seq1 = pF1KB7259.tfa, 1758 bp
seq2 = pF1KB7259/gi568815575r_154578181.tfa (gi568815575r:154578181_154851025), 272845 bp

>pF1KB7259 1758
>gi568815575r:154578181_154851025 (ChrX)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-376  (134697-135000)   100% ->
377-593  (137603-137819)   100% ->
594-1066  (138325-138797)   100% ->
1067-1122  (150967-151022)   100% ->
1123-1342  (151513-151732)   100% ->
1343-1424  (153813-153894)   100% ->
1425-1527  (155007-155109)   100% ->
1528-1644  (170778-170894)   100% ->
1645-1758  (172732-172845)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGCGGGCGACGCAGTGTGCACCGGCTGGCTCGTTAAGTCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGCGGGCGACGCAGTGTGCACCGGCTGGCTCGTTAAGTCGCCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGAGGAAGCTACAGCGCTAC         GCCTGGCGCAAGCGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CGAGAGGAAGCTACAGCGCTACGTG...CAGGCCTGGCGCAAGCGCTGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGTCCTCCGGCGAGGCCGCATGAGCGGCAACCCCGATGTCTTGGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134716 TTGTCCTCCGGCGAGGCCGCATGAGCGGCAACCCCGATGTCTTGGAGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACAGGAACAAGCACTCCAGCAAGCCCATCCGGGTGATAGACCTCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134766 TACAGGAACAAGCACTCCAGCAAGCCCATCCGGGTGATAGACCTCAGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGTGCAGTGTGGAAGCATGTGGGCCCCAGCTTTGTTCGGAAGGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134816 GTGTGCAGTGTGGAAGCATGTGGGCCCCAGCTTTGTTCGGAAGGAATTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAATAATTTCGTGTTCATTGTCAAGACTACTTCCCGTACATTCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134866 AGAATAATTTCGTGTTCATTGTCAAGACTACTTCCCGTACATTCTACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGCCAAAACTGAGCAAGAAATGCAGGTGTGGGTGCACAGCATCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134916 GTGGCCAAAACTGAGCAAGAAATGCAGGTGTGGGTGCACAGCATCAGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTCTGCAACCTTGGCCACCTGGAGGATGGTGCAG         ATTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 134966 GGTCTGCAACCTTGGCCACCTGGAGGATGGTGCAGGTA...CAGATTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGAGAGCCTCTCTTACACGCCCTCCTCCCTGCAGCCATCCTCTGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137609 TGGAGAGCCTCTCTTACACGCCCTCCTCCCTGCAGCCATCCTCTGCCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCCTTCTTACCGCCCATGCTGCCAGCTCCTCTTTGCCAAGAGATGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137659 TCCCTTCTTACCGCCCATGCTGCCAGCTCCTCTTTGCCAAGAGATGACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAACACTAATGCCGTAGCCACTGAGGAAACCAGAAGTGAGTCAGAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137709 AAACACTAATGCCGTAGCCACTGAGGAAACCAGAAGTGAGTCAGAGCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCTTCCTTCCAGATTATCTGGTTTTGTCCAACTGCGAGACTGGAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137759 TCTTCCTTCCAGATTATCTGGTTTTGTCCAACTGCGAGACTGGAAGACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CACCATACCAG         TCTACCCACCAGATGTGATAGCTGGTCAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 137809 CACCATACCAGGTA...CAGTCTACCCACCAGATGTGATAGCTGGTCAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTCAGACCGTTCATTGGAACAGGCTTCATTTGATGATGTTTTTGTTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138355 CTCAGACCGTTCATTGGAACAGGCTTCATTTGATGATGTTTTTGTTGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCCTGCAGCCGCTCCCCTCCAGTCATTTGGTCCACCCCTCATGCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138405 GCCTGCAGCCGCTCCCCTCCAGTCATTTGGTCCACCCCTCATGCCATGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGTGGAGCTCAGGAGGTGCCATCCTCGAGGCCTCAGGCTGCCCTGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138455 AGTGGAGCTCAGGAGGTGCCATCCTCGAGGCCTCAGGCTGCCCTGATCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAGTAGAGAAATCAATGGGCCACCCAGGGACCACTTGTCTTCTTCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138505 GAGTAGAGAAATCAATGGGCCACCCAGGGACCACTTGTCTTCTTCACCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCTGGAAAGTTCCTTAAGTTCCACCATTCAGGTAGATAAAAATCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138555 