seq1 = pF1KB7180.tfa, 1260 bp
seq2 = pF1KB7180/gi568815592r_29971114.tfa (gi568815592r:29971114_30175789), 204676 bp

>pF1KB7180 1260
>gi568815592r:29971114_30175789 (Chr6)

(complement)

1-567  (100001-100567)   100% ->
568-590  (102312-102334)   100% ->
591-682  (102542-102633)   100% ->
683-1260  (104099-104676)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGTGGAGAGATTTGACGAGACTGAGACTCTGGTTGAAGAGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGTGGAGAGATTTGACGAGACTGAGACTCTGGTTGAAGAGAGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATCCCAGGAGAGGGGCGGAAAGCGGCAAAAGTTAATGCGGGAGTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATCCCAGGAGAGGGGCGGAAAGCGGCAAAAGTTAATGCGGGAGTCGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGGGCATCTACACAGCAAGCAGCAGGGGCGGCCCGCCATCTGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGGGCATCTACACAGCAAGCAGCAGGGGCGGCCCGCCATCTGCGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGAAGGCGGTCACGGTGGTCGCGGAAGGGGCGGCGTCCAGATCCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGAAGGCGGTCACGGTGGTCGCGGAAGGGGCGGCGTCCAGATCCTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCCATGGATGCGCCCGAGCTGGGCCCGGGGCTGGTGGAGCGTCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCCATGGATGCGCCCGAGCTGGGCCCGGGGCTGGTGGAGCGTCTGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGGCGACGTGTCCTCTGTGCGGGGGCTCCTTCGAGGACCCGGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGGCGACGTGTCCTCTGTGCGGGGGCTCCTTCGAGGACCCGGTGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGCGTGCGAGCACAGCTTCTGCCGCGCGTGTCTGGCCCGCCGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGCGTGCGAGCACAGCTTCTGCCGCGCGTGTCTGGCCCGCCGCTGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACTCCGCCGGCGACCGGCACCGAGGCTTCCCCCACCGCCTGTCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACTCCGCCGGCGACCGGCACCGAGGCTTCCCCCACCGCCTGTCCCTGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGGCCTGCCGTGTCCCCGCCGCAGCCTGAGGTCTAATGTGCGGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGGCCTGCCGTGTCCCCGCCGCAGCCTGAGGTCTAATGTGCGGCTGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGAGGTGCGAATCAGCCGCGAGCTGCGAGAGAAGCTGGCTGAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGAGGTGCGAATCAGCCGCGAGCTGCGAGAGAAGCTGGCTGAGCCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCCCGTGCGGGGAGACGCCGAGGGGGGCGCATCCCCACCATGGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCCCGTGCGGGGAGACGCCGAGGGGGGCGCATCCCCACCATGGGCTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGACCTGCCCGGAGAG         GATATGAGGAAGACATGGAGACG 
        |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>
 100551 TGGACCTGCCCGGAGAGGTG...TAGGATATGAGGAAGACATGGAGACGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    591         ATTTGAAGTCCCAACATCCAAGTCATCTAATTCAGAGGATGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102336 TG...TAGATTTGAAGTCCCAACATCCAAGTCATCTAATTCAGAGGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCTCCCTGAAGATTATCCAGTGGTCAAAAAAATGCTTCATAGACTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102584 TCTCCCTGAAGATTATCCAGTGGTCAAAAAAATGCTTCATAGACTGACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683          CCGACCTGACCCTGGACCCTGGGACCGCACACCGCCGCCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102634 GTA...CAGCCGACCTGACCCTGGACCCTGGGACCGCACACCGCCGCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTCATCTCCGCCGACCGCCGCAGCGTACAACTGGCCCCACCAGGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104140 CTCATCTCCGCCGACCGCCGCAGCGTACAACTGGCCCCACCAGGGACGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGCGCCCCCTGACGGCCCCAAGCGCTTCGATCAGCTCCCAGCTGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104190 CGCGCCCCCTGACGGCCCCAAGCGCTTCGATCAGCTCCCAGCTGTGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTGCGCAGGGCTTCGGGGCCGGCCGCCACTGCTGGGAGGTGGAGACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104240 GTGCGCAGGGCTTCGGGGCCGGCCGCCACTGCTGGGAGGTGGAGACTGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GACGCCGCCTCCTGCAGAGACTCTTCTGGGGAGGATGCGGACGACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104290 GACGCCGCCTCCTGCAGAGACTCTTCTGGGGAGGATGCGGACGACGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GAGCCACTATGCAGTGGGCGCGGCCGGGGAATCAGTGCAACGCAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104340 GAGCCACTATGCAGTGGGCGCGGCCGGGGAATCAGTGCAACGCAAGGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GCGTAAGGCTGTGCCCTGCGGGGGCCGTGTGGGCCGTGGAGGGCCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104390 GCGTAAGGCTGTGCCCTGCGGGGGCCGTGTGGGCCGTGGAGGGCCGCGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGCCGCCTGTGGGCCCTCACGGCACCCGAACCCACCCTGCTGGGCGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104440 GGCCGCCTGTGGGCCCTCACGGCACCCGAACCCACCCTGCTGGGCGGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TGAGCCCCCGCCGCGGCGCATTCGCGTGGACCTGGACTGGGAGCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104490 TGAGCCCCCGCCGCGGCGCATTCGCGTGGACCTGGACTGGGAGCGGGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GCGTGGCCTTCTACGACGGCCGCTCACTCGACCTGCTTTACGCCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104540 GCGTGGCCTTCTACGACGGCCGCTCACTCGACCTGCTTTACGCCTTCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GCGCCTGGCCCCCTGGGGGAGCGCATCTTCCCGCTGTTCTGCACCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104590 GCGCCTGGCCCCCTGGGGGAGCGCATCTTCCCGCTGTTCTGCACCTGCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .
   1224 CCCTCGTGCTCCGCTCCGCATTGTACCAGCGGAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104640 CCCTCGTGCTCCGCTCCGCATTGTACCAGCGGAAAGC