seq1 = pF1KB7300.tfa, 2868 bp
seq2 = pF1KB7300/gi568815593r_157381629.tfa (gi568815593r:157381629_157675696), 294068 bp

>pF1KB7300 2868
>gi568815593r:157381629_157675696 (Chr5)

(complement)

1-98  (100001-100098)   100% ->
99-183  (104717-104802)   98% ->
184-254  (111254-111324)   100% ->
255-333  (137706-137784)   100% ->
334-410  (144814-144890)   100% ->
411-603  (155666-155858)   100% ->
604-669  (156809-156874)   100% ->
670-741  (162192-162263)   100% ->
742-908  (166230-166396)   100% ->
909-993  (168557-168641)   100% ->
994-1133  (169889-170028)   100% ->
1134-1311  (172717-172894)   100% ->
1312-1401  (176035-176124)   100% ->
1402-1597  (178608-178803)   100% ->
1598-1706  (180902-181010)   100% ->
1707-1911  (182520-182724)   100% ->
1912-1989  (183785-183862)   100% ->
1990-2098  (183974-184082)   100% ->
2099-2243  (185243-185387)   100% ->
2244-2328  (186511-186595)   100% ->
2329-2553  (187208-187432)   100% ->
2554-2868  (193754-194068)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGGGGGCGCAGGCGCCGCCCGGCTCTGCTTGCTGGCGTTTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGGGGGCGCAGGCGCCGCCCGGCTCTGCTTGCTGGCGTTTGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCCCCTCCGGCCGCGGGCGGCGCGGGAGCCTGGATGGACAAGTAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100051 GCAGCCCCTCCGGCCGCGGGCGGCGCGGGAGCCTGGATGGACAAGTAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99         AGGAAGTGAGGAAGGCAGCCCCAAGCTGCAGCATGAACTTAT
        >...>>>-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 G...CAGGAGGAAGTGAGGAAGGCAGCCCCAAGCTGCAGCATGAACTTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 CATACCTCAGTGGAAGACTTCAGAAAGCCCCGTGAGAGAAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104760 CATACCTCAGTGGAAGACTTCAGAAAGCCCCGTGAGAGAAAAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184   CATCCACTCAAAGCTGAGCTCAGGGTAATGGCTGAGGGGCGAGAACTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111252 AGCATCCACTCAAAGCTGAGCTCAGGGTAATGGCTGAGGGGCGAGAACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 ATCCTGGACCTGGAGAAGAATGA         GCAACTTTTTGCTCCTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 111302 ATCCTGGACCTGGAGAAGAATGAGTA...CAGGCAACTTTTTGCTCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    273 CTACACAGAAACCCATTATACTTCAAGTGGTAACCCTCAAACCACCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137724 CTACACAGAAACCCATTATACTTCAAGTGGTAACCCTCAAACCACCACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 GGAAATTGGAG         GATCACTGCTTTTACCACGGCACGGTGAGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 137774 GGAAATTGGAGGTG...TAGGATCACTGCTTTTACCACGGCACGGTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    364 GAGACAGAACTGTCCAGCGTCACGCTCAGCACTTGCCGAGGAATTAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 144844 GAGACAGAACTGTCCAGCGTCACGCTCAGCACTTGCCGAGGAATTAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    411       AGGACTGATTACGGTGAGCAGCAACCTCAGCTACGTCATCGAGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144894 ...CAGAGGACTGATTACGGTGAGCAGCAACCTCAGCTACGTCATCGAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    455 CCCTCCCTGACAGCAAGGGCCAACACCTTATTTACAGATCTGAACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155710 CCCTCCCTGACAGCAAGGGCCAACACCTTATTTACAGATCTGAACATCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    505 AAGCCGCCCCCGGGAAACTGTGGGTTCGAGCACTCCAAGCCCACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155760 AAGCCGCCCCCGGGAAACTGTGGGTTCGAGCACTCCAAGCCCACCACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    555 GGACTGGGCTCTTCAGTTTACACAACAGACCAAGAAGCGACCTCGCAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 155810 GGACTGGGCTCTTCAGTTTACACAACAGACCAAGAAGCGACCTCGCAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604         ATGAAAAGGGAAGATTTAAACTCCATGAAGTATGTGGAGCTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155860 TG...TAGATGAAAAGGGAAGATTTAAACTCCATGAAGTATGTGGAGCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    646 TACCTCGTGGCTGATTATTTAGAG         TTTCAGAAGAATCGACG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 156851 TACCTCGTGGCTGATTATTTAGAGGTA...TAGTTTCAGAAGAATCGACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    687 AGACCAGGACGCCACCAAACACAAGCTCATAGAGATCGCCAACTATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162209 AGACCAGGACGCCACCAAACACAAGCTCATAGAGATCGCCAACTATGTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    737 ATAAG         TTTTACCGATCCTTGAACATCCGGATTGCTCTCGTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162259 ATAAGGTG...CAGTTTTACCGATCCTTGAACATCCGGATTGCTCTCGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    