seq1 = pF1KB7227.tfa, 660 bp
seq2 = pF1KB7227/gi568815580r_54224695.tfa (gi568815580r:54224695_54454573), 229879 bp

>pF1KB7227 660
>gi568815580r:54224695_54454573 (Chr18)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-140  (100471-100520)   100% ->
141-267  (117323-117449)   100% ->
268-385  (122715-122832)   100% ->
386-479  (125134-125227)   100% ->
480-660  (129699-129879)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTTCAAGGCAATTGCCCAACAAACTGCCCAAGAAGTTTTAGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTTCAAGGCAATTGCCCAACAAACTGCCCAAGAAGTTTTAGGTTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATCGAGATACATCAGGCTGGAAAGTGGTTAAAACTTCA         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 TAATCGAGATACATCAGGCTGGAAAGTGGTTAAAACTTCAGTA...GAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAAGATAACTGTTTCCAGTAAGGCTTCTAGAAAATTCCATGGAAATCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100472 AAAAGATAACTGTTTCCAGTAAGGCTTCTAGAAAATTCCATGGAAATCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141         ATATCGTGTTGAAGGGATAATTCCAGAATCACCAGCTAAACT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100522 TG...TAGATATCGTGTTGAAGGGATAATTCCAGAATCACCAGCTAAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATCTGATTTCCTCTACCAAACTGGAGACAGAATTACATGGGATAAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117365 ATCTGATTTCCTCTACCAAACTGGAGACAGAATTACATGGGATAAATCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCAAGTGTATAATATGGTACACAGGATTGATTCG         GACACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 117415 TGCAAGTGTATAATATGGTACACAGGATTGATTCGGTA...CAGGACACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTCATATGTCATACCATTACACAAAGTTTTGCCGTGGGCTCCATTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122721 TTCATATGTCATACCATTACACAAAGTTTTGCCGTGGGCTCCATTTCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGAGACTTTATCGACTTAGTGTACATCAAGCGCTACGAAGGAAATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122771 TCGAGACTTTATCGACTTAGTGTACATCAAGCGCTACGAAGGAAATATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATTATCAGTT         CTAAAAGTGTGGATTTTCCAGAATATCCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 122821 ACATTATCAGTTGTA...TAGCTAAAAGTGTGGATTTTCCAGAATATCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCATCTTCAAATTATATCCGCGGTTATAACCATCCTTGTGGCTTTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125163 CCATCTTCAAATTATATCCGCGGTTATAACCATCCTTGTGGCTTTGTATG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTCACCAATGGAAGA         AAACCCAGCATATTCCAAACTAGTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 125213 TTCACCAATGGAAGAGTA...CAGAAACCCAGCATATTCCAAACTAGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGTTTGTCCAGACAGAAATGAGAGGAAAATTGTCCCCATCAATAATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129725 TGTTTGTCCAGACAGAAATGAGAGGAAAATTGTCCCCATCAATAATTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAAACCATGCCTTCCAACTTAGTAAACTTCATCCTCAATGCAAAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129775 AAAACCATGCCTTCCAACTTAGTAAACTTCATCCTCAATGCAAAAGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AATAAAGGCACACAGAACTCCATCAAGACGTGGATTTCATCATAATAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129825 AATAAAGGCACACAGAACTCCATCAAGACGTGGATTTCATCATAATAGTC

    700     .
    656 ATTCA
        |||||
 129875 ATTCA