seq1 = pF1KB7144.tfa, 1017 bp
seq2 = pF1KB7144/gi568815575f_78860521.tfa (gi568815575f:78860521_79061537), 201017 bp

>pF1KB7144 1017
>gi568815575f:78860521_79061537 (ChrX)

1-1017  (100001-101017)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAACCTTGACAAATACACTGAAACATTCAAGATGGGTAGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAACCTTGACAAATACACTGAAACATTCAAGATGGGTAGCAACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCAGCACTGCTGAGATTTACTGTAATGTCACTAATGTGAAATTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCAGCACTGCTGAGATTTACTGTAATGTCACTAATGTGAAATTTCAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCCCTCTATGCAACCACCTATATCCTCATATTCATTCCTGGTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCCCTCTATGCAACCACCTATATCCTCATATTCATTCCTGGTCTTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTAACAGTGCAGCCTTGTGGGTTCTGTGCCGCTTCATCAGCAAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTAACAGTGCAGCCTTGTGGGTTCTGTGCCGCTTCATCAGCAAGAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAAAGCCATCATTTTCATGATCAACCTCTCTGTGGCTGACCTTGCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAAAGCCATCATTTTCATGATCAACCTCTCTGTGGCTGACCTTGCTCATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATTATCTTTACCCCTCCGGATTTACTATTACATCAGCCACCACTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATTATCTTTACCCCTCCGGATTTACTATTACATCAGCCACCACTGGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCAGAGAGCCCTTTGCCTGCTCTGCTTCTACCTGAAGTATCTCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCAGAGAGCCCTTTGCCTGCTCTGCTTCTACCTGAAGTATCTCAACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTATGCCAGCATTTGTTTCCTGACGTGCATCAGTCTTCAAAGGTGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTATGCCAGCATTTGTTTCCTGACGTGCATCAGTCTTCAAAGGTGCTTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCTCCTCAAGCCCTTCAGGGCCAGAGACTGGAAGCGTAGGTACGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCTCCTCAAGCCCTTCAGGGCCAGAGACTGGAAGCGTAGGTACGATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCATCAGTGCTGCCATCTGGATCGTTGTGGGGACTGCCTGTTTGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCATCAGTGCTGCCATCTGGATCGTTGTGGGGACTGCCTGTTTGCCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCCCATCCTGAGAAGCACAGACTTAAACAACAACAAGTCCTGCTTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCCCATCCTGAGAAGCACAGACTTAAACAACAACAAGTCCTGCTTTGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCTTGGATACAAGCAAATGAATGCAGTTGCGTTGGTCGGGATGATTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCTTGGATACAAGCAAATGAATGCAGTTGCGTTGGTCGGGATGATTACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTGCTGAGCTTGCAGGATTTGTGATCCCAGTGATCATCATCGCATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTGCTGAGCTTGCAGGATTTGTGATCCCAGTGATCATCATCGCATGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TACCTGGAAAACTACTATATCCTTGAGACAGCCACCAATGGCTTTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TACCTGGAAAACTACTATATCCTTGAGACAGCCACCAATGGCTTTCCAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGATCAGTGAGAGGCAGAAAGCACTGCGGATGGTGTTCATGTGTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGATCAGTGAGAGGCAGAAAGCACTGCGGATGGTGTTCATGTGTGCTGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTCTTCTTCATCTGCTTCACTCCCTATCATATTAACTTTATTTTTTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTCTTCTTCATCTGCTTCACTCCCTATCATATTAACTTTATTTTTTACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGGTAAAGGAAACCATCATTAGCAGTTGTCCCGTTGTCCGAATCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGGTAAAGGAAACCATCATTAGCAGTTGTCCCGTTGTCCGAATCGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTATTTCCACCCTTTTTGCCTGTGCCTTGCAAGTCTCTGCTGCCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTATTTCCACCCTTTTTGCCTGTGCCTTGCAAGTCTCTGCTGCCTTTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATCCAATTCTTTATTACTTTATGGCTTCAGAGTTTCGTGACCAACTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GATCCAATTCTTTATTACTTTATGGCTTCAGAGTTTCGTGACCAACTATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCGCCATGGCAGTTCTGTGACCCGCTCCCGCCTCATGAGCAAGGAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCGCCATGGCAGTTCTGTGACCCGCTCCCGCCTCATGAGCAAGGAGAGTG

   1000     .    :    .
   1001 GTTCATCAATGATTGGC
        |||||||||||||||||
 101001 GTTCATCAATGATTGGC