seq1 = pF1KB7207.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KB7207/gi568815593f_90385568.tfa (gi568815593f:90385568_90612136), 226569 bp

>pF1KB7207 669
>gi568815593f:90385568_90612136 (Chr5)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-247  (102433-102562)   100% ->
248-304  (110110-110166)   100% ->
305-355  (112089-112139)   100% ->
356-438  (116339-116421)   100% ->
439-585  (120961-121107)   100% ->
586-669  (126486-126569)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGGAATAAAGGAAGAGGACGTGCTGCTTATACCTTTAATATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGGAATAAAGGAAGAGGACGTGCTGCTTATACCTTTAATATTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGTTGGATTTAGCAAAGGTGAAAAGTTACCTGATGTAGTGTTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGTTGGATTTAGCAAAGGTGAAAAGTTACCTGATGTAGTGTTGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCCCCACTATTTCCT         GATACAGATTATAAACCAGTGCCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCCCCACTATTTCCTGTA...CAGGATACAGATTATAAACCAGTGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGAAAACAGGAGAAGGTGAAGAATATATGCTGGCTTTGAAACAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102457 CTGAAAACAGGAGAAGGTGAAGAATATATGCTGGCTTTGAAACAGGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGAGAAACAATGAAAAGAATGCCTTATTTTATTGAAACACCTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102507 GAGAGAAACAATGAAAAGAATGCCTTATTTTATTGAAACACCTGAAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACAAG         ATATTGAAAGGTATAGTAAAAGATACATGAAGGTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102557 GACAAGGTA...TAGATATTGAAAGGTATAGTAAAAGATACATGAAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACAAGGAAGAATGGATACCAG         ATTGGAGAAGACTTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110145 TACAAGGAAGAATGGATACCAGGTA...CAGATTGGAGAAGACTTCCAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAGATGATGCCAAGAAATAAATGTAAAAAAG         CAGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 112108 AGAGATGATGCCAAGAAATAAATGTAAAAAAGGTA...CAGCAGGCCCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AACCCAAAAAGGCAAAAGACGCAGGCAAAGGCACACCACTCACTAATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116348 AACCCAAAAAGGCAAAAGACGCAGGCAAAGGCACACCACTCACTAATACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAGATGTGTTGAAAAAAATGGAG         GAATTGGAAAAAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 116398 GAAGATGTGTTGAAAAAAATGGAGGTA...CAGGAATTGGAAAAAAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGATGGTGAAAAATCAGATGAGGAAAATGAAGAGAAAGAAGGAAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120978 TGATGGTGAAAAATCAGATGAGGAAAATGAAGAGAAAGAAGGAAGCAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGAAAAGTAAAGAAGGTGATGATGACGATGACGATGATGCCGCAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121028 AGAAAAGTAAAGAAGGTGATGATGACGATGACGATGATGCCGCAGAACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGGAATATGATGAAGAAGAGCAAGAAGAG         GAAAATGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121078 GAGGAATATGATGAAGAAGAGCAAGAAGAGGTA...TAGGAAAATGACTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CATTAATTCATACTTTGAAGATGGAGATGATTTTGGCGCAGACAGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126497 CATTAATTCATACTTTGAAGATGGAGATGATTTTGGCGCAGACAGTGATG

    700     .    :    .    :
    647 ACAACATGGATGAGGCAACCTAT
        |||||||||||||||||||||||
 126547 ACAACATGGATGAGGCAACCTAT