seq1 = pF1KB7185.tfa, 1332 bp
seq2 = pF1KB7185/gi568815592f_55074588.tfa (gi568815592f:55074588_55382451), 307864 bp

>pF1KB7185 1332
>gi568815592f:55074588_55382451 (Chr6)

1-223  (100001-100223)   100% ->
224-402  (174052-174230)   100% ->
403-646  (180549-180792)   100% ->
647-762  (189120-189235)   100% ->
763-983  (202793-203013)   100% ->
984-1105  (205736-205857)   100% ->
1106-1332  (207638-207864)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGCACCAAATTGGAGGACTCCCCCCCTTGTCGCAACTGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGGCACCAAATTGGAGGACTCCCCCCCTTGTCGCAACTGGTCATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTTCGGAGCTGAATGAAACTCAAGAGCCCTTTTTAAACCCCACCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTTCGGAGCTGAATGAAACTCAAGAGCCCTTTTTAAACCCCACCGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGACGACGAGGAATTCCTGCGGTACCTGTGGAGGGAATACCTGCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGACGACGAGGAATTCCTGCGGTACCTGTGGAGGGAATACCTGCACCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAGAATATGAGTGGGTCCTGATCGCCGGGTACATCATCGTGTTCGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAGAATATGAGTGGGTCCTGATCGCCGGGTACATCATCGTGTTCGTCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCTCTCATTGGGAACGTCCTGG         TTTGTGTGGCAGTGTGGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100201 GGCTCTCATTGGGAACGTCCTGGGTG...TAGTTTGTGTGGCAGTGTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAACCACCACATGAGGACGGTAACCAACTACTTCATAGTCAATCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174070 AGAACCACCACATGAGGACGGTAACCAACTACTTCATAGTCAATCTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGCTGATGTGCTCGTGACCATCACCTGCCTTCCAGCCACACTGGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174120 CTGGCTGATGTGCTCGTGACCATCACCTGCCTTCCAGCCACACTGGTCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGATATCACTGAGACCTGGTTTTTTGGACAGTCCCTTTGCAAAGTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174170 GGATATCACTGAGACCTGGTTTTTTGGACAGTCCCTTTGCAAAGTGATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTTATCTACAG         ACCGTGTCGGTGTCTGTGTCTGTCCTCACA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 174220 CTTATCTACAGGTA...TAGACCGTGTCGGTGTCTGTGTCTGTCCTCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGAGCTGTATCGCCTTGGATCGGTGGTATGCAATCTGTCACCCTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180579 CTGAGCTGTATCGCCTTGGATCGGTGGTATGCAATCTGTCACCCTTTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTTAAGAGCACAGCAAAGCGGGCCCGTAACAGCATTGTCATCATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180629 GTTTAAGAGCACAGCAAAGCGGGCCCGTAACAGCATTGTCATCATCTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTGTCTCCTGCATTATAATGATTCCTCAGGCCATCGTCATGGAGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180679 TTGTCTCCTGCATTATAATGATTCCTCAGGCCATCGTCATGGAGTGCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCGTGTTCCCAGGCTTAGCCAATAAAACCACCCTCTTTACGGTGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180729 ACCGTGTTCCCAGGCTTAGCCAATAAAACCACCCTCTTTACGGTGTGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGAGCGCTGGGGTG         GTGAAATTTATCCCAAGATGTACCACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 180779 TGAGCGCTGGGGTGGTA...TAGGTGAAATTTATCCCAAGATGTACCACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCTGTTTCTTTCTGGTGACATACATGGCACCACTGTGTCTCATGGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189147 TCTGTTTCTTTCTGGTGACATACATGGCACCACTGTGTCTCATGGTGTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCTTATCTGCAAATATTTCGCAAACTCTGGTGTCGACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 189197 GCTTATCTGCAAATATTTCGCAAACTCTGGTGTCGACAGGTA...CAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCCTGGAACATCATCTGTAGTTCAGAGAAAATGGAAGCCCCTGCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202795 CCCTGGAACATCATCTGTAGTTCAGAGAAAATGGAAGCCCCTGCAGCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTTCACAGCCTCGAGGGCCAGGACAGCCAACGAAGTCCCGGATGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202845 TTTCACAGCCTCGAGGGCCAGGACAGCCAACGAAGTCCCGGATGAGCGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTGGCGGCTGAAATAAAGCAGATCCGAGCCAGAAGGAAAACAGCCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202895 GTGGCGGCTGAAATAAAGCAGATCCGAGCCAGAAGGAAAACAGCCCGGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTTGATGATTGTGCTTTTGGTATTTGCAATTTGCTATCTACCAATTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202945 GTTGATGATTGTGCTTTTGGTATTTGCAATTTGCTATCTACCAATTAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCCTCAATGTGCTAAAGAG         AGTATTTGGGATGTTTGCCCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 202995 TCCTCAATGTGCTAAAGAGGTA...CAGAGTATTTGGGATGTTTGCCCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACTGAAGACAGAGAGACTGTGTATGCCTGGTTTACCTTTTCACACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205758 ACTGAAGACAGAGAGACTGTGTATGCCTGGTTTACCTTTTCACACTGGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGTATATGCCAATAGTGCTGCGAATCCAATTATTTATAATTTTCTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205808 TGTATATGCCAATAGTGCTGCGAATCCAATTATTTATAATTTTCTCAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106          GAAAATTTCGAGAGGAATTTAAAGCTGCGTTTTCTTGCTGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205858 GTG...CAGGAAAATTTCGAGAGGAATTTAAAGCTGCGTTTTCTTGCTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TGCCTTGGAGTTCACCATCGCCAGGAGGATCGGCTCACCAGGGGACGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207679 TGCCTTGGAGTTCACCATCGCCAGGAGGATCGGCTCACCAGGGGACGAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TAGCACAGAGAGCCGGAAGTCCTTGACCACTCAAATCAGCAACTTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207729 TAGCACAGAGAGCCGGAAGTCCTTGACCACTCAAATCAGCAACTTTGATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACATATCAAAACTTTCTGAGCAAGTTGTGCTCACTAGCATAAGCACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207779 ACATATCAAAACTTTCTGAGCAAGTTGTGCTCACTAGCATAAGCACACTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1297 CCAGCAGCCAATGGAGCAGGACCACTTCAAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207829 CCAGCAGCCAATGGAGCAGGACCACTTCAAAACTGG