seq1 = pF1KB7125.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KB7125/gi568815587r_5051434.tfa (gi568815587r:5051434_5252369), 200936 bp

>pF1KB7125 936
>gi568815587r:5051434_5252369 (Chr11)

(complement)

1-936  (100001-100936)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCATTTCCAACATCACAGTCTACATGCCCTCTGTGTTGACACTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCATTTCCAACATCACAGTCTACATGCCCTCTGTGTTGACACTAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGGATCCCAGGCCTAGAATCTGTGCAGTGCTGGATTGGGATTCCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGGATCCCAGGCCTAGAATCTGTGCAGTGCTGGATTGGGATTCCATTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCCATTTATCTCATTGCTATGATTGGAAATTCCTTGCTTCTGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCCATTTATCTCATTGCTATGATTGGAAATTCCTTGCTTCTGAGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCAAATCTGAGCGCAGTCTCCATGAGCCCTTGTACATTTTCTTAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCAAATCTGAGCGCAGTCTCCATGAGCCCTTGTACATTTTCTTAGGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTAGGAGCCACAGACATTGCACTTGCTAGCAGCATTATGCCAAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTAGGAGCCACAGACATTGCACTTGCTAGCAGCATTATGCCAAAGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGGAATATTCTGGTTTAATGTGCCTGAAATCTATTTTGATTCCTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGGAATATTCTGGTTTAATGTGCCTGAAATCTATTTTGATTCCTGCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTCAAATGTGGTTCATCCACACATTGCAGGGTATAGAGTCAGGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTCAAATGTGGTTCATCCACACATTGCAGGGTATAGAGTCAGGCATCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTGGCCATGGCCCTGGACCGTTATGTGGCCATCTGTTATCCACTAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTGGCCATGGCCCTGGACCGTTATGTGGCCATCTGTTATCCACTAAGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCCAACATCTTCACCCACCAGCTTGTCATTCAGATAGGAACTATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCCAACATCTTCACCCACCAGCTTGTCATTCAGATAGGAACTATGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTACTCAGGGCTGCTATTCTTGTAGCCCCATGCCTAGTACTGATAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTACTCAGGGCTGCTATTCTTGTAGCCCCATGCCTAGTACTGATAAAGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGGTTTCAATTTTATCACACAACAGTCATCTCCCACTCCTACTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGGTTTCAATTTTATCACACAACAGTCATCTCCCACTCCTACTGTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATATGGCCATTGTGAAACTAGCAGCAGCAAATGTTCAAGTCAACAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATATGGCCATTGTGAAACTAGCAGCAGCAAATGTTCAAGTCAACAAAATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TATGGTTTGTTTGTGGCCTTCACTGTAGCAGGATTTGACCTCACATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TATGGTTTGTTTGTGGCCTTCACTGTAGCAGGATTTGACCTCACATTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACATTGTCCTACATCCAGATATTTATCACAGTTTTTCGTTTGCCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACATTGTCCTACATCCAGATATTTATCACAGTTTTTCGTTTGCCCCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGAGGCTAGGTTTAAAGCATTCAATACCTGCATTGCTCACATCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGAGGCTAGGTTTAAAGCATTCAATACCTGCATTGCTCACATCTGTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCCTCCAGTTCTACCTCCTTGCCTTCTTCTCCTTCTTCACACATAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCCTCCAGTTCTACCTCCTTGCCTTCTTCTCCTTCTTCACACATAGGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGGTCTCACATCCCCCCTTATATCCATATTCTCTTTTCTAGCATTTACT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGGTCTCACATCTCCCCTTATATCCATATTCTCTTTTCTAGCATTTACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGGTCCCTCCATTTCTCAATCCACTTGTCTATGGTGCAAAGACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGGTCCCTCCATTTCTCAATCCACTTGTCTATGGTGCAAAGACCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CAGATTCGCATTCATGTGGTAAAAATGTTCTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGATTCGCATTCATGTGGTAAAAATGTTCTGTTCA