778 GGCTTGGAAGTGTGGACCCACGGGAACATGTGTGAAGTTTCAGAGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166266 GGCTTGGAAGTGTGGACCCACGGGAACATGTGTGAAGTTTCAGAGAATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828 ATATTCTACCCTCTGGTCCTTTCTCAGTTGGAGGCGCAAGCTGCTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166316 ATATTCTACCCTCTGGTCCTTTCTCAGTTGGAGGCGCAAGCTGCTTGCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    878 AGAAGTACCATGACAACGCCCAATTAATCAC         GGGCATGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 166366 AGAAGTACCATGACAACGCCCAATTAATCACGTA...CAGGGGCATGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    919 TTCCACGGCACCACCATCGGCCTGGCCCCCCTCATGGCCATGTGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168567 TTCCACGGCACCACCATCGGCCTGGCCCCCCTCATGGCCATGTGCTCTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    969 GTACCAGTCTGGAGGAGTCAACATG         GACCACTCCGAGAATG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 168617 GTACCAGTCTGGAGGAGTCAACATGGTG...CAGGACCACTCCGAGAATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1010 CCATTGGCGTGGCTGCCACCATGGCCCACGAGATGGGCCACAACTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169905 CCATTGGCGTGGCTGCCACCATGGCCCACGAGATGGGCCACAACTTTGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1060 ATGACCCATGATTCTGCAGATTGCTGCTCGGCCAGTGCGGCTGATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169955 ATGACCCATGATTCTGCAGATTGCTGCTCGGCCAGTGCGGCTGATGGTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1110 GTGCATCATGGCAGCTGCCACTGG         GCACCCCTTTCCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 170005 GTGCATCATGGCAGCTGCCACTGGGTG...CAGGCACCCCTTTCCCAAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGTTCAATGGATGCAACAGGAGGGAGCTGGACAGGTATCTGCAGTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172734 TGTTCAATGGATGCAACAGGAGGGAGCTGGACAGGTATCTGCAGTCAGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGTGGAATGTGTCTCTCCAACATGCCAGACACCAGGATGTTGTATGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172784 GGTGGAATGTGTCTCTCCAACATGCCAGACACCAGGATGTTGTATGGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCGGAGGTGTGGGAACGGGTATCTGGAAGATGGGGAAGAGTGTGACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172834 CCGGAGGTGTGGGAACGGGTATCTGGAAGATGGGGAAGAGTGTGACTGTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GAGAAGAAGAG         GAATGTAACAACCCCTGCTGCAATGCCTCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 172884 GAGAAGAAGAGGTG...CAGGAATGTAACAACCCCTGCTGCAATGCCTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AATTGTACCCTGAGGCCGGGGGCGGAGTGTGCTCACGGCTCCTGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176065 AATTGTACCCTGAGGCCGGGGGCGGAGTGTGCTCACGGCTCCTGCTGCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CCAGTGTAAG         CTGTTGGCTCCTGGGACCCTGTGCCGCGAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 176115 CCAGTGTAAGGTA...CAGCTGTTGGCTCCTGGGACCCTGTGCCGCGAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AGGCCAGGCAGTGTGACCTCCCGGAGTTCTGTACGGGCAAGTCTCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178639 AGGCCAGGCAGTGTGACCTCCCGGAGTTCTGTACGGGCAAGTCTCCCCAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 TGCCCTACCAACTTCTACCAGATGGATGGTACCCCCTGTGAGGGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178689 TGCCCTACCAACTTCTACCAGATGGATGGTACCCCCTGTGAGGGCGGCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GGCCTACTGCTACAACGGCATGTGCCTCACCTACCAGGAGCAGTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178739 GGCCTACTGCTACAACGGCATGTGCCTCACCTACCAGGAGCAGTGCCAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 AGCTGTGGGGACCCG         GAGCCCGACCTGCCCCTGACCTCTGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 178789 AGCTGTGGGGACCCGGTA...CAGGAGCCCGACCTGCCCCTGACCTCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 TTCGAGAAGGTGAATGTGGCAGGAGACACCTTTGGAAACTGTGGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180928 TTCGAGAAGGTGAATGTGGCAGGAGACACCTTTGGAAACTGTGGAAAGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CATGAATGGTGAACACAGGAAGTGCAACATGAG         AGATGCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 180978 CATGAATGGTGAACACAGGAAGTGCAACATGAGGTG...CAGAGATGCGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 AGTGTGGGAAGATCCAGTGTCAGAGCTCTGAGGCCCGGCCCCTGGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182528 AGTGTGGGAAGATCCAGTGTCAGAGCTCTGAGGCCCGGCCCCTGGAGTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 AACGCGGTGCCCATTGACACCACTATCATCATGAATGGGAGGCAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182578 AACGCGGTGCCCATTGACACCACTATCATCATGAATGGGAGGCAGATCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 