seq1 = pF1KB7216.tfa, 447 bp
seq2 = pF1KB7216/gi568815595r_128473283.tfa (gi568815595r:128473283_128673729), 200447 bp

>pF1KB7216 447
>gi568815595r:128473283_128673729 (Chr3)

(complement)

1-447  (100001-100447)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAAGCGCTCCATCAGATAGTGGTCCGCTGCAGTGAGCTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAAGCGCTCCATCAGATAGTGGTCCGCTGCAGTGAGCTGGTTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCACGAGCCTGCCTAGACTCAGCGTCTCCCGCCTCCAGGGACCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCACGAGCCTGCCTAGACTCAGCGTCTCCCGCCTCCAGGGACCCCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCTCAGCCCCTAGGCACCCTGGGCCAGGGTGGTTGGAAGCTTCTAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCTCAGCCCCTAGGCACCCTGGGCCAGGGTGGTTGGAAGCTTCTAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGTGGGGTCTCTGGCACCAGAGACACTCGGGGGTCTGGGGACCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGTGGGGTCTCTGGCACCAGAGACACTCGGGGGTCTGGGGACCGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGCCCTGTACCCACCCACTACCATTTGACATGGTGAGAGAGAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGCCCTGTACCCACCCACTACCATTTGACATGGTGAGAGAGAGAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGATGACGAGCTCAGGCAGGGATGGCTTCTCCAGTGCCCACAATGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGATGACGAGCTCAGGCAGGGATGGCTTCTCCAGTGCCCACAATGTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGACTCTGCTGTGCCACTGTGGGCCTTTCCTCACCCCTCCCTCCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGACTCTGCTGTGCCACTGTGGGCCTTTCCTCACCCCTCCCTCCCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATCAAGCTCCGGTTTCCAGCTGTGTTCCTTGAAGCCGTCGGGCTCTCTGG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATCAAGCTCTGGTTTCCAGCTGTGTTCCTTGAAGCCGTCGGGCTCTCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    401 TGACAGCCACAGAGCCTCTGAGCAACTTTGCTTTCAGCTATTTTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGACAGCCACAGAGCCTCTGAGCAACTTTGCTTTCAGCTATTTTCCA