seq1 = pF1KB7191.tfa, 1623 bp
seq2 = pF1KB7191/gi568815574r_23946069.tfa (gi568815574r:23946069_24147688), 201620 bp

>pF1KB7191 1623
>gi568815574r:23946069_24147688 (ChrY)

(complement)

1-1623  (100001-101620)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCCAGGAGTTTGAGGTTGAAGCTATTGTTGACAAAAGACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCCAGGAGTTTGAGGTTGAAGCTATTGTTGACAAAAGACAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAAAATGGGAATACACAGTATTTGGTTCGGTGGAAAGGTTATGACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAAAATGGGAATACACAGTATTTGGTTCGGTGGAAAGGTTATGACAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATGACACTTGGGAACCAGAGCAGCACCTCATGAACTGTGAAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGATGACACTTGGGAACCAGAGCAGCACCTCATGAACTGTGAAAAATGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTACATGATTTTAATAGACGACAGACTGAAAAACAGAAAAAACTGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTACATGATTTTAATAGACGACAGACTGAAAAACAGAAAAAACTGACATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACTACAACCAGTAGAATTTTTTCAAACAATGCCAGAAGAAGAACTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACTACAACCAGTAGAATTTTTTCAAACAATGCCAGAAGAAGAACTTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GATCTACAAAAGCAAACTATTCTAAGAACTCTCCTAAAACTCCAGTGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100251 GATCTACAAAAGCAAACTATTCTAAGAACTCTCCTAAAACGCCAGTGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATAAACACCACAGGTCCAAAAACTGCAAGTTATTTGCTGCCAGCAAGAA
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100301 GATAAACACCACAGGTCCAAAAACCGCAAGTTATTTGCTGCCAGCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTTAGGAGAAAGGCAGCTTCAACTCTCTCCGACACAAAGAATATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTTAGGAGAAAGGCAGCTTCAATTCTCTCCGACACAAAGAATATGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAATAAATTCAACTATTGAGACCCTTGCACCTGACAGCCCCTTTGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAATAAATTCAACTATTGAGACCCTTGCACCTGACAGCCCCTTTGACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGAAAACTGTGAGTGGCTTTCAGAAACTTGAGAAACTGGACCCTATTGC
        ||-||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AA AA  CTGTGAGTGGCTTTCAGAAACTTGAGAAACTGGACCCTATTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCAGATCAGCAGGACACGGTGGTCTTCAAGGTGACAGAAGGGAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 AGCAGATCAGCAGGACACGGTGGTCTTCAAGGTGACAGAAGGGAAACTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCGGGACCCTTTGTCACATCCTGGTGCAGAACAGACTGGAATACAGAAC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100548 TCCGGGACCCTTTGTCACGTCCTGGTGCAGAACAGACTGGAATACAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGACTCAGATGCACCCACTAATGTCGCAGATGTCTGGCTCAGTTACTGC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100598 AAGACTCAGATACACCCACTAATGTCGCAGATGTCTGGCTCAGTTACTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCTATGGCCACAGGTTCAGCTACCCGAAAGGGTATAGTGGTATTAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100648 TTCTATGGCCACAGGTTCAGCTACCCGAAAGGGTATAGTGGTATTAATAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCCATTAGCAGCCAATGGGACAACAGACATGCATACCTCAGTTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100698 ACCCATTAGCAGCCAATGGGACAACAGACATGCATACCTCAGTTCCAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGAAAGGTGGGCAAAGAAATATTACTGATGACAGCAGAGGCCAGCCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100748 GTGAAAGGTGGGCAAAGAAATATTACTGATGACAGCAGAGACCAGCCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATCAAGAAGATGCACTTCACCATAAGGCTAACAGAAAGTGCCATCACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100798 TATCAAGAAGATGCACTTCACCATAAGGCTAACAGAAAGTGCCAGCACAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAGAGACATTGTAGTGAAGAAAGAGGATGGATTCACCCAGATAGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100848 ACAGAGACATTGTAGTGAAGAAAGAGGATGGATTCACCCAGATAGTGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCAACTAGATCGACAGAAAAAAATGCACTGAATACAGAAGTAATTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100898 TCAACTAGATCGACAGAAAAAAATGCACTGAATACAGAAGTAATTAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AATGGTTAATGCTCTGAATAGCGCTGCTGCAGATGACAGCAAGCTCGTGC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100948 AATAGTTAATGCTCTGAATAGCGCTGCTGCAGATGACAGCAAGCTCGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGTTCAGTGCAGCTGGAAGTGTCTTTTGCTGCGGTCTTGATTTTGGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100998 TGTTCAGTGCAGCTGGAAGTGTCTTTTGCTGCGGTCTTGATTTTGGGTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTGTGAGGCACTTAAGGAATGACAGAAACACAGCAAGCCTTGAAATGGT
        ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 101048 TTTGTGAAGCACTTAAGGAATAACAGAAACACAGCAAGCCTTGAAATGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGACACCATCAAGAACTTTGTGAATACTTTTATTCAATTTAAAAAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 GGACACCATCAAGAACTTTGTGAATACTTTTATTCAATTTAAAAAGCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTGTTGTATCAGTCAATGGCCCTGCCATTGGACTAGGTGCATCCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 101148 TTGTTGTATCAGTCAATGGCCCTGCGATTGGACTAGGTGCATCCATCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCTCTTTGTGATCTCGTGTGGGCTAATGAAAAGGCTTGGTTCCAAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 CCTCTTTGTGATCTCGTGTGGGCTAATGAAAAGGCTTGGTTCCAAACCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTATACGACCTTTGGACAGAGTCCAGATGGCTGTTCTTCTATTACATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101248 TTATACGACCTTTGGACAGAGTCCAGATGGCTGTTCTTCTATTACATTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCAAAATGATGGGTAAAGCATCTGCCAATGAAATGTTAATTGCTGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101298 CCAAAATGATGGGTAAAGCATCTGCCAATGAAATGTTAATTGCTGGGCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGCTGACAGCACGGGAGGCATGCGCCAAAGGCCTGGTCTCTCAGGTATT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101348 AAGCTGACAGCAAGGGAGGCATGCGCCAAAGGCCTGGTCTCTCAGGTATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TTTGACTGGAACTTTCACCCAAGAGGTTATGATTCAAATTAAGGAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101398 TTTGACTGGAACTTTCACCCAAGAGGTTATGATTCAAATTAAGGAGCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCTCATACAATGCAATTGTACTGGAAGAATGTAAGGCCCTCGTTCGCTGT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101448 CCTCATACAATCCAATTGTACTGGAAGAATGTAAGGCCCTCGTTCGCTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AATATTAAGTTGGAGTTGGAACAGGCCAATGAGAGAGAGTGTGAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101498 AATATTAAGTTGGAGTTGGAACAGGCCAATGAGAGAGAGTGTGAGGTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GAGGAAGATCTGGAGCTCAGCCCAAGGGATAGAATCCATGTTAAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101548 GAGGAAGATCTGGAGCTCAGCCCAAGGGATAGAATCCATGTTAAAGTATG

   1600     .    :    .    :
   1601 TTGAAAATAAAATTGATGAGTTT
        |||||||||||||||||||||||
 101598 TTGAAAATAAAATTGATGAGTTT