seq1 = pF1KB7091.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB7091/gi568815597f_151058698.tfa (gi568815597f:151058698_151259249), 200552 bp

>pF1KB7091 552
>gi568815597f:151058698_151259249 (Chr1)

1-552  (100001-100552)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCCTTCAGCTCAAAGAGCCTGGCACTGCAAGCAGAGAAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTCCTTCAGCTCAAAGAGCCTGGCACTGCAAGCAGAGAAGAAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTGAGTAAGATGGCGGGTCGCTCTGTGGCTCATCTCTTCATAGATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTGAGTAAGATGGCGGGTCGCTCTGTGGCTCATCTCTTCATAGATGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAGCAGTGAGGTGCTAGATGAGCTCTACCGTGTGTCCAAGGAGTACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAAGCAGTGAGGTGCTAGATGAGCTCTACCGTGTGTCCAAGGAGTACACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACAGCCGGCCCCAGGCCCAGCGCGTGATCAAGGACCTGATCAAAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACAGCCGGCCCCAGGCCCAGCGCGTGATCAAGGACCTGATCAAAGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCAAGGTGGCTGTGCTGCACCGCAATGGCTCCTTTGGCCCCAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCAAGGTGGCTGTGCTGCACCGCAATGGCTCCTTTGGCCCCAGTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCCTGGCTACCCGCTTTCGCCAGAAGCTGCGGCAGGGTGCCATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCCTGGCTACCCGCTTTCGCCAGAAGCTGCGGCAGGGTGCCATGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCACTTAGCTTTGGTGAGGTAGACTTCACCTTCGAGGCTGCTGTTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCACTTAGCTTTGGTGAGGTAGACTTCACCTTCGAGGCTGCTGTTCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGCCTGCTGACCGAGTGCCGGGATGTGCTGCTAGAGTTGGTGGAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGCCTGCTGACCGAGTGCCGGGATGTGCTGCTAGAGTTGGTGGAACACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCTCACGCCCAAGTCACATGGCCGCATCCGCCACGTGTTTGATCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCTCACGCCCAAGTCACATGGCCGCATCCGCCACGTGTTTGATCACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCTGACCCAGGTCTGCTCACGGCCCTCTATGGGCCTGACTTCACTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCTGACCCAGGTCTGCTCACGGCCCTCTATGGGCCTGACTTCACTCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTTGGCAAGATCTGTGACGGACTCAGGAAGCTGCTAGACGAAGGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTTGGCAAGATCTGTGACGGACTCAGGAAGCTGCTAGACGAAGGGAAGC

    550 
    551 TC
        ||
 100551 TC