seq1 = pF1KB7230.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KB7230/gi568815592r_132517153.tfa (gi568815592r:132517153_132724275), 207123 bp

>pF1KB7230 1053
>gi568815592r:132517153_132724275 (Chr6)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-1053  (106131-107123)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGTCTCATCAGAGCAACATGAACTTTCACATTTCAAAAGAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGTCTCATCAGAGCAACATGAACTTTCACATTTCAAAAGAACACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAAAAAAG         GAAAAATTCAATTGCTCTGAATATGGAAATA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAAAAAAGGTA...AAGGAAAAATTCAATTGCTCTGAATATGGAAATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GATCTTGCCCAGAAAATGAAAGATCTCTGGGTGTCCGAGTGGCTATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106162 GATCTTGCCCAGAAAATGAAAGATCTCTGGGTGTCCGAGTGGCTATGTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCATTTATGGCAGGATCCATATTCATCACAATATTTGGCAATCTTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106212 TCATTTATGGCAGGATCCATATTCATCACAATATTTGGCAATCTTGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATAATTTCCATTTCCTACTTCAAGCAGCTTCACACACCAACCAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106262 GATAATTTCCATTTCCTACTTCAAGCAGCTTCACACACCAACCAACTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCATCCTCTCCATGGCCATCACTGATTTCCTCCTGGGATTCACCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106312 TCATCCTCTCCATGGCCATCACTGATTTCCTCCTGGGATTCACCATCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCATATAGTATGATCAGATCGGTGGAGAACTGCTGGTATTTTGGGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106362 CCATATAGTATGATCAGATCGGTGGAGAACTGCTGGTATTTTGGGCTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATTTTGCAAGATTTATTATAGTTTTGACCTGATGCTTAGCATAACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106412 ATTTTGCAAGATTTATTATAGTTTTGACCTGATGCTTAGCATAACATCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTTTCATCTTTGCTCAGTGGCCATTGATAGATTTTATGCTATATGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106462 TTTTTCATCTTTGCTCAGTGGCCATTGATAGATTTTATGCTATATGTTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCATTACTTTATTCCACCAAAATAACTATTCCAGTCATTAAAAGATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106512 CCATTACTTTATTCCACCAAAATAACTATTCCAGTCATTAAAAGATTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACTTCTATGTTGGTCGGTCCCTGGAGCATTTGCCTTCGGGGTGGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106562 ACTTCTATGTTGGTCGGTCCCTGGAGCATTTGCCTTCGGGGTGGTCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGAGGCCTATGCAGATGGAATAGAGGGCTATGACATCTTGGTTGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106612 CAGAGGCCTATGCAGATGGAATAGAGGGCTATGACATCTTGGTTGCTTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCCAGTTCCTGCCCAGTGATGTTCAACAAGCTATGGGGGACCACCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106662 TCCAGTTCCTGCCCAGTGATGTTCAACAAGCTATGGGGGACCACCTTGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TATGGCAGGTTTCTTCACTCCTGGGTCTATGATGGTGGGGATTTATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106712 TATGGCAGGTTTCTTCACTCCTGGGTCTATGATGGTGGGGATTTATGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AAATTTTTGCAGTATCCAGAAAACATGCTCATGCCATCAATAACTTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106762 AAATTTTTGCAGTATCCAGAAAACATGCTCATGCCATCAATAACTTGCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAAAATCAAAATAATCAAGTGAAGAAAGACAAAAAAGCTGCCAAAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106812 GAAAATCAAAATAATCAAGTGAAGAAAGACAAAAAAGCTGCCAAAACTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGGAATAGTGATAGGAGTTTTCTTATTATGTTGGTTTCCTTGTTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106862 AGGAATAGTGATAGGAGTTTTCTTATTATGTTGGTTTCCTTGTTTCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CAATTTTATTGGATCCCTTTTTGAACTTCTCTACTCCTGTAGTTTTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106912 CAATTTTATTGGATCCCTTTTTGAACTTCTCTACTCCTGTAGTTTTGTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GATGCCTTGACATGGTTTGGCTATTTTAACTCCACATGTAATCCGTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106962 GATGCCTTGACATGGTTTGGCTATTTTAACTCCACATGTAATCCGTTAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ATATGGTTTCTTCTATCCCTGGTTTCGCAGAGCACTGAAGTACATTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107012 ATATGGTTTCTTCTATCCCTGGTTTCGCAGAGCACTGAAGTACATTTTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TAGGTAAAATTTTCAGCTCATGTTTCCATAATACTATTTTGTGTATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107062 TAGGTAAAATTTTCAGCTCATGTTTCCATAATACTATTTTGTGTATGCAA

   1050     .    :
   1042 AAAGAAAGTGAG
        ||||||||||||
 107112 AAAGAAAGTGAG