seq1 = pF1KB7222.tfa, 1365 bp
seq2 = pF1KB7222/gi568815581r_41377059.tfa (gi568815581r:41377059_41581097), 204039 bp

>pF1KB7222 1365
>gi568815581r:41377059_41581097 (Chr17)

(complement)

1-471  (100001-100471)   100% ->
472-554  (101317-101399)   100% ->
555-711  (101595-101751)   100% ->
712-873  (102103-102264)   100% ->
874-999  (102612-102737)   100% ->
1000-1220  (103360-103580)   100% ->
1221-1365  (103895-104039)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCAAATGCCTCAAGGCCGGCTTCTCTTCTGGGTCTCTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCAAATGCCTCAAGGCCGGCTTCTCTTCTGGGTCTCTCAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAGGAGGGGCCAGTGGGGGCTCCACTCGTGTGTCCGCAATGTACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCAGGAGGGGCCAGTGGGGGCTCCACTCGTGTGTCCGCAATGTACTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCTCTTGCAAGCTTCCAAGTCTCTCCCCTGTGGCCAGAAGTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGCTCTTGCAAGCTTCCAAGTCTCTCCCCTGTGGCCAGAAGTTTCTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTGCTCAGTGGGTCTGGGCAGAAGCAGCTACAGGGCCACCAGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTGCTCAGTGGGTCTGGGCAGAAGCAGCTACAGGGCCACCAGCTGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTGCTCTCTGCCTCCCTGCTGGAGGCTTCGCTACCAGCTACAGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTGCTCTCTGCCTCCCTGCTGGAGGCTTCGCTACCAGCTACAGTGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGGGGGCTGGTTTGGGGAGGGCATCCTCACTGGCAATGAGAAGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGGGGGCTGGTTTGGGGAGGGCATCCTCACTGGCAATGAGAAGGAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCAATCCCTGAACGACCGCCTGGCCGGCTACCTGGAGAAGGTGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGCAATCCCTGAACGACCGCCTGGCCGGCTACCTGGAGAAGGTGCGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGAGCAGGAGAACGCCAGCCTGGAGAGCCGCATCCGTGAGTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGAGCAGGAGAACGCCAGCCTGGAGAGCCGCATCCGTGAGTGGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCAGCAGGTCCCCTACATGTGCCCTGACTACCAGTCCTACTTCCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCAGCAGGTCCCCTACATGTGCCCTGACTACCAGTCCTACTTCCGGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCGAGGAGCTCCAGAAGAAG         ACTCTATGCAGCAAGGCTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100451 ATCGAGGAGCTCCAGAAGAAGGTA...CAGACTCTATGCAGCAAGGCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAATGCCAGGCTGGTGGTGGAGATTGACAATGCCAAATTGGCTGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101337 GAATGCCAGGCTGGTGGTGGAGATTGACAATGCCAAATTGGCTGCAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTTCAGGACCAA         GTATGAGACGGAGGTGTCCCTGCGGCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101387 ACTTCAGGACCAAGTG...CAGGTATGAGACGGAGGTGTCCCTGCGGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGTGGAGTCAGACATCAACGGCCTGCGCAGGATCCTGGATGACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101623 CTGGTGGAGTCAGACATCAACGGCCTGCGCAGGATCCTGGATGACCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTGTGCAAGTCTGACCTGGAGGCCCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101673 CCTGTGCAAGTCTGACCTGGAGGCCCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGCTCTGCCTGAAGAAGAACCATGAGGAG         GAAGTGAACTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101723 TGCTCTGCCTGAAGAAGAACCATGAGGAGGTG...TAGGAAGTGAACTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGCGCTGCCAACTTGGTGACCGCCTCAATGTTGAGGTGGACGCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102115 CTGCGCTGCCAACTTGGTGACCGCCTCAATGTTGAGGTGGACGCTGCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACCTGTTGACCTGAACCGAGTTCTGGAGGAGATGAGGTGCCAGTATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 ACCTGTTGACCTGAACCGAGTTCTGGAGGAGATGAGGTGCCAGTATGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCCTGGTGGAGAATAACCGCCGGGATGCTGAAGACTGGTTGGACACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102215 CCCTGGTGGAGAATAACCGCCGGGATGCTGAAGACTGGTTGGACACCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874          AGTGAGGAGCTGAACCAGCAGGTGGTGTCCAGCTCAGAGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 GTA...CAGAGTGAGGAGCTGAACCAGCAGGTGGTGTCCAGCTCAGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTTGCAGTCCTGCCAGGCAGAGATCATCGAGCTGAGACGCACGGTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102653 GTTGCAGTCCTGCCAGGCAGAGATCATCGAGCTGAGACGCACGGTCAACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCCTGGAGATTGAGCTGCAGGCTCAGCACAGCATG         AGAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102703 CCCTGGAGATTGAGCTGCAGGCTCAGCACAGCATGGTG...CAGAGAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GCTTTGGAATCCACCCTGGCAGAGACGGAGGCCCGCTATAGCTCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103366 GCTTTGGAATCCACCCTGGCAGAGACGGAGGCCCGCTATAGCTCCCAGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGCCCAGATGCAGTGCATGATCACCAACGTGGAGGCCCAGCTGGCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103416 GGCCCAGATGCAGTGCATGATCACCAACGTGGAGGCCCAGCTGGCCGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TCCGGGCTGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGCTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103466 TCCGGGCTGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGCTGCTGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTCCGGGCCCGGCTGGAGTGTGAGATCAACACGTACCGGGGCCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103516 GTCCGGGCCCGGCTGGAGTGTGAGATCAACACGTACCGGGGCCTGCTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GAGTGAGGACAGCAA         GCTCCCCTGTAACCCATGTGCACCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103566 GAGTGAGGACAGCAAGTG...TAGGCTCCCCTGTAACCCATGTGCACCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACTACTCACCCTCCAAGTCATGCCTTCCCTGTCTTCCTGCGGCCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103921 ACTACTCACCCTCCAAGTCATGCCTTCCCTGTCTTCCTGCGGCCTCCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GGTCCTAGTGCAGCCCGCACAAACTGCAGCCCCCGCCCCATTTGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103971 GGTCCTAGTGCAGCCCGCACAAACTGCAGCCCCCGCCCCATTTGTGTGCC

   1400     .    :    .
   1347 CTGCCCAGGGGGTCGGTTC
        |||||||||||||||||||
 104021 CTGCCCAGGGGGTCGGTTC