seq1 = pF1KB7240.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB7240/gi568815587f_124149676.tfa (gi568815587f:124149676_124350608), 200933 bp

>pF1KB7240 933
>gi568815587f:124149676_124350608 (Chr11)

1-933  (100001-100933)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGGAGAAAATAATTCCTCAGTGACTGAGTTCATTCTGGCTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGGAGAAAATAATTCCTCAGTGACTGAGTTCATTCTGGCTGGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGAACAGCCAGAGCTCCAGCTGCCCCTCTTCCTCCTGTTCTTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGAACAGCCAGAGCTCCAGCTGCCCCTCTTCCTCCTGTTCTTAGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGTGGTCACAGTGGTGGGCAACCTGGGCATGACCACACTGATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGTGGTCACAGTGGTGGGCAACCTGGGCATGACCACACTGATTTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAGTTCTCACCTGCACACCCCTATGTACTATTTCCTCAGCAGTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCAGTTCTCACCTGCACACCCCTATGTACTATTTCCTCAGCAGTCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCATTGACTTCTGCCATTCCACTGTCATTACCCCTAAGATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCATTGACTTCTGCCATTCCACTGTCATTACCCCTAAGATGCTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTTGTGACAGAGAAGAACATCATCTCCTACCCTGAATGCATGACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTTGTGACAGAGAAGAACATCATCTCCTACCCTGAATGCATGACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTACTTCTTCCTCGTTTTTGCTATTGCAGAGTGTCACATGTTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTACTTCTTCCTCGTTTTTGCTATTGCAGAGTGTCACATGTTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCGTATGACCGTTACATGGCCATCTGTAGCCCCTTGCTGTACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCGTATGACCGTTACATGGCCATCTGTAGCCCCTTGCTGTACAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATATCCAATAAGGCTTGCTTTTCTCTGATTTTAGGGGTGTATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATATCCAATAAGGCTTGCTTTTCTCTGATTTTAGGGGTGTATATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATAGGCCTGGTTTGTGCATCAGTTCATACAGGCTGTATGTTTAGGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATAGGCCTGGTTTGTGCATCAGTTCATACAGGCTGTATGTTTAGGGTTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTCTGCAAATTTGATTTGATTAACCATTATTTCTGTGATCTTCTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTCTGCAAATTTGATTTGATTAACCATTATTTCTGTGATCTTCTTCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTAAAGCTCTCTTGCTCTAGTATCTATGTCAACAAACTACTTATTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTAAAGCTCTCTTGCTCTAGTATCTATGTCAACAAACTACTTATTCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGTGTTGGTGCATTTAACATCCTTGTCCCCAGCCTGACCATCCTTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGTGTTGGTGCATTTAACATCCTTGTCCCCAGCCTGACCATCCTTTGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACATCTTTATTATTGCCAGCATCCTCCACATTCGCTCCACTGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACATCTTTATTATTGCCAGCATCCTCCACATTCGCTCCACTGAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTCCAAAGCCTTCAGCACTTGTAGCTCCCACATGTTGGCGGTTGTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTCCAAAGCCTTCAGCACTTGTAGCTCCCACATGTTGGCGGTTGTAATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTTTTGGATCTGCAGCATTCATGTACTTGCAGCCATCTTCAATCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTTTTGGATCTGCAGCATTCATGTACTTGCAGCCATCTTCAATCAGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGGACCAGGGGAAAGTATCCTCTGTGTTTTATACTATTATTGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGGACCAGGGGAAAGTATCCTCTGTGTTTTATACTATTATTGTGCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTGAACCCTCTGATTTATAGCCTGAGGAATAAAGATGTCCATGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTGAACCCTCTGATTTATAGCCTGAGGAATAAAGATGTCCATGTTTCC

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CTGAAGAAAATGCTACAGAGAAGAACATTATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAAGAAAATGCTACAGAGAAGAACATTATTG