TGCTGGAAAGTTCCTTAAGTTCCACCATTCAGGTAGATAAAAATCAAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCCTTACCCTGTGGAGCAAAAGAACTAGACATTATGTCCAACACTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138605 TCCTTACCCTGTGGAGCAAAAGAACTAGACATTATGTCCAACACTCCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCCCCGCCCCCCTAAGCCAAGCCATCTGTCTGAACGGCGCCAAGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138655 TCCCCGCCCCCCTAAGCCAAGCCATCTGTCTGAACGGCGCCAAGAGGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GGAGTACACACAGTGGTAGCAAGAAGCCAGAATGCACTCTGGTTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138705 GGAGTACACACAGTGGTAGCAAGAAGCCAGAATGCACTCTGGTTCCAAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGAATCTCCCTCTCTGGTTTAGACAACATGAGAACCTGGAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 138755 AGAATCTCCCTCTCTGGTTTAGACAACATGAGAACCTGGAAAGGTA...C

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1067   CTGATGTAGAAGGCCAATCCTTAAGACACCGAGACAAGCGGCTTAGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150965 AGCTGATGTAGAAGGCCAATCCTTAAGACACCGAGACAAGCGGCTTAGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGAATTTG         CCATGCAGGTTCTCCCCGATGTACCCCACAGCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 151015 TGAATTTGGTA...CAGCCATGCAGGTTCTCCCCGATGTACCCCACAGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TCAGCCAGTATCGAAGACAGCTATGTGCCCATGAGCCCCCAGGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151546 TCAGCCAGTATCGAAGACAGCTATGTGCCCATGAGCCCCCAGGCTGGTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CTCTGGTCTTGGACCCCACTGCAGCCCTGATGACTACATTCCAATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151596 CTCTGGTCTTGGACCCCACTGCAGCCCTGATGACTACATTCCAATGAACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CAGGAAGCATCTCAAGCCCGTTGCCTGAGCTGCCTGCAAACCTGGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151646 CAGGAAGCATCTCAAGCCCGTTGCCTGAGCTGCCTGCAAACCTGGAACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CCCCCAGTGAATAGAGATCTCAAGCCTCAGAGGAAAT         CACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 151696 CCCCCAGTGAATAGAGATCTCAAGCCTCAGAGGAAATGTA...TAGCACG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GCCACCTCCTCTGGACCTGAGAAACCTCTCGATCATCCGGGAACATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153817 GCCACCTCCTCTGGACCTGAGAAACCTCTCGATCATCCGGGAACATGCAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CTCTTACCAGGACCCGCACTGTGCCTTG         CAGTCGAACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 153867 CTCTTACCAGGACCCGCACTGTGCCTTGGTA...TAGCAGTCGAACCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTTCTCTCTCCAGAAAGAAATGGTATTAATTCTGCAAGATTTTTTGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155020 TTTCTCTCTCCAGAAAGAAATGGTATTAATTCTGCAAGATTTTTTGCTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TCCTGTTTCCAGAGAAGACGAAGAAAGCTACATCGAAATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 155070 TCCTGTTTCCAGAGAAGACGAAGAAAGCTACATCGAAATGGTA...TAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AGGAGCACCGAACAGCCAGTTCCCTGAGCAGTGGTGCCCTTACGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170779 AGGAGCACCGAACAGCCAGTTCCCTGAGCAGTGGTGCCCTTACGTGGACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AAGAAATTCAGCCTAGATTATTTGGCCCTGGACTTCAATTCAGCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170829 AAGAAATTCAGCCTAGATTATTTGGCCCTGGACTTCAATTCAGCATCACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 AGCCCCCATGCAGCAG         AAACTTCTCCTTTCAGAAGAACAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 170879 AGCCCCCATGCAGCAGGTA...CAGAAACTTCTCCTTTCAGAAGAACAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GAGTAGACTATGTCCAAGTGGATGAGCAGAAGACACAGGCTCTCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172757 GAGTAGACTATGTCCAAGTGGATGAGCAGAAGACACAGGCTCTCCAGAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .
   1720 ACAAAACAGGAGTGGACGGATGAAAGGCAATCCAAAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172807 ACAAAACAGGAGTGGACGGATGAAAGGCAATCCAAAGTA