seq1 = pF1KB7131.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KB7131/gi568815587f_4552530.tfa (gi568815587f:4552530_4753480), 200951 bp

>pF1KB7131 951
>gi568815587f:4552530_4753480 (Chr11)

1-951  (100001-100951)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGATCCCAATGGCAATGAATCCAGTGCTACATACTTCATCCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGATCCCAATGGCAATGAATCCAGTGCTACATACTTCATCCTAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCCTCCCTGGTTTAGAAGAGGCTCAGTTCTGGTTGGCCTTCCCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGCCTCCCTGGTTTAGAAGAGGCTCAGTTCTGGTTGGCCTTCCCATTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCCTCTACCTTATTGCTGTGCTAGGTAACTTGACAATCATCTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCCTCTACCTTATTGCTGTGCTAGGTAACTTGACAATCATCTACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCGGACTGAGCACAGCCTGCATGAGCCCATGTATATATTTCTTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCGGACTGAGCACAGCCTGCATGAGCCCATGTATATATTTCTTTGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTTTCAGGCATTGACATCCTCATCTCCACCTCATCCATGCCCAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTTTCAGGCATTGACATCCTCATCTCCACCTCATCCATGCCCAAAATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCATCTTCTGGTTCAATTCCACTACCATCCAGTTTGATGCTTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCATCTTCTGGTTCAATTCCACTACCATCCAGTTTGATGCTTGTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTACAGATGTTTGCCATCCACTCCTTATCTGGCATGGAATCCACAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTACAGATGTTTGCCATCCACTCCTTATCTGGCATGGAATCCACAGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGCCATGGCTTTTGACCGCTATGTGGCCATCTGTCACCCACTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGCCATGGCTTTTGACCGCTATGTGGCCATCTGTCACCCACTGCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCCACAGTACTTACGTTGCCTCGTGTCACCAAAATTGGTGTGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCCACAGTACTTACGTTGCCTCGTGTCACCAAAATTGGTGTGGCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGTGCGGGGGGCTGCACTGATGGCACCCCTTCCTGTCTTCATCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGTGCGGGGGGCTGCACTGATGGCACCCCTTCCTGTCTTCATCAAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGCCCTTCTGCCGCTCCAATATCCTTTCCCATTCCTACTGCCTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGCCCTTCTGCCGCTCCAATATCCTTTCCCATTCCTACTGCCTACACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGATGTCATGAAGCTGGCCTGTGATGATATCCGGGTCAATGTCGTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGATGTCATGAAGCTGGCCTGTGATGATATCCGGGTCAATGTCGTCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCCTTATCGTCATCATCTCCGCCATTGGCCTGGACTCACTTCTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCCTTATCGTCATCATCTCCGCCATTGGCCTGGACTCACTTCTCATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCTCATATCTGCTTATTCTTAAGACTGTGTTGGGCTTGACACGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTCTCATATCTGCTTATTCTTAAGACTGTGTTGGGCTTGACACGTGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCAGGCCAAGGCATTTGGCACTTGCGTCTCTCATGTGTGTGCTGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCAGGCCAAGGCATTTGGCACTTGCGTCTCTCATGTGTGTGCTGTGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATATTCTATGTACCTTTCATTGGATTGTCCATGGTGCATCGCTTTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATATTCTATGTACCTTTCATTGGATTGTCCATGGTGCATCGCTTTAGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCGGCGTGACTCTCCGCTGCCCGTCATCTTGGCCAATATCTATCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCGGCGTGACTCTCCGCTGCCCGTCATCTTGGCCAATATCTATCTGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTCCTCCTGTGCTCAACCCAATTGTCTATGGAGTGAAGACAAAGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTCCTCCTGTGCTCAACCCAATTGTCTATGGAGTGAAGACAAAGGAGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGACAGCGCATCCTTCGACTTTTCCATGTGGCCACACACGCTTCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGACAGCGCATCCTTCGACTTTTCCATGTGGCCACACACGCTTCAGAGCC

    950 
    951 C
        |
 100951 C