seq1 = pF1KB7132.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KB7132/gi568815575f_149784273.tfa (gi568815575f:149784273_149985226), 200954 bp

>pF1KB7132 954
>gi568815575f:149784273_149985226 (ChrX)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCTTGGGCAGAAGAGTCAGCGCTACAAGGCTGAGGAAGGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTCTTGGGCAGAAGAGTCAGCGCTACAAGGCTGAGGAAGGCCTTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCAAGGAGAGGCACCAGGGCTTATGGATGTGCAGATTCCCACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCAAGGAGAGGCACCAGGGCTTATGGATGTGCAGATTCCCACAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGCAGAAGGCTGCATCCTCCTCCTCTACTCTGATCATGGGAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGCAGAAGGCTGCATCCTCCTCCTCTACTCTGATCATGGGAACCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGGTGACTGATTCTGGGTCACCAAGTCCTCCCCAGAGTCCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAGGTGACTGATTCTGGGTCACCAAGTCCTCCCCAGAGTCCTGAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCTCCTCTTCCCTGACTGTCACCGACAGCACTCTGTGGAGCCAATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCTCCTCTTCCCTGACTGTCACCGACAGCACTCTGTGGAGCCAATCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGAGGGTTCCAGCAGCAATGAAGAGGAGGGGCCAAGCACCTCCCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGAGGGTTCCAGCAGCAATGAAGAGGAGGGGCCAAGCACCTCCCCGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCAGCTCACCTGGAGTCCCTGTTCCGGGAAGCACTTGATGAGAAAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCAGCTCACCTGGAGTCCCTGTTCCGGGAAGCACTTGATGAGAAAGTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGTTAGTTCGTTTCCTGCTCCGCAAATATCAAATTAAGGAGCCGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGTTAGTTCGTTTCCTGCTCCGCAAATATCAAATTAAGGAGCCGGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAAAGGCAGAAATGCTTGAGAGTGTCATCAAAAATTACAAGAACCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAAAGGCAGAAATGCTTGAGAGTGTCATCAAAAATTACAAGAACCACTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGATATCTTCAGCAAAGCCTCTGAGTGCATGCAGGTGATCTTTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGATATCTTCAGCAAAGCCTCTGAGTGCATGCAGGTGATCTTTGGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGATGTGAAGGAAGTGGACCCTGCCGGCCACTCCTACATCCTTGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGATGTGAAGGAAGTGGACCCTGCCGGCCACTCCTACATCCTTGTCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTGGGCCTCTCCTATGATGGCCTGCTGGGTGATGATCAGAGTACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTGGGCCTCTCCTATGATGGCCTGCTGGGTGATGATCAGAGTACGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGACCGGCCTCCTGATAATCGTCCTGGGCATGATCTTAATGGAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGACCGGCCTCCTGATAATCGTCCTGGGCATGATCTTAATGGAGGGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCGCGCCCCGGAGGAGGCAATCTGGGAAGCGTTGAGTGTGATGGGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCGCGCCCCGGAGGAGGCAATCTGGGAAGCGTTGAGTGTGATGGGGCTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGATGGGAGGGAGCACAGTGTCTATTGGAAGCTCAGGAAGCTGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGATGGGAGGGAGCACAGTGTCTATTGGAAGCTCAGGAAGCTGCTCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAAGAGTGGGTGCAGGAGAACTACCTGGAGTACCGCCAGGCGCCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAAGAGTGGGTGCAGGAGAACTACCTGGAGTACCGCCAGGCGCCCGGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGATCCTGTGCGCTACGAGTTCCTGTGGGGTCCAAGGGCCCTTGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGATCCTGTGCGCTACGAGTTCCTGTGGGGTCCAAGGGCCCTTGCTGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAGCTATGTGAAAGTCCTGGAGCATGTGGTCAGGGTCAATGCAAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAGCTATGTGAAAGTCCTGGAGCATGTGGTCAGGGTCAATGCAAGAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGCATTTCCTACCCATCCCTGCATGAAGAGGCTTTGGGAGAGGAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGCATTTCCTACCCATCCCTGCATGAAGAGGCTTTGGGAGAGGAGAAAGG

    950 
    951 AGTT
        ||||
 100951 AGTT