seq1 = pF1KB7191.tfa, 1623 bp
seq2 = pF1KB7191/gi568815574r_17778270.tfa (gi568815574r:17778270_17979892), 201623 bp

>pF1KB7191 1623
>gi568815574r:17778270_17979892 (ChrY)

(complement)

1-1623  (100001-101623)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCCCAGGAGTTTGAGGTTGAAGCTATTGTTGACAAAAGACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCCCAGGAGTTTGAGGTTGAAGCTATTGTTGACAAAAGACAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAAAATGGGAATACACAGTATTTGGTTCGGTGGAAAGGTTATGACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAAAATGGGAATACACAGTATTTGGTTCGGTGGAAAGGTTATGACAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATGACACTTGGGAACCAGAGCAGCACCTCATGAACTGTGAAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGATGACACTTGGGAACCAGAGCAGCACCTCATGAACTGTGAAAAATGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTACATGATTTTAATAGACGACAGACTGAAAAACAGAAAAAACTGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTACATGATTTTAATAGACGACAGACTGAAAAACAGAAAAAACTGACATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACTACAACCAGTAGAATTTTTTCAAACAATGCCAGAAGAAGAACTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACTACAACCAGTAGAATTTTTTCAAACAATGCCAGAAGAAGAACTTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GATCTACAAAAGCAAACTATTCTAAGAACTCTCCTAAAACTCCAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GATCTACAAAAGCAAACTATTCTAAGAACTCTCCTAAAACTCCAGTGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATAAACACCACAGGTCCAAAAACTGCAAGTTATTTGCTGCCAGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATAAACACCACAGGTCCAAAAACTGCAAGTTATTTGCTGCCAGCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTTAGGAGAAAGGCAGCTTCAACTCTCTCCGACACAAAGAATATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTTAGGAGAAAGGCAGCTTCAACTCTCTCCGACACAAAGAATATGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAATAAATTCAACTATTGAGACCCTTGCACCTGACAGCCCCTTTGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAATAAATTCAACTATTGAGACCCTTGCACCTGACAGCCCCTTTGACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGAAAACTGTGAGTGGCTTTCAGAAACTTGAGAAACTGGACCCTATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGAAAACTGTGAGTGGCTTTCAGAAACTTGAGAAACTGGACCCTATTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCAGATCAGCAGGACACGGTGGTCTTCAAGGTGACAGAAGGGAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGCAGATCAGCAGGACACGGTGGTCTTCAAGGTGACAGAAGGGAAACTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCGGGACCCTTTGTCACATCCTGGTGCAGAACAGACTGGAATACAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCGGGACCCTTTGTCACATCCTGGTGCAGAACAGACTGGAATACAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGACTCAGATGCACCCACTAATGTCGCAGATGTCTGGCTCAGTTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGACTCAGATGCACCCACTAATGTCGCAGATGTCTGGCTCAGTTACTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCTATGGCCACAGGTTCAGCTACCCGAAAGGGTATAGTGGTATTAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTCTATGGCCACAGGTTCAGCTACCCGAAAGGGTATAGTGGTATTAATAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCCATTAGCAGCCAATGGGACAACAGACATGCATACCTCAGTTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCCATTAGCAGCCAATGGGACAACAGACATGCATACCTCAGTTCCAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGAAAGGTGGGCAAAGAAATATTACTGATGACAGCAGAGGCCAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGAAAGGTGGGCAAAGAAATATTACTGATGACAGCAGAGGCCAGCCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATCAAGAAGATGCACTTCACCATAAGGCTAACAGAAAGTGCCATCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATCAAGAAGATGCACTTCACCATAAGGCTAACAGAAAGTGCCATCACAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAGAGACATTGTAGTGAAGAAAGAGGATGGATTCACCCAGATAGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACAGAGACATTGTAGTGAAGAAAGAGGATGGATTCACCCAGATAGTGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCAACTAGATCGACAGAAAAAAATGCACTGAATACAGAAGTAATTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCAACTAGATCGACAGAAAAAAATGCACTGAATACAGAAGTAATTAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AATGGTTAATGCTCTGAATAGCGCTGCTGCAGATGACAGCAAGCTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AATGGTTAATGCTCTGAATAGCGCTGCTGCAGATGACAGCAAGCTCGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGTTCAGTGCAGCTGGAAGTGTCTTTTGCTGCGGTCTTGATTTTGGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGTTCAGTGCAGCTGGAAGTGTCTTTTGCTGCGGTCTTGATTTTGGGTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTGTGAGGCACTTAAGGAATGACAGAAACACAGCAAGCCTTGAAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTGTGAGGCACTTAAGGAATGACAGAAACACAGCAAGCCTTGAAATGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGACACCATCAAGAACTTTGTGAATACTTTTATTCAATTTAAAAAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGACACCATCAAGAACTTTGTGAATACTTTTATTCAATTTAAAAAGCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTGTTGTATCAGTCAATGGCCCTGCCATTGGACTAGGTGCATCCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTGTTGTATCAGTCAATGGCCCTGCCATTGGACTAGGTGCATCCATCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCTCTTTGTGATCTCGTGTGGGCTAATGAAAAGGCTTGGTTCCAAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCTCTTTGTGATCTCGTGTGGGCTAATGAAAAGGCTTGGTTCCAAACCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTATACGACCTTTGGACAGAGTCCAGATGGCTGTTCTTCTATTACATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTATACGACCTTTGGACAGAGTCCAGATGGCTGTTCTTCTATTACATTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCAAAATGATGGGTAAAGCATCTGCCAATGAAATGTTAATTGCTGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCAAAATGATGGGTAAAGCATCTGCCAATGAAATGTTAATTGCTGGGCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGCTGACAGCACGGGAGGCATGCGCCAAAGGCCTGGTCTCTCAGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGCTGACAGCACGGGAGGCATGCGCCAAAGGCCTGGTCTCTCAGGTATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TTTGACTGGAACTTTCACCCAAGAGGTTATGATTCAAATTAAGGAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TTTGACTGGAACTTTCACCCAAGAGGTTATGATTCAAATTAAGGAGCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCTCATACAATGCAATTGTACTGGAAGAATGTAAGGCCCTCGTTCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCTCATACAATGCAATTGTACTGGAAGAATGTAAGGCCCTCGTTCGCTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AATATTAAGTTGGAGTTGGAACAGGCCAATGAGAGAGAGTGTGAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AATATTAAGTTGGAGTTGGAACAGGCCAATGAGAGAGAGTGTGAGGTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GAGGAAGATCTGGAGCTCAGCCCAAGGGATAGAATCCATGTTAAAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GAGGAAGATCTGGAGCTCAGCCCAAGGGATAGAATCCATGTTAAAGTATG

   1600     .    :    .    :
   1601 TTGAAAATAAAATTGATGAGTTT
        |||||||||||||||||||||||
 101601 TTGAAAATAAAATTGATGAGTTT