seq1 = pF1KB7147.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KB7147/gi568815579f_35258891.tfa (gi568815579f:35258891_35371359), 112469 bp

>pF1KB7147 1038
>gi568815579f:35258891_35371359 (Chr19)

1-1038  (100001-101038)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATACAGGCCCCGACCAGTCCTACTTCTCCGGCAATCACTGGTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATACAGGCCCCGACCAGTCCTACTTCTCCGGCAATCACTGGTTCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTCGGTGTACCTTCTCACTTTCCTGGTGGGGCTCCCCCTCAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCTCGGTGTACCTTCTCACTTTCCTGGTGGGGCTCCCCCTCAACCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCCTGGTGGTCTTCGTGGGCAAGCTGCAGCGCCGCCCGGTGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCCTGGTGGTCTTCGTGGGCAAGCTGCAGCGCCGCCCGGTGGCCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGTGCTCCTGCTCAACCTGACCGCCTCGGACCTGCTCCTGCTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGTGCTCCTGCTCAACCTGACCGCCTCGGACCTGCTCCTGCTGCTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGCCTTTCCGCATGGTGGAGGCAGCCAATGGCATGCACTGGCCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGCCTTTCCGCATGGTGGAGGCAGCCAATGGCATGCACTGGCCCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTCATCCTCTGCCCACTCTCTGGATTCATCTTCTTCACCACCATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTTCATCCTCTGCCCACTCTCTGGATTCATCTTCTTCACCACCATCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCACCGCCCTCTTCCTGGCAGCTGTGAGCATTGAACGCTTCCTGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCACCGCCCTCTTCCTGGCAGCTGTGAGCATTGAACGCTTCCTGAGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCACCCACTGTGGTACAAGACCCGGCCGAGGCTGGGGCAGGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCACCCACTGTGGTACAAGACCCGGCCGAGGCTGGGGCAGGCAGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGTGAGTGTGGCCTGCTGGCTGTTGGCCTCTGCTCACTGCAGCGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGTGAGTGTGGCCTGCTGGCTGTTGGCCTCTGCTCACTGCAGCGTGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACGTCATAGAATTCTCAGGGGACATCTCCCACAGCCAGGGCACCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACGTCATAGAATTCTCAGGGGACATCTCCCACAGCCAGGGCACCAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACCTGCTACCTGGAGTTCCGGAAGGACCAGCTAGCCATCCTCCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GACCTGCTACCTGGAGTTCCGGAAGGACCAGCTAGCCATCCTCCTGCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCGGCTGGAGATGGCTGTGGTCCTCTTTGTGGTCCCGCTGATCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCGGCTGGAGATGGCTGTGGTCCTCTTTGTGGTCCCGCTGATCATCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGCTACTGCTACAGCCGCCTGGTGTGGATCCTCGGCAGAGGGGGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGCTACTGCTACAGCCGCCTGGTGTGGATCCTCGGCAGAGGGGGCAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGCCGGCAGAGGAGGGTGGCGGGGCTGTTGGCGGCCACGCTGCTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGCCGGCAGAGGAGGGTGGCGGGGCTGTTGGCGGCCACGCTGCTCAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTTGTCTGCTTTGGGCCCTACAACGCGTCCCATGTCGTGGGCTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTTGTCTGCTTTGGGCCCTACAACGTGTCCCATGTCGTGGGCTATATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGCGGTGAAAGCCCGGCGTGGAGGATCTACGTGACGCTTCTCAGCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGCGGTGAAAGCCCGGCGTGGAGGATCTACGTGACGCTTCTCAGCACCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAACTCCTGTGTCGACCCCTTTGTCTACTACTTCTCCTCCTCCGGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAACTCCTGTGTCGACCCCTTTGTCTACTACTTCTCCTCCTCCGGGTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGCCGACTTTCATGAGCTGCTGAGGAGGTTGTGTGGGCTCTGGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGCCGACTTTCATGAGCTGCTGAGGAGGTTGTGTGGGCTCTGGGGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGGCAGCAGGAGAGCAGCATGGAGCTGAAGGAGCAGAAGGGAGGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100901 TGGCAGCAGGAGAGCAGCATGGAGCTGAAGGAGCAGAAGGGAGGGGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAGAGAGCGGACCGACCAGCTGAAAGAAAGACCAGTGAACACTCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGAGAGCGGACCGACCAGCTGAAAGAAAGACCAGTGAACACTCACAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 GCTGTGGAACTGGTGGCCAGGTGGCCTGTGCTGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCTGTGGAACTGGTGGCCAGGTGGCCTGTGCTGAAAGC