seq1 = pF1KB7247.tfa, 1788 bp
seq2 = pF1KB7247/gi568815581f_74835802.tfa (gi568815581f:74835802_75049413), 213612 bp

>pF1KB7247 1788
>gi568815581f:74835802_75049413 (Chr17)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-490  (105625-106008)   100% ->
491-627  (106100-106236)   100% ->
628-686  (107485-107543)   100% ->
687-805  (107805-107923)   100% ->
806-1620  (110860-111674)   100% ->
1621-1788  (113445-113612)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCGGAGCCCGAGCGGCGGCTGCGCAGTCCCGCTGGGGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGCGGAGCCCGAGCGGCGGCTGCGCAGTCCCGCTGGGGGAGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGCGGGCATCGGTCTCACCTGGACGGACGATCCGCTCAGCGCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGCGGGCATCGGTCTCACCTGGACGGACGATCCGCTCAGCGCCCGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGGTG         AAGCACAGGAGACTGAAGCAGCCCCGGAGAAGGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGGTGGTT...CAGAAGCACAGGAGACTGAAGCAGCCCCGGAGAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACCGAGTGGATGTGGGGGCCGAGGAGAGAGCGGCCGCCACCCGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105660 AACCGAGTGGATGTGGGGGCCGAGGAGAGAGCGGCCGCCACCCGGCCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGAAGTCCTGGCTGGTGAGGCATTTCTCTCTGCTGCTGCGGCGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105710 GCAGAAGTCCTGGCTGGTGAGGCATTTCTCTCTGCTGCTGCGGCGGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCAGGCCCAGAAGGCTGGACAACTCTTCTCGGGGCTCCTGGCCCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105760 GGCAGGCCCAGAAGGCTGGACAACTCTTCTCGGGGCTCCTGGCCCTGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGTGTTCCTGGGTGGCGCCTTCATCTGCAGCATGATCTTCAACAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105810 GTGGTGTTCCTGGGTGGCGCCTTCATCTGCAGCATGATCTTCAACAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCCGTCACTCTGGGTGACGTGTGGATCCTGCTGGCCACGCTGAAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105860 GGCCGTCACTCTGGGTGACGTGTGGATCCTGCTGGCCACGCTGAAGGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTCCCTGCTTTGGCTTCTCTACTATGTGGCAAGCACCACCCGCCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105910 TCTCCCTGCTTTGGCTTCTCTACTATGTGGCAAGCACCACCCGCCGACCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CACGCCGTGCTCTACCAAGATCCCCACGCGGGGCCCCTCTGGGTGCGGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105960 CACGCCGTGCTCTACCAAGATCCCCACGCGGGGCCCCTCTGGGTGCGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    491         GTTCCCTAGTGCTCTTCGGCAGCTGCACCTTCTGCCTCAACA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106010 TG...CAGGTTCCCTAGTGCTCTTCGGCAGCTGCACCTTCTGCCTCAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCTTCCGAGTGGGCTACGATGTGAGCCACATCCGCTGCAAGTCACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106142 TCTTCCGAGTGGGCTACGATGTGAGCCACATCCGCTGCAAGTCACAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACCTTGTCTTCTCTGTCATCGAGATGGTCTTCATCGGCGTCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 106192 GACCTTGTCTTCTCTGTCATCGAGATGGTCTTCATCGGCGTCCAGGTG..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    628     ACCTGGGTGCTCTGGAAACACTGCAAAGACTGTGTTCGGGTCCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106242 .CAGACCTGGGTGCTCTGGAAACACTGCAAAGACTGTGTTCGGGTCCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCAACTTCACTAG         GTGTGGCCTGATGCTGACCCTGGCCACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107531 CCAACTTCACTAGGTA...CAGGTGTGGCCTGATGCTGACCCTGGCCACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AACCTGCTGCTGTGGGTTCTGGCCGTTACCAATGACTCCATGCACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107833 AACCTGCTGCTGTGGGTTCTGGCCGTTACCAATGACTCCATGCACCGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GATCGAAGCTGAGCTTGGCATCCTCATGGAAAAATCCACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107883 GATCGAAGCTGAGCTTGGCATCCTCATGGAAAAATCCACAGGTA...CAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCAATGAGACCAACACCTGTCTGTGCCTCAATGCCACCGCGTGTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110860 