seq1 = pF1KB7181.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KB7181/gi568815581r_46668323.tfa (gi568815581r:46668323_46918597), 250275 bp

>pF1KB7181 1065
>gi568815581r:46668323_46918597 (Chr17)

(complement)

1-80  (100001-100080)   100% ->
81-322  (144689-144930)   100% ->
323-588  (148550-148815)   100% ->
589-1065  (149799-150275)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCCACCTGCTCGGGCTGCTCCTCGGCCTCCTGCTCGGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCCACCTGCTCGGGCTGCTCCTCGGCCTCCTGCTCGGTGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGGTCCTCGCTGGCTACCCAATTTGGTG         GTCCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100051 CAGGGTCCTCGCTGGCTACCCAATTTGGTGGTA...CAGGTCCCTGGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGGCCAGCAGTACACATCTCTGGGCTCACAGCCCCTGCTCTGCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144700 TGGGCCAGCAGTACACATCTCTGGGCTCACAGCCCCTGCTCTGCGGCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCCCAGGCCTGGTCCCCAAGCAACTGCGCTTCTGCCGCAATTACATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144750 ATCCCAGGCCTGGTCCCCAAGCAACTGCGCTTCTGCCGCAATTACATCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATCATGCCCAGCGTGGCCGAGGGCGTGAAGCTGGGCATCCAGGAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144800 GATCATGCCCAGCGTGGCCGAGGGCGTGAAGCTGGGCATCCAGGAGTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCACCAGTTCCGGGGCCGCCGCTGGAACTGCACCACCATAGATGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144850 AGCACCAGTTCCGGGGCCGCCGCTGGAACTGCACCACCATAGATGACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGCCATCTTTGGGCCCGTCCTCGACAAAG         CCACCCGCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 144900 CTGGCCATCTTTGGGCCCGTCCTCGACAAAGGTA...CAGCCACCCGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCGGCCTTCGTTCACGCCATCGCCTCGGCCGGCGTGGCCTTCGCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148560 GTCGGCCTTCGTTCACGCCATCGCCTCGGCCGGCGTGGCCTTCGCCGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCGCTCCTGCGCCGAGGGCACCTCCACCATTTGCGGCTGTGACTCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148610 CCCGCTCCTGCGCCGAGGGCACCTCCACCATTTGCGGCTGTGACTCGCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CATAAGGGGCCGCCTGGCGAAGGCTGGAAGTGGGGCGGCTGCAGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148660 CATAAGGGGCCGCCTGGCGAAGGCTGGAAGTGGGGCGGCTGCAGCGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGCTGACTTCGGCGTGTTAGTGTCCAGGGAGTTCGCGGATGCGCGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148710 CGCTGACTTCGGCGTGTTAGTGTCCAGGGAGTTCGCGGATGCGCGCGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACAGGCCGGACGCGCGCTCGGCCATGAACAAGCACAACAACGAGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148760 ACAGGCCGGACGCGCGCTCGGCCATGAACAAGCACAACAACGAGGCGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CGCACG         ACTATCCTGGACCACATGCACCTCAAATGCAAGTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148810 CGCACGGTG...CAGACTATCCTGGACCACATGCACCTCAAATGCAAGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCACGGGCTGTCGGGCAGCTGTGAGGTGAAGACCTGCTGGTGGGCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149834 CCACGGGCTGTCGGGCAGCTGTGAGGTGAAGACCTGCTGGTGGGCGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGACTTCCGTGCCATCGGTGACTTCCTCAAGGACAAGTATGACAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149884 CTGACTTCCGTGCCATCGGTGACTTCCTCAAGGACAAGTATGACAGCGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCGGAGATGGTAGTAGAGAAGCACCGTGAGTCCCGAGGCTGGGTGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149934 TCGGAGATGGTAGTAGAGAAGCACCGTGAGTCCCGAGGCTGGGTGGAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCTCCGGGCCAAGTACTCGCTCTTCAAGCCACCCACGGAGAGGGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149984 CCTCCGGGCCAAGTACTCGCTCTTCAAGCCACCCACGGAGAGGGACCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTACTACGAGAACTCCCCCAACTTTTGTGAGCCCAACCCAGAGACGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150034 TCTACTACGAGAACTCCCCCAACTTTTGTGAGCCCAACCCAGAGACGGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCCTTTGGCACAAGGGACCGGACTTGCAATGTCACCTCCCACGGCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150084 TCCTTTGGCACAAGGGACCGGACTTGCAATGTCACCTCCCACGGCATCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGGCTGCGATCTGCTCTGCTGTGGCCGGGGCCACAACACGAGGACGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150134 TGGCTGCGATCTGCTCTGCTGTGGCCGGGGCCACAACACGAGGACGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGCGGAAGGAAAAATGCCACTGCATCTTCCACTGGTGCTGCTACGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150184 AGCGGAAGGAAAAATGCCACTGCATCTTCCACTGGTGCTGCTACGTCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TGCCAGGAGTGTATTCGCATCTACGACGTGCACACCTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150234 TGCCAGGAGTGTATTCGCATCTACGACGTGCACACCTGCAAG