seq1 = pF1KB7101.tfa, 639 bp
seq2 = pF1KB7101/gi568815575r_52847950.tfa (gi568815575r:52847950_53048588), 200639 bp

>pF1KB7101 639
>gi568815575r:52847950_53048588 (ChrX)

1-639  (59277-59915)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCACTCCAGAAACGGAATCCAGCATCGCCTTCCAAATCTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59277 ATGGATCCACTCCAGAAACGGAATCCAGCATCGCCTTCCAAATCTTCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGACAGCTGCAGAGACTTCCCAGGAAGGTCCAGCGCCCTCTCAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59327 GATGACAGCTGCAGAGACTTCCCAGGAAGGTCCAGCGCCCTCTCAGCCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTACTCAGAACAGCCGATGATGGGCCTCAGTAACCTGAGCCCCGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59377 CGTACTCAGAACAGCCGATGATGGGCCTCAGTAACCTGAGCCCCGGTCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCCAGCCAGGCCGTGCCTCTCCCAGAGGGGCTGCTCCGCCAGCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59427 GGCCCCAGCCAGGCCGTGCCTCTCCCAGAGGGGCTGCTCCGCCAGCGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGAGAGGAGAAGACCCTGGAAGAGCGGCGGTGGGAGAGGCTGGAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59477 CAGAGAGGAGAAGACCCTGGAAGAGCGGCGGTGGGAGAGGCTGGAGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCAGAGGAAGAAAGCATTCCTGCGGCATGTGAGGAGGAGACACCGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59527 TTCAGAGGAAGAAAGCATTCCTGCGGCATGTGAGGAGGAGACACCGCGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACATGGCCCCCTATGCTGTTGGGAGGGAAGCCAGAATCTCCCCATTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59577 CACATGGCCCCCTATGCTGTTGGGAGGGAAGCCAGAATCTCCCCATTAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACAGAAGTCAGAATCGATTCCGATGTGAATGTCGATACTGCCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59627 TGACAGAAGTCAGAATCGATTCCGATGTGAATGTCGATACTGCCAGAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACAGGCCGAATCTTTCTGGGATCCCTGGGGAGAGTAACAGGGCCCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59677 ACAGGCCGAATCTTTCTGGGATCCCTGGGGAGAGTAACAGGGCCCCACAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCTCCTCCTGGGAGACGCTGGTGCAGGGCCTCAGTGGCTTGACTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59727 CCCTCCTCCTGGGAGACGCTGGTGCAGGGCCTCAGTGGCTTGACTCTCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTAGGCACCAACCAGCCCGGGCCTCTGCCTGAAGCGGCACTCCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59777 CCTAGGCACCAACCAGCCCGGGCCTCTGCCTGAAGCGGCACTCCAGCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGAGACAGAGGAGAAGCGCCAGCGAGAGAGGCAGCAGGAGAGCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59827 AGGAGACAGAGGAGAAGCGCCAGCGAGAGAGGCAGCAGGAGAGCAAAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .
    601 ATGTTTCAGAGGCTGCTCAAGCAGTGGTTAGAGGAAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  59877 ATGTTTCAGAGGCTGCTCAAGCAGTGGTTAGAGGAAAAC