seq1 = pF1KB7106.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KB7106/gi568815585r_20088904.tfa (gi568815585r:20088904_20289581), 200678 bp

>pF1KB7106 678
>gi568815585r:20088904_20289581 (Chr13)

(complement)

1-678  (100001-100678)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTGGGGCACGCTGCAGACGATCCTGGGGGGTGTGAACAAACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTGGGGCACGCTGCAGACGATCCTGGGGGGTGTGAACAAACACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCAGCATTGGAAAGATCTGGCTCACCGTCCTCTTCATTTTTCGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCAGCATTGGAAAGATCTGGCTCACCGTCCTCTTCATTTTTCGCATTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATCCTCGTTGTGGCTGCAAAGGAGGTGTGGGGAGATGAGCAGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATCCTCGTTGTGGCTGCAAAGGAGGTGTGGGGAGATGAGCAGGCCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGTCTGCAACACCCTGCAGCCAGGCTGCAAGAACGTGTGCTACGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGTCTGCAACACCCTGCAGCCAGGCTGCAAGAACGTGTGCTACGATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACTTCCCCATCTCCCACATCCGGCTATGGGCCCTGCAGCTGATCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACTTCCCCATCTCCCACATCCGGCTATGGGCCCTGCAGCTGATCTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTCCACGCCAGCGCTCCTAGTGGCCATGCACGTGGCCTACCGGAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTCCACGCCAGCGCTCCTAGTGGCCATGCACGTGGCCTACCGGAGACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGAAGAAGAGGAAGTTCATCAAGGGGGAGATAAAGAGTGAATTTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGAAGAAGAGGAAGTTCATCAAGGGGGAGATAAAGAGTGAATTTAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCGAGGAGATCAAAACCCAGAAGGTCCGCATCGAAGGCTCCCTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCGAGGAGATCAAAACCCAGAAGGTCCGCATCGAAGGCTCCCTGTGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGACCTACACAAGCAGCATCTTCTTCCGGGTCATCTTCGAAGCCGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGACCTACACAAGCAGCATCTTCTTCCGGGTCATCTTCGAAGCCGCCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGTACGTCTTCTATGTCATGTACGACGGCTTCTCCATGCAGCGGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGTACGTCTTCTATGTCATGTACGACGGCTTCTCCATGCAGCGGCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGTGCAACGCCTGGCCTTGTCCCAACACTGTGGACTGCTTTGTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGTGCAACGCCTGGCCTTGTCCCAACACTGTGGACTGCTTTGTGTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCCCACGGAGAAGACTGTCTTCACAGTGTTCATGATTGCAGTGTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCCCACGGAGAAGACTGTCTTCACAGTGTTCATGATTGCAGTGTCTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTTGCATCCTGCTGAATGTCACTGAATTGTGTTATTTGCTAATTAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTTGCATCCTGCTGAATGTCACTGAATTGTGTTATTTGCTAATTAGATA

    650     .    :    .    :    .
    651 TTGTTCTGGGAAGTCAAAAAAGCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTGTTCTGGGAAGTCAAAAAAGCCAGTT