seq1 = pF1KB7107.tfa, 687 bp
seq2 = pF1KB7107/gi568815581f_16281908.tfa (gi568815581f:16281908_16482594), 200687 bp

>pF1KB7107 687
>gi568815581f:16281908_16482594 (Chr17)

1-687  (100001-100687)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTTACCGGCAAGACCATCACCCTTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGATCTTCGTGAAAACCCTTACCGGCAAGACCATCACCCTTGAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGCATTCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGATGGCCGTACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGACCGGCAAGACCATCACCCTGGAAGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATGTGAAGGCCAAGATCCAGGATAAAGAAGGCATCCCTCCCGACCAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTACAACATCCAGAAGGAGTCGACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGTGGTATGCAGATCTTCGTGAAGACCCTGACCGGCAAGACCATCACTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGGTGGAGCCCAGTGACACCATCGAAAATGTGAAGGCCAAGATCCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATAAAGAAGGCATCCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATAAAGAAGGCATCCCCCCCGACCAGCAGAGGCTCATCTTTGCAGGCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGACTACAACATCCAGAAAGAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .
    651 GACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGGGGTGGCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GACCCTGCACCTGGTCCTGCGCCTGAGGGGTGGCTGT