seq1 = pF1KB7143.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB7143/gi568815575r_78172736.tfa (gi568815575r:78172736_78373746), 201011 bp

>pF1KB7143 1011
>gi568815575r:78172736_78373746 (ChrX)

(complement)

1-1011  (100001-101011)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAAACAGGAAATCTGACAGTATCTTCTGCCACATGCCATGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGAAACAGGAAATCTGACAGTATCTTCTGCCACATGCCATGACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATTGATGACTTCCGCAATCAAGTGTATTCCACCTTGTACTCTATGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATTGATGACTTCCGCAATCAAGTGTATTCCACCTTGTACTCTATGATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTTGTAGGCTTCTTTGGCAATGGCTTTGTGCTCTATGTCCTCATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTTGTAGGCTTCTTTGGCAATGGCTTTGTGCTCTATGTCCTCATAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCTATCACAAGAAGTCAGCCTTCCAAGTATACATGATTAATTTAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCTATCACAAGAAGTCAGCCTTCCAAGTATACATGATTAATTTAGCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCAGATCTACTTTGTGTGTGCACACTGCCTCTCCGTGTGGTCTATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCAGATCTACTTTGTGTGTGCACACTGCCTCTCCGTGTGGTCTATTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCACAAAGGCATTTGGCTCTTTGGTGACTTCTTGTGCCGCCTCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCACAAAGGCATTTGGCTCTTTGGTGACTTCTTGTGCCGCCTCAGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATGCTTTGTATGTCAACCTCTATTGTAGCATCTTCTTTATGACAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATGCTTTGTATGTCAACCTCTATTGTAGCATCTTCTTTATGACAGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCTTTTTCCGGTGCATTGCAATTGTTTTTCCAGTCCAGAACATTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCTTTTTCCGGTGCATTGCAATTGTTTTTCCAGTCCAGAACATTAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGTTACACAGAAAAAAGCCAGGTTTGTGTGTGTAGGTATTTGGATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGTTACACAGAAAAAAGCCAGGTTTGTGTGTGTAGGTATTTGGATTTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGATTTTGACCAGTTCTCCATTTCTAATGGCCAAACCACAAAAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGATTTTGACCAGTTCTCCATTTCTAATGGCCAAACCACAAAAAGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAAAATAATACCAAGTGCTTTGAGCCCCCACAAGACAATCAAACTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAAAATAATACCAAGTGCTTTGAGCCCCCACAAGACAATCAAACTAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCATGTTTTGGTCTTGCATTATGTGTCATTGTTTGTTGGCTTTATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCATGTTTTGGTCTTGCATTATGTGTCATTGTTTGTTGGCTTTATCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCTTTTGTTATTATAATTGTCTGTTACACAATGATCATTTTGACCTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTTTTGTTATTATAATTGTCTGTTACACAATGATCATTTTGACCTTACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAAAAAATCAATGAAAAAAAATCTGTCAAGTCATAAAAAGGCTATAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAAAAAATCAATGAAAAAAAATCTGTCAAGTCATAAAAAGGCTATAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGATCATGGTCGTGACCGCTGCCTTTTTAGTCAGTTTCATGCCATATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGATCATGGTCGTGACCGCTGCCTTTTTAGTCAGTTTCATGCCATATCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTCAACGTACCATTCACCTTCATTTTTTACACAATGAAACTAAACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTCAACGTACCATTCACCTTCATTTTTTACACAATGAAACTAAACCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGATTCTGTCCTTACAATGCAGAAGTCCGTGGTCATAACCTTGTCTCTGG
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGATTCTGTCCTTAGAATGCAGAAGTCCGTGGTCATAACCTTGTCTCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGCATCCAATTGTTGCTTTGACCCTCTCCTATATTTCTTTTCTGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGCATCCAATTGTTGCTTTGACCCTCTCCTATATTTCTTTTCTGGGGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACTTTAGGAAAAGGCTGTCTACATTTAGAAAGCATTCTTTGTCCAGCGT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100901 AACTTTAGGAAAAGGCTGTCTACATTCAGAAAGCATTCTTTGTCCAGCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GACTTATGTACCCAGAAAGAAGGCCTCTTTGCCAGAAAAAGGAGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GACTTATGTACCCAGAAAGAAGGCCTCTTTGCCAGAAAAAGGAGAAGAAA

   1000     .    :
   1001 TATGTAAAGTA
        |||||||||||
 101001 TATGTAAAGTA