seq1 = pF1KB7263.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KB7263/gi568815587f_4898983.tfa (gi568815587f:4898983_5099927), 200945 bp

>pF1KB7263 945
>gi568815587f:4898983_5099927 (Chr11)

1-945  (100001-100945)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGACTGGAATAACAGTGATGCTGTGGAGCCCATATTTATCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGACTGGAATAACAGTGATGCTGTGGAGCCCATATTTATCCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTTTTCCTGGACTGGAGTATGTTCATTCTTGGCTCTCCATCCTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTTTTCCTGGACTGGAGTATGTTCATTCTTGGCTCTCCATCCTCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCTTGCATATTTGGTAGCATTTATGGGTAATGTTACCATCCTGTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCTTGCATATTTGGTAGCATTTATGGGTAATGTTACCATCCTGTCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTTGGATAGAATCCTCTCTCCATCAGCCCATGTATTACTTTATTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTTGGATAGAATCCTCTCTCCATCAGCCCATGTATTACTTTATTTCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTAGCAGTGAATGACCTGGGGATGTCCCTGTCTACACTTCCCACCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTAGCAGTGAATGACCTGGGGATGTCCCTGTCTACACTTCCCACCATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGCTGTGTTATGGTTGGATGCTCCAGAGATCCAGGCAAGTGCTTGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCTGTGTTATGGTTGGATGCTCCAGAGATCCAGGCAAGTGCTTGCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTCAGCTGTTCTTCATCCACACATTCACATTCCTGGAGTCCTCAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTCAGCTGTTCTTCATCCACACATTCACATTCCTGGAGTCCTCAGTGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGCCATGGCCTTTGACCGTTTTGTTGCTATCTGCCATCCACTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGCCATGGCCTTTGACCGTTTTGTTGCTATCTGCCATCCACTGCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCCACCATCCTCACCAACAGTGTAATTGGCAAAATTGGTTTGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCCACCATCCTCACCAACAGTGTAATTGGCAAAATTGGTTTGGCCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGCTACGAAGCTTGGGAGTTGTACTTCCCACACCTTTGCTACTGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGCTACGAAGCTTGGGAGTTGTACTTCCCACACCTTTGCTACTGAGACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTATCACTACTGCCATGGCAATGCCCTCTCTCACGCCTTCTGTTTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTATCACTACTGCCATGGCAATGCCCTCTCTCACGCCTTCTGTTTGCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGATGTTCTAAGATTATCCTGTACAGATGCCAGGACCAACAGTATTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGATGTTCTAAGATTATCCTGTACAGATGCCAGGACCAACAGTATTTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGCTTTGTGTAGTCATTGCCACACTAGGTGTGGATTCAATCTTCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGCTTTGTGTAGTCATTGCCACACTAGGTGTGGATTCAATCTTCATACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCTTTCTTATGTTCTGATTCTTAATACTGTGCTGGATATTGCATCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCTTTCTTATGTTCTGATTCTTAATACTGTGCTGGATATTGCATCTCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGAGCAGCTAAAGGCACTCAACACATGTGTATCCCATATCTGTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGAGCAGCTAAAGGCACTCAACACATGTGTATCCCATATCTGTGTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTATCTTCTTTGTGCCAGTTATTGGGGTGTCAATGGTCCATCGCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTATCTTCTTTGTGCCAGTTATTGGGGTGTCAATGGTCCATCGCTTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAGCATCTGTCTCCCATAGTCCACATCCTCATGGCAGACATCTACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAGCATCTGTCTCCCATAGTCCACATCCTCATGGCAGACATCTACCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTCTTCCCCCAGTCCTTAACCCTATTGTCTATAGTGTCAGAACAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTCTTCCCCCAGTCCTTAACCCTATTGTCTATAGTGTCAGAACAAAGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 ATTCGTCTAGGAATTCTCCACAAGTTTGTCCTAAGGAGGAGGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTCGTCTAGGAATTCTCCACAAGTTTGTCCTAAGGAGGAGGTTT