTTTTAGAGAAGAAGAAAGAGAAAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 AAGACTGAAAAGGAAACAGAAG         GCTCTTGCTGAAGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 149399 AAGACTGAAAAGGAAACAGAAGGTA...AAGGCTCTTGCTGAAGAGGCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 GTGAAGAGGAACTTCCCTCTGATGTTGATTTGAATGACCCATACTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154695 GTGAAGAGGAACTTCCCTCTGATGTTGATTTGAATGACCCATACTTTGCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GAAGAAGTTAAACAAATAG         GTATAAATAAAAAATCGGTAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 154745 GAAGAAGTTAAACAAATAGGTA...CAGGTATAAATAAAAAATCGGTAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 ATCTGCAAAAGATGGCACATCTCCAGAAGAAGAAATTGAAATAGAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164179 ATCTGCAAAAGATGGCACATCTCCAGAAGAAGAAATTGAAATAGAAAGAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 AAAAG         GCTGAAATGGCTTTGCTTATGATGGATGAGGACGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164229 AAAAGGTA...CAGGCTGAAATGGCTTTGCTTATGATGGATGAGGACGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 GACAGTAAGAAACACTTCAATTACAACAAGATTGTGGAGCACCAGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165663 GACAGTAAGAAACACTTCAATTACAACAAGATTGTGGAGCACCAGAATCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 GAGCAAAAAGAAGAAAAAGCAGCTCATGAAAAAGAAGGAATTAATAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165713 GAGCAAAAAGAAGAAAAAGCAGCTCATGAAAAAGAAGGAATTAATAGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 ATGACTTTGAG         GTAAATGTTAACGATGCACGGTTTCAGGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 165763 ATGACTTTGAGGTA...CAGGTAAATGTTAACGATGCACGGTTTCAGGCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 ATGTACACTTCCCACTTGTTCAATTTGGACCCCTCAGATCCCAATTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168004 ATGTACACTTCCCACTTGTTCAATTTGGACCCCTCAGATCCCAATTTCAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 GAAAACAAAAGCTATGGAAAAAATCCTTGAGGAGAAGGCCCGGCAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168054 GAAAACAAAAGCTATGGAAAAAATCCTTGAGGAGAAGGCCCGGCAAAGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 AACGGAAAGAACAAGAACTTACTCAGGCAATAAAGAAAAAAGAGAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168104 AACGGAAAGAACAAGAACTTACTCAGGCAATAAAGAAAAAAGAGAGTGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 ATTGAAAAGGAATCACAAAGGAAGTCCATTGATCCTGCTTTGTCAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168154 ATTGAAAAGGAATCACAAAGGAAGTCCATTGATCCTGCTTTGTCAATGTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 GATTAAATCTATAAAAACCAAAACAGAGCAGTTTCAAGCAAGAAAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168204 GATTAAATCTATAAAAACCAAAACAGAGCAGTTTCAAGCAAGAAAAAAGC

   2650     .    :
   2543 AAAAAGTCAAA
        |||||||||||
 168254 AAAAAGTCAAA