seq1 = pF1KB7202.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KB7202/gi568815592f_31623384.tfa (gi568815592f:31623384_31825071), 201688 bp

>pF1KB7202 723
>gi568815592f:31623384_31825071 (Chr6)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-409  (100256-100603)   100% ->
410-500  (100759-100849)   100% ->
501-541  (101204-101244)   100% ->
542-621  (101382-101461)   100% ->
622-723  (101587-101688)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGTGTTTCTGCAGCTGCTACCGCTGCTGCTCTCGAGGGCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGTGTTTCTGCAGCTGCTACCGCTGCTGCTCTCGAGGGCCCAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACCCTGGGG         CTTCTCTGGACGGCCGCCCTGGGGACCGGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACCCTGGGGGTA...TAGCTTCTCTGGACGGCCGCCCTGGGGACCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAATCTCTCCTGCGGAGGAGTCTCTCATCCCATCCGCTGGGTCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100286 TGAATCTCTCCTGCGGAGGAGTCTCTCATCCCATCCGCTGGGTCTGGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCAGCTTCCCGGCCTGCAAGGGCCTGTCCAAAGGACGCCGACCGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100336 CCCAGCTTCCCGGCCTGCAAGGGCCTGTCCAAAGGACGCCGACCGATCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGGGCCTCTTCGAGCGGGACCCCCACCGTGCCTCCCCTCCAGCCTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100386 GTGGGCCTCTTCGAGCGGGACCCCCACCGTGCCTCCCCTCCAGCCTTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGGCCGCCTACGCTCCCTGGACTCTGGTATCCGGCGGCTGGAGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100436 TCGGCCGCCTACGCTCCCTGGACTCTGGTATCCGGCGGCTGGAGCTCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGAGCGCGGGGGACTCGGGCACTTTTTTCTGCAAGGGCCGCCACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100486 TTGAGCGCGGGGGACTCGGGCACTTTTTTCTGCAAGGGCCGCCACGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGAGAGCCGTACAGTGCTTCACGTGCTGGGGGACAGGACCTATTGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100536 CGAGAGCCGTACAGTGCTTCACGTGCTGGGGGACAGGACCTATTGCAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCCCGGGCCTACCCATG         GGTCCGTGTATCCCCAGCTCCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100586 CCCCCGGGCCTACCCATGGTA...CAGGGTCCGTGTATCCCCAGCTCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCCCGCTGCTGGGCGCTGGGTTGGTGCTCGGACTGGGAGCTTTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100782 ATCCCGCTGCTGGGCGCTGGGTTGGTGCTCGGACTGGGAGCTTTGGGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGTCTGGTGGCTGCACAG         GCGCCTGCCCCCGCAACCGATTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100832 GGTCTGGTGGCTGCACAGGTG...CAGGCGCCTGCCCCCGCAACCGATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GACCACTCCCTAGATTTG         CTCCACTTGTGAAAACCGAGCCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101227 GACCACTCCCTAGATTTGGTG...TAGCTCCACTTGTGAAAACCGAGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGAGGCCAGTAAAGGAGGAAGAGCCCAAGATTCCAGGGGACCTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101405 CAGAGGCCAGTAAAGGAGGAAGAGCCCAAGATTCCAGGGGACCTGGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAACCG         AGCCTGCTCTATGCGGATCTGGACCATCTAGCCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101455 GGAACCGGTA...CAGAGCCTGCTCTATGCGGATCTGGACCATCTAGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCAGCAGGCCCCGCCGGCTGTCCACAGCGGACCCTGCTGATGCCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101621 TCAGCAGGCCCCGCCGGCTGTCCACAGCGGACCCTGCTGATGCCTCCACC

    750     .    :    .
    706 ATCTATGCAGTTGTAGTT
        ||||||||||||||||||
 101671 ATCTATGCAGTTGTAGTT