seq1 = pF1KB7184.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KB7184/gi568815592f_28426014.tfa (gi568815592f:28426014_28634164), 208151 bp

>pF1KB7184 663
>gi568815592f:28426014_28634164 (Chr6)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-241  (103438-103591)   100% ->
242-359  (105765-105882)   100% ->
360-459  (106308-106407)   100% ->
460-663  (107948-108151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTACACAGTTAAGGGTCGTCCATCTGCTTCCCCTTCTCCTAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTACACAGTTAAGGGTCGTCCATCTGCTTCCCCTTCTCCTAGCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGTGCAAACAAGTCCCAAGCAGGAGAAGATGAAG         ATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 CTTTGTGCAAACAAGTCCCAAGCAGGAGAAGATGAAGGTG...CAGATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTGCCACAAAGACGAGAAAGGCACCATCTATGACTATGAGGCCATCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103442 ATTGCCACAAAGACGAGAAAGGCACCATCTATGACTATGAGGCCATCGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTAATAAGAATGAATATGTTTCCTTCAAGCAGTATGTGGGCAAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103492 CTTAATAAGAATGAATATGTTTCCTTCAAGCAGTATGTGGGCAAGCACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTCTTCGTCAACGTGGCCACCTACTGTGGTCTGACAGCGCAATATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103542 CCTCTTCGTCAACGTGGCCACCTACTGTGGTCTGACAGCGCAATATCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242          AACTAAATGCACTCCAGGAGGAGCTGAAGCCCTATGGTCTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103592 GTA...CAGAACTAAATGCACTCCAGGAGGAGCTGAAGCCCTATGGTCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTGTGTTGGGCTTTCCCTGCAACCAATTTGGAAAGCAAGAACCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105806 GTTGTGTTGGGCTTTCCCTGCAACCAATTTGGAAAGCAAGAACCAGGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAACAAAGAGATTCTTCCTGGGCTCAA         GTATGTCCGTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105856 TAACAAAGAGATTCTTCCTGGGCTCAAGTA...CAGGTATGTCCGTCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGGAGGATTTGTACCTAGTTTCCAGCTTTTTGAGAAAGGGGATGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106322 GGGGAGGATTTGTACCTAGTTTCCAGCTTTTTGAGAAAGGGGATGTGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGTGAAAAAGAACAGAAAGTCTTCAGTTTCTTGAAG         CACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106372 GGTGAAAAAGAACAGAAAGTCTTCAGTTTCTTGAAGGTG...TAGCACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGTCCTCATCCCTCTGAGATTTTGGGCACATTCAAATCTATATCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107953 CTGTCCTCATCCCTCTGAGATTTTGGGCACATTCAAATCTATATCCTGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCCTGTAAAGGTCCATGACATCCGTTGGAACTTTGAAAAGTTCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108003 ACCCTGTAAAGGTCCATGACATCCGTTGGAACTTTGAAAAGTTCCTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGCCTGATGGAATCCCTGTCATGCGCTGGTCCCACCGGGCTACGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108053 GGGCCTGATGGAATCCCTGTCATGCGCTGGTCCCACCGGGCTACGGTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    615 CTCAGTCAAGACAGACATCCTGGCGTACTTGAAGCAATTCAAAACCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108103 CTCAGTCAAGACAGACATCCTGGCGTACTTGAAGCAATTCAAAACCAAA