seq1 = pF1KB7200.tfa, 1293 bp
seq2 = pF1KB7200/gi568815575r_49151337.tfa (gi568815575r:49151337_49358505), 207169 bp

>pF1KB7200 1293
>gi568815575r:49151337_49358505 (ChrX)

(complement)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-315  (100738-100842)   100% ->
316-454  (100941-101079)   100% ->
455-542  (101494-101581)   100% ->
543-647  (101651-101755)   100% ->
648-735  (102704-102791)   100% ->
736-816  (102997-103077)   100% ->
817-967  (104439-104589)   100% ->
968-1044  (105304-105380)   100% ->
1045-1146  (106741-106842)   100% ->
1147-1293  (107023-107169)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAACCCCAGGCCTGGCAAGCCCTCGGCCCCTTCCTTGGCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAACCCCAGGCCTGGCAAGCCCTCGGCCCCTTCCTTGGCCCTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCATCCCCAGGAGCCTCGCCCAGCTGGAGGGCTGCACCCAAAGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCATCCCCAGGAGCCTCGCCCAGCTGGAGGGCTGCACCCAAAGCCTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGCTGGGGGCCCGGGGCCCAGGGGGAACCTTCCAGGGCCGAGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGCTGGGGGCCCGGGGCCCAGGGGGAACCTTCCAGGGCCGAGATCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGAGGCGGGGCCCATGCCTCCTCTTCTTCCTTGAACCCCATGCCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGAGGCGGGGCCCATGCCTCCTCTTCTTCCTTGAACCCCATGCCACCATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGCTGCAG         CTGCCCACACTGCCCCTAGTCATGGTGGCAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGCTGCAGGTG...CAGCTGCCCACACTGCCCCTAGTCATGGTGGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTCCGGGGCACGGCTGGGCCCCTTGCCCCACTTACAGGCACTCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100769 CCTCCGGGGCACGGCTGGGCCCCTTGCCCCACTTACAGGCACTCCTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACAGGCCACATTTCATGCACCAG         CTCTCAACGGTGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100819 GACAGGCCACATTTCATGCACCAGGTA...CAGCTCTCAACGGTGGATGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCACGCCCGGACCCCTGTGCTGCAGGTGCACCCCCTGGAGAGCCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100958 CCACGCCCGGACCCCTGTGCTGCAGGTGCACCCCCTGGAGAGCCCAGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGATCAGCCTCACACCACCCACCACCGCCACTGGGGTCTTCTCCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101008 TGATCAGCCTCACACCACCCACCACCGCCACTGGGGTCTTCTCCCTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCCGGCCTGGCCTCCCACCTG         GGATCAACGTGGCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101058 GCCCGGCCTGGCCTCCCACCTGGTA...CAGGGATCAACGTGGCCAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAATGGGTGTCCAGGGAGCCGGCACTGCTCTGCACCTTCCCAAATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101513 GGAATGGGTGTCCAGGGAGCCGGCACTGCTCTGCACCTTCCCAAATCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTGCACCCAGGAAGGACAG         CACCCTTTCGGCTGTGCCCCAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101563 GTGCACCCAGGAAGGACAGGTC...CAGCACCCTTTCGGCTGTGCCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCTCCTACCCACTGCTGGCAAATGGTGTCTGCAAGTGGCCCGGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101673 AGCTCCTACCCACTGCTGGCAAATGGTGTCTGCAAGTGGCCCGGATGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAGGTCTTCGAAGAGCCAGAGGACTTCCTCAA         GCACTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101723 GAAGGTCTTCGAAGAGCCAGAGGACTTCCTCAAGTG...TAGGCACTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGCGGACCATCTTCTGGATGAGAAGGGCAGGGCACAATGTCTCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102712 AGGCGGACCATCTTCTGGATGAGAAGGGCAGGGCACAATGTCTCCTCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGAGAGATGGTACAGTCTCTGGAGCAGCAG         CTGGTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102762 AGAGAGATGGTACAGTCTCTGGAGCAGCAGGTA...CAGCTGGTGCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAAGGAGAAGCTGAGTGCCATGCAGGCCCACCTGGCTGGGAAAATGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103008 GAAGGAGAAGCTGAGTGCCATGCAGGCCCACCTGGCTGGGAAAATGGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGACCAAGGCTTCATCTGTG         GCATCATCCGACAAGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103058 TGACCAAGGCTTCATCTGTGGTG...CAGGCATCATCCGACAAGGGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TGCTGCATCGTAGCTGCTGGCAGCCAAGGCCCTGTCGTCCCAGCCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104460 TGCTGCATCGTAGCTGCTGGCAGCCAAGGCCCTGTCGTCCCAGCCTGGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGGCCCCCGGGAGGCCCCTGACAGCCTGTTTGCTGTCCGGAGGCACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104510 TGGCCCCCGGGAGGCCCCTGACAGCCTGTTTGCTGTCCGGAGGCACCTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGGGTAGCCATGGAAACAGCACATTCCCAG         AGTTCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104560 GGGGTAGCCATGGAAACAGCACATTCCCAGGTA...CAGAGTTCCTCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AACATGGACTACTTCAAGTTCCACAACATGCGACCCCCTTTCACCTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105315 AACATGGACTACTTCAAGTTCCACAACATGCGACCCCCTTTCACCTACGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CACGCTCATCCGCTGG         GCCATCCTGGAGGCTCCAGAGAAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105365 CACGCTCATCCGCTGGGTA...CAGGCCATCCTGGAGGCTCCAGAGAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGCGGACACTCAATGAGATCTACCACTGGTTCACACGCATGTTTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106766 AGCGGACACTCAATGAGATCTACCACTGGTTCACACGCATGTTTGCCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTCAGAAACCATCCTGCCACCTGGAAG         AACGCCATCCGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106816 TTCAGAAACCATCCTGCCACCTGGAAGGTG...CAGAACGCCATCCGCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CAACCTGAGTCTGCACAAGTGCTTTGTGCGGGTGGAGAGCGAGAAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107037 CAACCTGAGTCTGCACAAGTGCTTTGTGCGGGTGGAGAGCGAGAAGGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTGTGTGGACCGTGGATGAGCTGGAGTTCCGCAAGAAACGGAGCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107087 CTGTGTGGACCGTGGATGAGCTGGAGTTCCGCAAGAAACGGAGCCAGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :
   1261 CCCAGCAGGTGTTCCAACCCTACACCTGGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 107137 CCCAGCAGGTGTTCCAACCCTACACCTGGCCCC