seq1 = pF1KB7188.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KB7188/gi568815591r_155702903.tfa (gi568815591r:155702903_155912122), 209220 bp

>pF1KB7188 1386
>gi568815591r:155702903_155912122 (Chr7)

(complement)

1-300  (100001-100300)   100% ->
301-562  (105566-105827)   100% ->
563-1386  (108397-109220)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTGCTGGCGAGATGTCTGCTGCTAGTCCTCGTCTCCTCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTGCTGGCGAGATGTCTGCTGCTAGTCCTCGTCTCCTCGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTATGCTCGGGACTGGCGTGCGGACCGGGCAGGGGGTTCGGGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTATGCTCGGGACTGGCGTGCGGACCGGGCAGGGGGTTCGGGAAGAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCACCCCAAAAAGCTGACCCCTTTAGCCTACAAGCAGTTTATCCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCACCCCAAAAAGCTGACCCCTTTAGCCTACAAGCAGTTTATCCCCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGCCGAGAAGACCCTAGGCGCCAGCGGAAGGTATGAAGGGAAGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGCCGAGAAGACCCTAGGCGCCAGCGGAAGGTATGAAGGGAAGATCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGAAACTCCGAGCGATTTAAGGAACTCACCCCCAATTACAACCCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGAAACTCCGAGCGATTTAAGGAACTCACCCCCAATTACAACCCCGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATATTTAAGGATGAAGAAAACACCGGAGCGGACAGGCTGATGACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATATTTAAGGATGAAGAAAACACCGGAGCGGACAGGCTGATGACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301          AGGTGTAAGGACAAGTTGAACGCTTTGGCCATCTCGGTGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTA...CAGAGGTGTAAGGACAAGTTGAACGCTTTGGCCATCTCGGTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAACCAGTGGCCAGGAGTGAAACTGCGGGTGACCGAGGGCTGGGACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105607 GAACCAGTGGCCAGGAGTGAAACTGCGGGTGACCGAGGGCTGGGACGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGGCCACCACTCAGAGGAGTCTCTGCACTACGAGGGCCGCGCAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105657 ATGGCCACCACTCAGAGGAGTCTCTGCACTACGAGGGCCGCGCAGTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATCACCACGTCTGACCGCGACCGCAGCAAGTACGGCATGCTGGCCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105707 ATCACCACGTCTGACCGCGACCGCAGCAAGTACGGCATGCTGGCCCGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCGGTGGAGGCCGGCTTCGACTGGGTGTACTACGAGTCCAAGGCACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105757 GGCGGTGGAGGCCGGCTTCGACTGGGTGTACTACGAGTCCAAGGCACATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCCACTGCTCGGTGAAAGCAG         AGAACTCGGTGGCGGCCAAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105807 TCCACTGCTCGGTGAAAGCAGGTA...CAGAGAACTCGGTGGCGGCCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCGGGAGGCTGCTTCCCGGGCTCGGCCACGGTGCACCTGGAGCAGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108417 TCGGGAGGCTGCTTCCCGGGCTCGGCCACGGTGCACCTGGAGCAGGGCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CACCAAGCTGGTGAAGGACCTGAGCCCCGGGGACCGCGTGCTGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108467 CACCAAGCTGGTGAAGGACCTGAGCCCCGGGGACCGCGTGCTGGCGGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACGACCAGGGCCGGCTGCTCTACAGCGACTTCCTCACTTTCCTGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108517 ACGACCAGGGCCGGCTGCTCTACAGCGACTTCCTCACTTTCCTGGACCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GACGACGGCGCCAAGAAGGTCTTCTACGTGATCGAGACGCGGGAGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108567 GACGACGGCGCCAAGAAGGTCTTCTACGTGATCGAGACGCGGGAGCCGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CGAGCGCCTGCTGCTCACCGCCGCGCACCTGCTCTTTGTGGCGCCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108617 CGAGCGCCTGCTGCTCACCGCCGCGCACCTGCTCTTTGTGGCGCCGCACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACGACTCGGCCACCGGGGAGCCCGAGGCGTCCTCGGGCTCGGGGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108667 ACGACTCGGCCACCGGGGAGCCCGAGGCGTCCTCGGGCTCGGGGCCGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TCCGGGGGCGCACTGGGGCCTCGGGCGCTGTTCGCCAGCCGCGTGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108717 TCCGGGGGCGCACTGGGGCCTCGGGCGCTGTTCGCCAGCCGCGTGCGCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGGCCAGCGCGTGTACGTGGTGGCCGAGCGTGACGGGGACCGCCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108767 GGGCCAGCGCGTGTACGTGGTGGCCGAGCGTGACGGGGACCGCCGGCTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGCCCGCCGCTGTGCACAGCGTGACCCTAAGCGAGGAGGCCGCGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108817 TGCCCGCCGCTGTGCACAGCGTGACCCTAAGCGAGGAGGCCGCGGGCGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TACGCGCCGCTCACGGCCCAGGGCACCATTCTCATCAACCGGGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108867 TACGCGCCGCTCACGGCCCAGGGCACCATTCTCATCAACCGGGTGCTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCGTGCTACGCGGTCATCGAGGAGCACAGCTGGGCGCACCGGGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108917 CTCGTGCTACGCGGTCATCGAGGAGCACAGCTGGGCGCACCGGGCCTTCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CGCCCTTCCGCCTGGCGCACGCGCTCCTGGCTGCACTGGCGCCCGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108967 CGCCCTTCCGCCTGGCGCACGCGCTCCTGGCTGCACTGGCGCCCGCGCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ACGGACCGCGGCGGGGACAGCGGCGGCGGGGACCGCGGGGGCGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109017 ACGGACCGCGGCGGGGACAGCGGCGGCGGGGACCGCGGGGGCGGCGGCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CAGAGTAGCCCTAACCGCTCCAGGTGCTGCCGACGCTCCGGGTGCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109067 CAGAGTAGCCCTAACCGCTCCAGGTGCTGCCGACGCTCCGGGTGCGGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CCACCGCGGGCATCCACTGGTACTCGCAGCTGCTCTACCAAATAGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109117 CCACCGCGGGCATCCACTGGTACTCGCAGCTGCTCTACCAAATAGGCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TGGCTCCTGGACAGCGAGGCCCTGCACCCGCTGGGCATGGCGGTCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109167 TGGCTCCTGGACAGCGAGGCCCTGCACCCGCTGGGCATGGCGGTCAAGTC

   1400 
   1383 CAGC
        ||||
 109217 CAGC