seq1 = pF1KB7211.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB7211/gi568815589f_122410802.tfa (gi568815589f:122410802_122611740), 200939 bp

>pF1KB7211 939
>gi568815589f:122410802_122611740 (Chr9)

1-939  (100001-100939)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCCTGAGAACCAGAGCAGCGTGTCCGAGTTCCTCCTTCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCCTGAGAACCAGAGCAGCGTGTCCGAGTTCCTCCTTCTGGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCATCCGGCCAGAGCAGCAGGCTGTGTTCTTCACCCTGTTCCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCATCCGGCCAGAGCAGCAGGCTGTGTTCTTCACCCTGTTCCTGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGACCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATGCTGCTCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGACCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATGCTGCTCATCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGACTCTCACCTTCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCAGCCACTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGACTCTCACCTTCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCAGCCACTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCACTGACATCTCCTTTTCATCTGTCACTGTCCCTAAGATGCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTCACTGACATCTCCTTTTCATCTGTCACTGTCCCTAAGATGCTGATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATGCGGACTAAGTACAAATCGATCCTCTATGAGGAATGCATTTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACATGCGGACTAAGTACAAATCGATCCTCTATGAGGAATGCATTTCTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTATTTTTTTATATTTTTTACTGACCTGGACAGCTTCCTTATTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTATTTTTTTATATTTTTTACTGACCTGGACAGCTTCCTTATTACATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCATATGACCGATATGTTGCCATATGTCACCCTCTCCACTACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCATATGACCGATATGTTGCCATATGTCACCCTCTCCACTACACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAGGGAAGAGCTCTGTGTCTTCTTAGTGGCTGTATCTTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAGGGAAGAGCTCTGTGTCTTCTTAGTGGCTGTATCTTGGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGTCTTGTGCCAGCTCCCTCTCTCACACCCTTCTCCTGACCCGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGTCTTGTGCCAGCTCCCTCTCTCACACCCTTCTCCTGACCCGGCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGCTGCGAACACCATCCCCCATGTCTTCTGTGACCTTGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGTGCTGCGAACACCATCCCCCATGTCTTCTGTGACCTTGCTGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCAAGCTGTCCTGCTCAGATATCTTCCTCAATGAGCTGGTCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTCAAGCTGTCCTGCTCAGATATCTTCCTCAATGAGCTGGTCATGTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACAGTAGGGGTGGTGGTCATTACCCTGCCATTCATGTGTATCCTGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACAGTAGGGGTGGTGGTCATTACCCTGCCATTCATGTGTATCCTGGTATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATATGGCTACATTGGGGCCACCATCCTGAGGGTCCCTTCAACCAAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATATGGCTACATTGGGGCCACCATCCTGAGGGTCCCTTCAACCAAAGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCACAAAGCATTGTCCACATGTGGCTCCCATCTCTCTGTGGTGTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCACAAAGCATTGTCCACATGTGGCTCCCATCTCTCTGTGGTGTCTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATTATGGGTCAATATTTGGCCAGTACCTTTTCCCGACTGTAAGCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATTATGGGTCAATATTTGGCCAGTACCTTTTCCCGACTGTAAGCAGTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATTGACAAGGATGTCATTGTGGCTCTCATGTACACGGTGGTCACACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATTGACAAGGATGTCATTGTGGCTCTCATGTACACGGTGGTCACACCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTGAACCCCTTTATCTACAGCCTTAGGAACAGGGACATGAAAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTGAACCCCTTTATCTACAGCCTTAGGAACAGGGACATGAAAGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CTTGGGAAACTCTTCAGTAGAGCAACATTTTTCTCTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTTGGGAAACTCTTCAGTAGAGCAACATTTTTCTCTTGG