seq1 = pF1KB7178.tfa, 1278 bp
seq2 = pF1KB7178/gi568815591f_95385972.tfa (gi568815591f:95385972_95637756), 251785 bp

>pF1KB7178 1278
>gi568815591f:95385972_95637756 (Chr7)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-487  (109787-110086)   100% ->
488-978  (141842-142332)   100% ->
979-1092  (150466-150579)   100% ->
1093-1278  (151600-151785)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGGCACCACTGCCCCTGTCACTAAATCTGGAGCTGCCAAGTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGGCACCACTGCCCCTGTCACTAAATCTGGAGCTGCCAAGTTAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAGAGAAATTTCCTTGAGGCGCTAAAGTCCAATGACTTCGGAAAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAGAGAAATTTCCTTGAGGCGCTAAAGTCCAATGACTTCGGAAAATTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCTATTTTGATCCAAAGGCAAATAGATGTGGACACTGTTTTTGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCTATTTTGATCCAAAGGCAAATAGATGTGGACACTGTTTTTGAAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGATGAGAATATGGTTTTGGCATCTTATAAACAAG         GTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 GAAGATGAGAATATGGTTTTGGCATCTTATAAACAAGGTA...CAGGTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGGTTGCCTAGCTATAAATTGAAGTCTTCCTGGGCCACAGGCCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109791 CTGGTTGCCTAGCTATAAATTGAAGTCTTCCTGGGCCACAGGCCTCCATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCTGTCTTGTTTGGCCATGTGGAATGTCTTCTGGTGCTACTGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109841 TCTCTGTCTTGTTTGGCCATGTGGAATGTCTTCTGGTGCTACTGGACCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATGCTACAATCAACTGTAGACCCAATGGGAAAACCCCTCTTCACGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109891 AATGCTACAATCAACTGTAGACCCAATGGGAAAACCCCTCTTCACGTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTGTGAAATGGCCAATGTGGATTGTGTTAAGATCCTCTGTGATCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109941 TTGTGAAATGGCCAATGTGGATTGTGTTAAGATCCTCTGTGATCGTGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAAAGCTCAATTGCTACTCCTTAAGTGGACACACAGCTTTGCACTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109991 CAAAGCTCAATTGCTACTCCTTAAGTGGACACACAGCTTTGCACTTTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACAACTCCAAGTTCCATTCTCTGTGCCAAGCAATTGGTTTGGAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 110041 ACAACTCCAAGTTCCATTCTCTGTGCCAAGCAATTGGTTTGGAGAGGTA.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488      GGGCGAATGTGAACATGAAGACCAACAACCAAGATGAGGAGACGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110091 ..TAGGGGCGAATGTGAACATGAAGACCAACAACCAAGATGAGGAGACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTTGCACACGGCTGCCCACTTCGGCCTTTCGGAGCTGGTGGCCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141887 CCTTGCACACGGCTGCCCACTTCGGCCTTTCGGAGCTGGTGGCCTTCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGGAACACGGGGCCATAGTGGACAGCGTGAATGCCCACATGGAGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141937 GTGGAACACGGGGCCATAGTGGACAGCGTGAATGCCCACATGGAGACCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTGGCCATCGCCGCCTACTGGGCCCTCCGCTTTAAGGAGCAGGAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141987 CCTGGCCATCGCCGCCTACTGGGCCCTCCGCTTTAAGGAGCAGGAGTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCACGGAGCACCACCTGGTCTGCCGCATGCTGCTTGACTACAAAGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142037 GCACGGAGCACCACCTGGTCTGCCGCATGCTGCTTGACTACAAAGCCGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GTCAATGCCCGAGATGACGACTTTAAATCTCCCCTCCACAAGGCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142087 GTCAATGCCCGAGATGACGACTTTAAATCTCCCCTCCACAAGGCAGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GAACTGTGACCACGTGCTCATGCACATGATGCTGGAAGCTGGCGCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142137 GAACTGTGACCACGTGCTCATGCACATGATGCTGGAAGCTGGCGCCGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCAATCTCATGGATATCAACGGCTGTGCTGCCATCCAGTACGTGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142187 CCAATCTCATGGATATCAACGGCTGTGCTGCCATCCAGTACGTGCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GTCACCTCCGTGCGCCCTGCTGCCCAGCCTGAGATCTGCTACCAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142237 GTCACCTCCGTGCGCCCTGCTGCCCAGCCTGAGATCTGCTACCAGCTCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GTTGAACCATGGGGCTGCCCGAATATACCCTCCACAGTTCCATAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 142287 GTTGAACCATGGGGCTGCCCGAATATACCCTCCACAGTTCCATAAGGTG.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979      GTGATACAGGCCTGCCATTCTTGTCCTAAAGCAATTGAAGTTGTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142337 ..CAGGTGATACAGGCCTGCCATTCTTGTCCTAAAGCAATTGAAGTTGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GTCAATGCCTATGAACACATCAGATGGAACACAAAGTGGAGAAGAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150511 GTCAATGCCTATGAACACATCAGATGGAACACAAAGTGGAGAAGAGCTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCCCGATGATGACTTGGAG         AAATACTGGGATTTTTACCACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 150561 CCCCGATGATGACTTGGAGGTA...CAGAAATACTGGGATTTTTACCACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CTCTCTTTACTGTGTGCTGTAACTCTCCAAGGACTCTCATGCACTTATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151622 CTCTCTTTACTGTGTGCTGTAACTCTCCAAGGACTCTCATGCACTTATCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AGATGTGCCATTAGAAGAACATTACACAACAGATGCCATAGAGCAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151672 AGATGTGCCATTAGAAGAACATTACACAACAGATGCCATAGAGCAATTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTTGCTTTCCCTCCCATTGTCATTGAAAAAGTACTTGCTTTTAGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151722 TTTGCTTTCCCTCCCATTGTCATTGAAAAAGTACTTGCTTTTAGAGCCAG

   1300     .    :
   1265 AGGGAATTATTTAT
        ||||||||||||||
 151772 AGGGAATTATTTAT