seq1 = pF1KB7173.tfa, 1590 bp
seq2 = pF1KB7173/gi568815575r_17700421.tfa (gi568815575r:17700421_17902010), 201590 bp

>pF1KB7173 1590
>gi568815575r:17700421_17902010 (ChrX)

(complement)

1-1590  (100001-101590)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGACCTGCAGTCCCAGAACCTCTCCATGGACATGACTGACTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGACCTGCAGTCCCAGAACCTCTCCATGGACATGACTGACTCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTGCCTTGGCTAATAACAGACTGGAGAATGGCATGGCTCAGCTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTGCCTTGGCTAATAACAGACTGGAGAATGGCATGGCTCAGCTGATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCGAGGCCTGGAACATCAACTCCACTGACCTGGTAAAGAAGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCGAGGCCTGGAACATCAACTCCACTGACCTGGTAAAGAAGGCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGACCGTGCCAGCCCCATCCATTCTGAACCCCCCTGCCGAGTCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGACCGTGCCAGCCCCATCCATTCTGAACCCCCCTGCCGAGTCTCAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCATGGCTCTGAAGGTGGCGGCCACTGTGTTGCAGCCCCTGTGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCATGGCTCTGAAGGTGGCGGCCACTGTGTTGCAGCCCCTGTGCCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGAGAGCCCAGTGGTGATGCCCATTCACATGCAGGTGGAGGGAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGAGAGCCCAGTGGTGATGCCCATTCACATGCAGGTGGAGGGAAGCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCACCAGAGCTCAATCCGAATGGCAATGCCACCTACGTCATGACCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCACCAGAGCTCAATCCGAATGGCAATGCCACCTACGTCATGACCACCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCCCCGTGCAACTGCCCGTGGTGCTGGAGCAGCACGTCTTTCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCCCCGTGCAACTGCCCGTGGTGCTGGAGCAGCACGTCTTTCAGCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAACTCCCCTCTGGTCCTGCCGCAGGAGGCCCCATGCTCCTCCAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAACTCCCCTCTGGTCCTGCCGCAGGAGGCCCCATGCTCCTCCAGTACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCACAACAACCTCTTCCAGGGAGCGGAGGACCCCGAGGCCCAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCACAACAACCTCTTCCAGGGAGCGGAGGACCCCGAGGCCCAGCCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTCCTGGACCTGAGGATCCCCAGCCAGCCGCAGGAGCCCACTTTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTCCTGGACCTGAGGATCCCCAGCCAGCCGCAGGAGCCCACTTTGCCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGAAGCTGTGCTCCAGAATTTGTTTCCCTCCCAGGGCACTCTCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGAAGCTGTGCTCCAGAATTTGTTTCCCTCCCAGGGCACTCTCGGGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCACCCTGTCAGCCTCCTCCTGGCTATGCCCCTGTGCCCCCACAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCACCCTGTCAGCCTCCTCCTGGCTATGCCCCTGTGCCCCCACAGCCTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAGCTCCCCCTTGTCCCCCCTGGTCCCACCAGCCACCCTCTTGGTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAGCTCCCCCTTGTCCCCCCTGGTCCCACCAGCCACCCTCTTGGTGCCGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATCCTGTAATCGTCCCCTTGCCTGTGCCAGTCCCTATTCCCATCCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATCCTGTAATCGTCCCCTTGCCTGTGCCAGTCCCTATTCCCATCCCCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCGGTGCCTCAGAGTTCTGAATCCAAGTTCAGCTCCAGTTTCCCCAAGCC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCGATGCCTCAGAGTTCTGAATCCAAGTTCAGCTCCAGTTTCCCCAAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCATCTTCCTTCGGCCTGCACCCCTTTAAAGGCACCCAGACCCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACCATCTTCCTTCGGCCTGCACCCCTTTAAAGGCACCCAGACCCCTCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAAAAGATGAACTGAAGCCCTTTGACATCCTCCAGCCTAAGGAGTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAAAAGATGAACTGAAGCCCTTTGACATCCTCCAGCCTAAGGAGTACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGCTCAGCCGCCACACGGTCATTAAGATGGGAAGTGAGAACGAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGCTCAGCCGCCACACGGTCATTAAGATGGGAAGTGAGAACGAGGCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGATCTCTCCATGAAGTCAGTGCCCTGGCTCAAGGCTGGTGAAGTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGATCTCTCCATGAAGTCAGTGCCCTGGCTCAAGGCTGGTGAAGTCAGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCCCAATCTTCCAGGAAGATGCAGCCCTAGACCTGTCAGTGGCAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCCAATCTTCCAGGAAGATGCAGCCCTAGACCTGTCAGTGGCAGCCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CGGAAATCCGAGCCTCCCCCTGAGACACTGTATGACAGTGGTGCATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CGGAAATCCGAGCCTCCCCCTGAGACACTGTATGACAGTGGTGCATCAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGACAGCTCAGGTCACACAGTGATGGAGAAACTTCCCAGTGGCATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGACAGCTCAGGTCACACAGTGATGGAGAAACTTCCCAGTGGCATGGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTTCTTTTGCCCCTGCCACGTCCCATGAGGCCCCAGCCATGATGGATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTTCTTTTGCCCCTGCCACGTCCCATGAGGCCCCAGCCATGATGGATAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CACATCAGCAGCAGTGATGCTGCTACCGAGATGCTCAGCCAGCCCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CACATCAGCAGCAGTGATGCTGCTACCGAGATGCTCAGCCAGCCCAACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCCCAGCGGCGAAGTCAAGGCTGAAAATAACATTGAGATGGTGGGCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCCCAGCGGCGAAGTCAAGGCTGAAAATAACATTGAGATGGTGGGCGAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCCAGGCGGCCAAGGTCATTGTCTCTGTCGAAGATGCTGTGCCTACCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCCAGGCGGCCAAGGTCATTGTCTCTGTCGAAGATGCTGTGCCTACCATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TTCTGTGGCAAGATCAAAGGCCTCTCAGGGGTGTCCACCAAAAACTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TTCTGTGGCAAGATCAAAGGCCTCTCAGGGGTGTCCACCAAAAACTTCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTTCAAAAGAGAAGACTCCGTGCTTCAGGGCTATGACATCAACAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTTCAAAAGAGAAGACTCCGTGCTTCAGGGCTATGACATCAACAGCCAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GGGAAGAGTCCATGGGAAATGCAGAGCCCCTTAGGAAACCCATCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GGGAAGAGTCCATGGGAAATGCAGAGCCCCTTAGGAAACCCATCAAAAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CGGAGCATAAAGTTAAAGAAAGTGAACTCCCAGGAAATACACATGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CGGAGCATAAAGTTAAAGAAAGTGAACTCCCAGGAAATACACATGCTCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AATCAAAAAACAACGGCTGGCCACCTTTTTTCCAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AATCAAAAAACAACGGCTGGCCACCTTTTTTCCAAGAAAG