GCAATGAGACCAACACCTGTCTGTGCCTCAATGCCACCGCGTGTGAAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCCGGAGAGGCTTCCTGATGCTCTACCCCTTCAGCACTGAGTACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110910 TTCCGGAGAGGCTTCCTGATGCTCTACCCCTTCAGCACTGAGTACTGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CATCTGCTGTGCTGTGCTGTTTGTCATGTGGAAGAACGTGGGCCGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110960 CATCTGCTGTGCTGTGCTGTTTGTCATGTGGAAGAACGTGGGCCGCCACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGCACCCCACATGGGTGCCCACCCTGCCACCGCACCCTTCCACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111010 TGGCACCCCACATGGGTGCCCACCCTGCCACCGCACCCTTCCACCTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GGGGCCATCTTCGGGCCGCTGCTGGGCCTGCTGGTGCTGCTGGCAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111060 GGGGCCATCTTCGGGCCGCTGCTGGGCCTGCTGGTGCTGCTGGCAGGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTGCGTCTTTGTGCTCTTCCAAATCGAGGCCAGTGGCCCTGCCATTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111110 GTGCGTCTTTGTGCTCTTCCAAATCGAGGCCAGTGGCCCTGCCATTGCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GCCAGTACTTCACCCTCTACTATGCCTTCTATGTGGCTGTGCTGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111160 GCCAGTACTTCACCCTCTACTATGCCTTCTATGTGGCTGTGCTGCCCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 ATGAGTCTGGCGTGCCTGGCGGGCACAGCCATACACGGGCTGGAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111210 ATGAGTCTGGCGTGCCTGGCGGGCACAGCCATACACGGGCTGGAGGAGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AGAGCTGGACACGGTCAAGAACCCTACCCGCAGCCTGGATGTGGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111260 AGAGCTGGACACGGTCAAGAACCCTACCCGCAGCCTGGATGTGGTGCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TAATGGGTGCTGCACTGGGCCAGATGGGCATCGCCTATTTCTCCATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111310 TAATGGGTGCTGCACTGGGCCAGATGGGCATCGCCTATTTCTCCATCGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GCCATTGTGGCCAAGCGCCCGCATGAGCTGCTCAACCGCCTCATCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111360 GCCATTGTGGCCAAGCGCCCGCATGAGCTGCTCAACCGCCTCATCCTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CTACTCGCTGCTGCTCATCCTGCAGCACATCGCTCAGAACCTCTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111410 CTACTCGCTGCTGCTCATCCTGCAGCACATCGCTCAGAACCTCTTCATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCGAGGGCCTGCACCGGCGCCCACTCTGGGAGACAGTTCCCGAGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111460 TCGAGGGCCTGCACCGGCGCCCACTCTGGGAGACAGTTCCCGAGGGCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GCAGGAAAGCAGGAGGCTGAGCCTCCCCGCAGAGGCTCCTTGCTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111510 GCAGGAAAGCAGGAGGCTGAGCCTCCCCGCAGAGGCTCCTTGCTGGAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GGGCCAGGGCCTGCAGCGGGCCTCACTGGCCTACATCCACTCCTACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111560 GGGCCAGGGCCTGCAGCGGGCCTCACTGGCCTACATCCACTCCTACAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 ACCTCAACTGGAAGCGGAGGGCACTCAAGGAGATCTCACTCTTCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111610 ACCTCAACTGGAAGCGGAGGGCACTCAAGGAGATCTCACTCTTCCTCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CTCTGCAATATCACA         CTGTGGATGATGCCTGCATTTGGCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111660 CTCTGCAATATCACAGTA...CAGCTGTGGATGATGCCTGCATTTGGCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 ACACCCGGAGTTTGAGAACGGGCTAGAAAAGGATTTCTACGGCTACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113471 ACACCCGGAGTTTGAGAACGGGCTAGAAAAGGATTTCTACGGCTACCAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TATGGTTCGCCATCGTCAACTTCGGCCTGCCTCTGGGGGTCTTCTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113521 TATGGTTCGCCATCGTCAACTTCGGCCTGCCTCTGGGGGTCTTCTACCGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 ATGCACTCTGTGGGAGGCCTGGTGGAGGTCTACCTGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113571 ATGCACTCTGTGGGAGGCCTGGTGGAGGTCTACCTGGGGGCC