seq1 = pF1KB7253.tfa, 1257 bp
seq2 = pF1KB7253/gi568815583r_55446026.tfa (gi568815583r:55446026_55688852), 242827 bp

>pF1KB7253 1257
>gi568815583r:55446026_55688852 (Chr15)

(complement)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-135  (139858-139943)   100% ->
136-1257  (141706-142827)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCGAGAACTCTCCAGCTCCCGCTTACAAAGTTTCCTCGCATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGCCCGCCGAGAACTCTCCAGCTCCCGCTTACAAAGTTTCCTCGCATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         GTGGTGATAGTGGACTGGATGGGTTAGGAGGACCAGGTGTAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...TAGGTGGTGATAGTGGACTGGATGGGTTAGGAGGACCAGGTGTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACTAGGAAGCCCAGATAAGAAAAAGCGCAAGGCAAATACACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 139900 AACTAGGAAGCCCAGATAAGAAAAAGCGCAAGGCAAATACACAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    GGACCTTCTTTCCCTCCATTGTCTGAGTATGCTCCACCACCGAATCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141703 CAGGGACCTTCTTTCCCTCCATTGTCTGAGTATGCTCCACCACCGAATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAACTCTGACCATCTAGTGGCTGCTAATCCATTTGATGACAACTATAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141753 AAACTCTGACCATCTAGTGGCTGCTAATCCATTTGATGACAACTATAATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTATTTCCTATAAACCACTACCTTCGTCAAATCCATATCTTGGCCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141803 CTATTTCCTATAAACCACTACCTTCGTCAAATCCATATCTTGGCCCTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATCCTGGCTTTGGAGGCTATAGTACATTCAGAATGCCACCTCACGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141853 TATCCTGGCTTTGGAGGCTATAGTACATTCAGAATGCCACCTCACGTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCAAGAATGTCTTCCCCATACTGTGGTCCTTACTCACTCAGGAACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141903 CCCAAGAATGTCTTCCCCATACTGTGGTCCTTACTCACTCAGGAACCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CACACCCATTTCCTCAGAATCCTCTGGGCATGGGTTTTAATCGACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141953 CACACCCATTTCCTCAGAATCCTCTGGGCATGGGTTTTAATCGACCTCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTTTTAACTTTGGGCCACATGATAATTCAAGTTTCGGTAATCCATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142003 GCTTTTAACTTTGGGCCACATGATAATTCAAGTTTCGGTAATCCATCTTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAATAATGCACTAAGTCAGAATGTCAACATGCCTAATCAACATTTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142053 TAATAATGCACTAAGTCAGAATGTCAACATGCCTAATCAACATTTTAGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAAATCCTGCTGAAAATTTCAGTCAAATTCCTCCACAGAATGCTAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142103 AAAATCCTGCTGAAAATTTCAGTCAAATTCCTCCACAGAATGCTAGCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTTTCTAACCCCGATTTGGCATCTAATTTTGTTCCTGGAAATAATTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142153 GTTTCTAACCCCGATTTGGCATCTAATTTTGTTCCTGGAAATAATTCAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTTTACTTCTCCGTTAGAATCTAATCATTCTTTTATTCCTCCCCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142203 TTTTACTTCTCCGTTAGAATCTAATCATTCTTTTATTCCTCCCCCAAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTTTTGGTCAAGCAAAAGCACCACCCCCAAAACAAGACTTTACTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142253 CTTTTGGTCAAGCAAAAGCACCACCCCCAAAACAAGACTTTACTCAAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCAACCAAAAACACTAATCAAAATTCCTCTGCTCATCCACCTCACTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142303 GCAACCAAAAACACTAATCAAAATTCCTCTGCTCATCCACCTCACTTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TATGGATGACACAGTGAATCAGAGTAATATTGAATTAAAAAATGTTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142353 TATGGATGACACAGTGAATCAGAGTAATATTGAATTAAAAAATGTTAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GAAACAATGCAGTAAATCAGGAGAACAGCCGTTCAAGTAGCACTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142403 GAAACAATGCAGTAAATCAGGAGAACAGCCGTTCAAGTAGCACTGAAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ACAAACAATAACCCTGCAAATGGGACGCAGAATAAGCCACGACAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142453 ACAAACAATAACCCTGCAAATGGGACGCAGAATAAGCCACGACAACCAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGGTGCAGCAGATGCCTGCACCACAGAAAAAAGCAATAAATCCTCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142503 AGGTGCAGCAGATGCCTGCACCACAGAAAAAAGCAATAAATCCTCTCTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACCCAAACCGTCATGGCCATTCGTCTTCTGACCCAGTGTATCCTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142553 ACCCAAACCGTCATGGCCATTCGTCTTCTGACCCAGTGTATCCTTGTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATTTGTACAAACGAGGTGAACGATGATCAGGATGCCATCTTATGTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142603 ATTTGTACAAACGAGGTGAACGATGATCAGGATGCCATCTTATGTGAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCTTGTCAGAAATGGTTTCATCGGATCTGTACTGGAATGACTGAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142653 CTCTTGTCAGAAATGGTTTCATCGGATCTGTACTGGAATGACTGAAACAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CTTATGGCCTCTTAACTGCAGAAGCATCTGCAGTATGGGGCTGTGATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142703 CTTATGGCCTCTTAACTGCAGAAGCATCTGCAGTATGGGGCTGTGATACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 TGTATGGCTGACAAAGATGTCCAGTTAATGCGTACTAGAGAAACTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142753 TGTATGGCTGACAAAGATGTCCAGTTAATGCGTACTAGAGAAACTTTTGG

   1250     .    :    .    :    .
   1233 TCCATCTGCAGTGGGCAGTGATGCT
        |||||||||||||||||||||||||
 142803 TCCATCTGCAGTGGGCAGTGATGCT