GTGCCGGGGCACCCACGTCTACCGAGGTCCTGAGGAGGAGGGTGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182628 GTGCCGGGGCACCCACGTCTACCGAGGTCCTGAGGAGGAGGGTGACATGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 TGGACCCAGGGCTGGTGATGACTGGAACCAAGTGTGGCTACAACCAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 182678 TGGACCCAGGGCTGGTGATGACTGGAACCAAGTGTGGCTACAACCATGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1912       ATTTGCTTTGAGGGGCAGTGCAGGAACACCTCCTTCTTTGAAAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182728 ...CAGATTTGCTTTGAGGGGCAGTGCAGGAACACCTCCTTCTTTGAAAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 TGAAGGCTGTGGGAAGAAGTGCAATGGCCATGGG         GTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 183829 TGAAGGCTGTGGGAAGAAGTGCAATGGCCATGGGGTG...CAGGTCTGTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 ACAACAACCAGAACTGCCACTGCCTGCCGGGCTGGGCCCCGCCCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183981 ACAACAACCAGAACTGCCACTGCCTGCCGGGCTGGGCCCCGCCCTTCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 AACACACCGGGCCACGGGGGCAGTATCGACAGTGGGCCTATGCCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184031 AACACACCGGGCCACGGGGGCAGTATCGACAGTGGGCCTATGCCCCCTGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 GA         GTGTGGGTCCTGTGGTAGCTGGAGTGTTGGTGGCCATCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184081 GAGTG...AAGGTGTGGGTCCTGTGGTAGCTGGAGTGTTGGTGGCCATCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 TGGTGCTGGCGGTCCTCATGCTGATGTACTACTGCTGCAGACAGAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185282 TGGTGCTGGCGGTCCTCATGCTGATGTACTACTGCTGCAGACAGAACAAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 AAACTAGGCCAACTCAAGCCCTCAGCTCTCCCTTCCAAGCTGAGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185332 AAACTAGGCCAACTCAAGCCCTCAGCTCTCCCTTCCAAGCTGAGGCAACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 GTTCAG         TTGTCCCTTCAGGGTTTCTCAGAACAGCGGGACTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185382 GTTCAGGTA...TAGTTGTCCCTTCAGGGTTTCTCAGAACAGCGGGACTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 GTCATGCCAACCCAACTTTCAAGCTGCAGACGCCCCAGGGCAAGCGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186546 GTCATGCCAACCCAACTTTCAAGCTGCAGACGCCCCAGGGCAAGCGAAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329          GTGATCAACACTCCGGAAATCCTGCGGAAGCCCTCCCAGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186596 GTA...CAGGTGATCAACACTCCGGAAATCCTGCGGAAGCCCTCCCAGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 TCCTCCCCGGCCCCCTCCAGATTATCTGCGTGGTGGGTCCCCACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187249 TCCTCCCCGGCCCCCTCCAGATTATCTGCGTGGTGGGTCCCCACCTGCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 CACTGCCAGCTCACCTGAGCAGGGCTGCTAGGAACTCCCCAGGGCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187299 CACTGCCAGCTCACCTGAGCAGGGCTGCTAGGAACTCCCCAGGGCCCGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 TCTCAAATAGAGAGGACGGAGTCGTCCAGGAGGCCTCCTCCAAGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187349 TCTCAAATAGAGAGGACGGAGTCGTCCAGGAGGCCTCCTCCAAGCCGGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 AATTCCCCCCGCACCAAATTGCATCGTTTCCCAG         GACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 187399 AATTCCCCCCGCACCAAATTGCATCGTTTCCCAGGTA...CAGGACTTCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2561 CCAGGCCTCGGCCGCCCCAGAAGGCACTCCCGGCAAACCCAGTGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193761 CCAGGCCTCGGCCGCCCCAGAAGGCACTCCCGGCAAACCCAGTGCCAGGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611 CGCAGGAGCCTCCCCAGGCCAGGAGGTGCATCCCCACTGCGGCCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193811 CGCAGGAGCCTCCCCAGGCCAGGAGGTGCATCCCCACTGCGGCCCCCTGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2661 TGCTGGCCCTCAGCAGTCCCGGCCTCTGGCAGCACTTGCCCCAAAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193861 TGCTGGCCCTCAGCAGTCCCGGCCTCTGGCAGCACTTGCCCCAAAGGTGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2711 GTCCACGGGAAGCCCTCAAGGTGAAAGCTGGTACCAGAGGGCTCCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193911 GTCCACGGGAAGCCCTCAAGGTGAAAGCTGGTACCAGAGGGCTCCAGGGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2761 GGCAGGTGTAGAGTTGAGAAAACAAAGCAATTCATGCTTCTTGTGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193961 GGCAGGTGTAGAGTTGAGAAAACAAAGCAATTCATGCTTCTTGTGGTCTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2811 GACTGAACTTCCAGAACAAAAGCCAAGGGCAAAACATTCATGTTTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194011 GACTGAACTTCCAGAACAAAAGCCAAGGGCAAAACATTCATGTTTCTTGG

   3050     .
   2861 TGCCCGCT
        ||||||||
 194061 TGCCCGCT