seq1 = pF1KB7158.tfa, 1089 bp
seq2 = pF1KB7158/gi568815575f_116072281.tfa (gi568815575f:116072281_116273369), 201089 bp

>pF1KB7158 1089
>gi568815575f:116072281_116273369 (ChrX)

1-1089  (100001-101089)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGCAACTCCACCCTTGCCACTACTAGCAAAAACATTACCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGGCAACTCCACCCTTGCCACTACTAGCAAAAACATTACCAGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTCACTTCGGGCTTGTGAACATCTCTGGCAACAATGAGTCTACCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTCACTTCGGGCTTGTGAACATCTCTGGCAACAATGAGTCTACCTTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGTTCACAGAAACCATCAGATAAGCATTTAGATGCAATTCCTATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGTTCACAGAAACCATCAGATAAGCATTTAGATGCAATTCCTATTCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTACATTATATTTGTAATTGGATTTCTGGTCAATATTGTCGTGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACTACATTATATTTGTAATTGGATTTCTGGTCAATATTGTCGTGGTTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTGTTTTGTTGTCAAAAGGGTCCTAAAAAGGTTTCTAGCATATACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTGTTTTGTTGTCAAAAGGGTCCTAAAAAGGTTTCTAGCATATACATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAACCTCGCTGTGGCTGATTTACTCCTTTTGGCTACTCTTCCTCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAACCTCGCTGTGGCTGATTTACTCCTTTTGGCTACTCTTCCTCTATGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAACCTATTATTCTTATAGATATGACTGGCTCTTTGGACCTGTGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAACCTATTATTCTTATAGATATGACTGGCTCTTTGGACCTGTGATGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAAGTTTTTGGTTCTTTTCTTACCCTGAACATGTTTGCAAGCATTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAAGTTTTTGGTTCTTTTCTTACCCTGAACATGTTTGCAAGCATTTTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTATCACCTGCATGAGTGTTGATAGGTACCAATCTGTCATCTACCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTATCACCTGCATGAGTGTTGATAGGTACCAATCTGTCATCTACCCCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGTCTCAAAGAAGAAATCCCTGGCAAGCATCTTATATAGTTCCCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGTCTCAAAGAAGAAATCCCTGGCAAGCATCTTATATAGTTCCCCTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTGGTGTATGGCCTGTTTGTCCTCATTGCCAACATTTTATTTTCGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTGGTGTATGGCCTGTTTGTCCTCATTGCCAACATTTTATTTTCGAGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAGAACCATTGAATACTTAGGAGTGAATGCTTGCATTATGGCTTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAGAACCATTGAATACTTAGGAGTGAATGCTTGCATTATGGCTTTCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCTGAGAAATATGCCCAATGGTCAGCTGGGATTGCCTTAATGAAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTGAGAAATATGCCCAATGGTCAGCTGGGATTGCCTTAATGAAAAATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTTGGTTTTATTATCCCTTTAATATTCATAGCAACATGCTATTTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTTGGTTTTATTATCCCTTTAATATTCATAGCAACATGCTATTTTGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTAGAAAACACTTACTGAAGACGAATAGCTATGGGAAGAACAGGATAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTAGAAAACACTTACTGAAGACGAATAGCTATGGGAAGAACAGGATAACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGTGACCAAGTCCTGAAGATGGCAGCTGCTGTTGTTCTGGCCTTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGTGACCAAGTCCTGAAGATGGCAGCTGCTGTTGTTCTGGCCTTCATCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTGCTGGCTTCCCTTCCATGTTCTGACCTTCCTGGATGCTCTGGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTGCTGGCTTCCCTTCCATGTTCTGACCTTCCTGGATGCTCTGGCCTGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGGTGTCATTAATAGCTGCGAAGTTATAGCAGTCATTGACCTGGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGGTGTCATTAATAGCTGCGAAGTTATAGCAGTCATTGACCTGGCACTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCTTTTGCCATCCTCTTGGGATTCACCAACAGCTGCGTTAATCCGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCTTTTGCCATCCTCTTGGGATTCACCAACAGCTGCGTTAATCCGTTTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTATTGTTTTGTTGGAAACCGGTTCCAACAGAAGCTCCGCAGTGTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTATTGTTTTGTTGGAAACCGGTTCCAACAGAAGCTCCGCAGTGTGTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGGTTCCAATTACTTGGCTCCAAGGGAAAAGAGAGAGTATGTCTTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGGTTCCAATTACTTGGCTCCAAGGGAAAAGAGAGAGTATGTCTTGCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .
   1051 AAAAGCAGTTCTCTTAGAGAAATGGAGACCTTTGTGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAAAGCAGTTCTCTTAGAGAAATGGAGACCTTTGTGTCT