seq1 = pF1KB7117.tfa, 849 bp
seq2 = pF1KB7117/gi568815575f_71123708.tfa (gi568815575f:71123708_71324556), 200849 bp

>pF1KB7117 849
>gi568815575f:71123708_71324556 (ChrX)

1-849  (100001-100849)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTGGACAGGTTTGTACACCTTGCTCAGTGGCGTGAACCGGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTGGACAGGTTTGTACACCTTGCTCAGTGGCGTGAACCGGCATTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACTGCCATTGGCCGAGTATGGCTCTCGGTCATCTTCATCTTCAGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACTGCCATTGGCCGAGTATGGCTCTCGGTCATCTTCATCTTCAGAATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGCTGGTGGTGGCTGCAGAGAGTGTGTGGGGTGATGAGAAATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGCTGGTGGTGGCTGCAGAGAGTGTGTGGGGTGATGAGAAATCTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCATCTGCAACACACTCCAGCCTGGCTGCAACAGCGTTTGCTATGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCATCTGCAACACACTCCAGCCTGGCTGCAACAGCGTTTGCTATGACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTCTTCCCCATCTCCCATGTGCGGCTGTGGTCCCTGCAGCTCATCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTCTTCCCCATCTCCCATGTGCGGCTGTGGTCCCTGCAGCTCATCCTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTCCACCCCAGCTCTCCTCGTGGCCATGCACGTGGCTCACCAGCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTCCACCCCAGCTCTCCTCGTGGCCATGCACGTGGCTCACCAGCAACAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATAGAGAAGAAAATGCTACGGCTTGAGGGCCATGGGGACCCCCTACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATAGAGAAGAAAATGCTACGGCTTGAGGGCCATGGGGACCCCCTACACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGGAGGTGAAGAGGCACAAGGTCCACATCTCAGGGACACTGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAGGAGGTGAAGAGGCACAAGGTCCACATCTCAGGGACACTGTGGTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTATGTCATCAGCGTGGTGTTCCGGCTGTTGTTTGAGGCCGTCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTATGTCATCAGCGTGGTGTTCCGGCTGTTGTTTGAGGCCGTCTTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATGTCTTTTATCTGCTCTACCCTGGCTATGCCATGGTGCGGCTGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATGTCTTTTATCTGCTCTACCCTGGCTATGCCATGGTGCGGCTGGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGCGACGTCTACCCCTGCCCCAACACAGTGGACTGCTTCGTGTCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGCGACGTCTACCCCTGCCCCAACACAGTGGACTGCTTCGTGTCCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCACCGAGAAAACCGTCTTCACCGTCTTCATGCTAGCTGCCTCTGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCACCGAGAAAACCGTCTTCACCGTCTTCATGCTAGCTGCCTCTGGCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGCATCATCCTCAATGTGGCCGAGGTGGTGTACCTCATCATCCGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGCATCATCCTCAATGTGGCCGAGGTGGTGTACCTCATCATCCGGGCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCCCGCCGAGCCCAGCGCCGCTCCAATCCACCTTCCCGCAAGGGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCCCGCCGAGCCCAGCGCCGCTCCAATCCACCTTCCCGCAAGGGCTCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTTCGGCCACCGCCTCTCACCTGAATACAAGCAGAATGAGATCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTTCGGCCACCGCCTCTCACCTGAATACAAGCAGAATGAGATCAACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCTGAGTGAGCAGGATGGCTCCCTGAAAGACATACTGCGCCGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCTGAGTGAGCAGGATGGCTCCCTGAAAGACATACTGCGCCGCAGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    801 TGGCACCGGGGCTGGGCTGGCTGAAAAGAGCGACCGCTGCTCGGCCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGCACCGGGGCTGGGCTGGCTGAAAAGAGCGACCGCTGCTCGGCCTGC