seq1 = pF1KB7127.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KB7127/gi568815575f_152600833.tfa (gi568815575f:152600833_152801774), 200942 bp

>pF1KB7127 942
>gi568815575f:152600833_152801774 (ChrX)

1-942  (100001-100942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCTTGAGCAGAGGAGTCAGCACTGCAAGCCTGAAGAAGGCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCTTGAGCAGAGGAGTCAGCACTGCAAGCCTGAAGAAGGCCTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCGAGGAGAGGCCCTGGGCCTGGTGGGTGCGCAGGCTCCTGCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCGAGGAGAGGCCCTGGGCCTGGTGGGTGCGCAGGCTCCTGCTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGCAGGAGGCTGCCTCCTCCTCTTCTACTCTAGTTGAAGTCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGCAGGAGGCTGCCTCCTCCTCTTCTACTCTAGTTGAAGTCACCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGGAGGTGCCTGCTGCCGAGTCACCAGATCCTCCCCAGAGTCCTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGGAGGTGCCTGCTGCCGAGTCACCAGATCCTCCCCAGAGTCCTCAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCCTCCAGCCTCCCCACTACCATGAACTACCCTCTCTGGAGCCAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCCTCCAGCCTCCCCACTACCATGAACTACCCTCTCTGGAGCCAATCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGAGGACTCCAGCAACCAAGAAGAGGAGGGGCCAAGCACCTTCCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGAGGACTCCAGCAACCAAGAAGAGGAGGGGCCAAGCACCTTCCCTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGAGTCCGAGTTCCAAGCAGCACTCAGTAGGAAGGTGGCCGAGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGAGTCCGAGTTCCAAGCAGCACTCAGTAGGAAGGTGGCCGAGTTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCATTTTCTGCTCCTCAAGTATCGAGCCAGGGAGCCGGTCACAAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCATTTTCTGCTCCTCAAGTATCGAGCCAGGGAGCCGGTCACAAAGGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAATGCTGGGGAGTGTCGTCGGAAATTGGCAGTATTTCTTTCCTGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAATGCTGGGGAGTGTCGTCGGAAATTGGCAGTATTTCTTTCCTGTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCAGCAAAGCTTCCAGTTCCTTGCAGCTGGTCTTTGGCATCGAGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCAGCAAAGCTTCCAGTTCCTTGCAGCTGGTCTTTGGCATCGAGCTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAAGTGGACCCCATCGGCCACTTGTACATCTTTGCCACCTGCCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAAGTGGACCCCATCGGCCACTTGTACATCTTTGCCACCTGCCTGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTCCTACGATGGCCTGCTGGGTGACAATCAGATCATGCCCAAGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTCCTACGATGGCCTGCTGGGTGACAATCAGATCATGCCCAAGGCAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCCTGATAATCGTCCTGGCCATAATCGCAAGAGAGGGCGACTGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCCTGATAATCGTCCTGGCCATAATCGCAAGAGAGGGCGACTGTGCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAGGAGAAAATCTGGGAGGAGCTGAGTGTGTTAGAGGTGTTTGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAGGAGAAAATCTGGGAGGAGCTGAGTGTGTTAGAGGTGTTTGAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGAAGACAGTATCTTGGGGGATCCCAAGAAGCTGCTCACCCAACATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGAAGACAGTATCTTGGGGGATCCCAAGAAGCTGCTCACCCAACATTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGCAGGAAAACTACCTGGAGTACCGGCAGGTCCCCGGCAGTGATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGCAGGAAAACTACCTGGAGTACCGGCAGGTCCCCGGCAGTGATCCTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATGTTATGAATTCCTGTGGGGTCCAAGGGCCCTCGTTGAAACCAGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATGTTATGAATTCCTGTGGGGTCCAAGGGCCCTCGTTGAAACCAGCTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAAAGTCCTGCACCATATGGTAAAGATCAGTGGAGGACCTCACATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAAAGTCCTGCACCATATGGTAAAGATCAGTGGAGGACCTCACATTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TACCCACCCCTGCATGAGTGGGTTTTGAGAGAGGGGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TACCCACCCCTGCATGAGTGGGTTTTGAGAGAGGGGGAAGAG