seq1 = pF1KB7119.tfa, 861 bp
seq2 = pF1KB7119/gi568815592f_144086628.tfa (gi568815592f:144086628_144287488), 200861 bp

>pF1KB7119 861
>gi568815592f:144086628_144287488 (Chr6)

1-861  (100001-100861)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGACCGGCTAGCAGAACTTCTGGACTTGTCCAAGCAATATGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGACCGGCTAGCAGAACTTCTGGACTTGTCCAAGCAATATGACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGTTCCCAGACGGGGACGATGAGTTTGACTCGCCCCACGAGGACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGTTCCCAGACGGGGACGATGAGTTTGACTCGCCCCACGAGGACATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTCGAGACGGACCACATCCTGGAGTCCCTGTACCGAGACATCCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTCGAGACGGACCACATCCTGGAGTCCCTGTACCGAGACATCCGGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTCAGGATGAAAACCAGCTGCTGGTGGCCGACGTGAAGCGGCTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTCAGGATGAAAACCAGCTGCTGGTGGCCGACGTGAAGCGGCTGGGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGAACGCCCGCTTCCTCACGTCCATGCGGCGCCTCAGCAGCATCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGAACGCCCGCTTCCTCACGTCCATGCGGCGCCTCAGCAGCATCAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGACACCAACTCCATCGCCAAGGCCATCAAGGCCCGGGGCGAGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGACACCAACTCCATCGCCAAGGCCATCAAGGCCCGGGGCGAGGTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACTGCAAGCTGCGCGCCATGAAGGAGCTGAGCGAGGCGGCTGAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CACTGCAAGCTGCGCGCCATGAAGGAGCTGAGCGAGGCGGCTGAGGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCACGGCCCGCACTCGGCAGTGGCGCGCATTTCGCGGGCGCAGTACAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCACGGCCCGCACTCGGCAGTGGCGCGCATTTCGCGGGCGCAGTACAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCTCACCCTCACCTTCCAGCGCGCCATGCACGACTACAACCAGGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCTCACCCTCACCTTCCAGCGCGCCATGCACGACTACAACCAGGCCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGAAGCAGCGCGACAACTGCAAGATCCGCATCCAGCGCCAGCTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGAAGCAGCGCGACAACTGCAAGATCCGCATCCAGCGCCAGCTGGAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGGGCAAGGAAGTCTCGGGCGACCAGATCGAGGACATGTTCGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGGGCAAGGAAGTCTCGGGCGACCAGATCGAGGACATGTTCGAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTAAGTGGGACGTGTTTTCCGAGAACTTGCTGGCCGACGTGAAGGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTAAGTGGGACGTGTTTTCCGAGAACTTGCTGGCCGACGTGAAGGGCGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGGCCGCCCTCAACGAGATCGAGAGCCGCCACCGCGAACTGCTGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGGCCGCCCTCAACGAGATCGAGAGCCGCCACCGCGAACTGCTGCGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGAGCCGCATCCGCGACGTACACGAGCTCTTCTTGCAGATGGCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGAGCCGCATCCGCGACGTACACGAGCTCTTCTTGCAGATGGCGGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGTGGAGAAGCAGGCCGACACCCTGAACGTCATCGAGCTCAACGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGTGGAGAAGCAGGCCGACACCCTGAACGTCATCGAGCTCAACGTACAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGACGGTCGACTACACCGGCCAGGCCAAGGCGCAGGTGCGGAAGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGACGGTCGACTACACCGGCCAGGCCAAGGCGCAGGTGCGGAAGGCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCAGTACGAGGAGAAGAACCCCTGCCGGACCCTCTGCTGCTTCTGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCAGTACGAGGAGAAGAACCCCTGCCGGACCCTCTGCTGCTTCTGCTGTC

    850     .    :
    851 CCTGCCTCAAG
        |||||||||||
 100851 CCTGCCTCAAG