seq1 = pF1KB7102.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB7102/gi568815593f_113333583.tfa (gi568815593f:113333583_113534233), 200651 bp

>pF1KB7102 651
>gi568815593f:113333583_113534233 (Chr5)

1-651  (100001-100651)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGTTACCAAGTTCAAGGGGAGAGAGAAGAAGCTGATGAAAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGTTACCAAGTTCAAGGGGAGAGAGAAGAAGCTGATGAAAATAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTCATCTGGGACTGCCTTCCTTCTCTGGCTCCACCCTTGACTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTCATCTGGGACTGCCTTCCTTCTCTGGCTCCACCCTTGACTTCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGCTTGGGCTTTAAGCCGTGAGCTCCATCTCATTCCCTGGGCCGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGCTTGGGCTTTAAGCCGTGAGCTCCATCTCATTCCCTGGGCCGCAAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTCACTGGGCCCGCGTCTCTGGAGGCTGTTGGGGGGGCCCTTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTCACTGGGCCCGCGTCTCTGGAGGCTGTTGGGGGGGCCCTTCCTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCCATAGTCGACGGCTTGCTGGGGAAACCCAGGATCTCCGACTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTCCATAGTCGACGGCTTGCTGGGGAAACCCAGGATCTCCGACTGCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GACATTTGCATTGCTGTCCCCTCGGGTTTTGTCTCAGGCTGTGCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GACATTTGCATTGCTGTCCCCTCGGGTTTTGTCTCAGGCTGTGCCTGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTGCCTCTCCCTCAGGCTCCAGCTTGGTGGCAGACTTCTTGTCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTGCCTCTCCCTCAGGCTCCAGCTTGGTGGCAGACTTCTTGTCAGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGGTTCGGGGGTCCACAAGGGTTCAGTTCCCCGGGAACTCTCCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGGTTCGGGGGTCCACAAGGGTTCAGTTCCCCGGGAACTCTCCCCCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGTTGATGGCCACAGAGGGAGATCCCCGTGCCTTGGGCTGCATCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGTTGATGGCCACAGAGGGAGATCCCCGTGCCTTGGGCTGCATCCAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGCTGAGGATCTCGTCGATGTGGAGCCGCCGGTTGACGTCGGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGCTGAGGATCTCGTCGATGTGGAGCCGCCGGTTGACGTCGGGCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCATGTGGTAGATGAGGTCCTTGCACTCGCCTGTCAGGTGCTTGGAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCATGTGGTAGATGAGGTCCTTGCACTCGCCTGTCAGGTGCTTGGAGCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGAAGTTGACGCGGTGCTCCTTCTGGATACGCAGCATCTTCTTGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGAAGTTGACGCGGTGCTCCTTCTGGATACGCAGCATCTTCTTGATGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGAGTCGTCGTAGGGCATGGAGCCGCAGACCATGATGTAGAGGATCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGAGTCGTCGTAGGGCATGGAGCCGCAGACCATGATGTAGAGGATCACGC

    650 
    651 C
        |
 100651 C