seq1 = pF1KB7087.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KB7087/gi568815581r_55620669.tfa (gi568815581r:55620669_55821070), 200402 bp

>pF1KB7087 402
>gi568815581r:55620669_55821070 (Chr17)

(complement)

1-402  (100001-100402)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGAAGAGCCCATCAAGGAGATCCTGGGAGCCCCAAAGGCTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGAAGAGCCCATCAAGGAGATCCTGGGAGCCCCAAAGGCTCACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAGCGACGATGGAGAAGAGCCCCAAGAGTGAAGTTGTGATCACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCAGCGACGATGGAGAAGAGCCCCAAGAGTGAAGTTGTGATCACCACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCTCTGGTCAGTGAGATTCAGTTGATGGCTGCTACAGGGGGTACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCTCTGGTCAGTGAGATTCAGTTGATGGCTGCTACAGGGGGTACCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTCCTGCTACCGCTGCATCATCCCCTTTGCTGTGGTTGTCTTCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTCCTGCTACCGCTGCATCATCCCCTTTGCTGTGGTTGTCTTCATCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCATCGTGGTCACCGCGGTGGCTTACAGCTTCAATTCCCATGGGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCATCGTGGTCACCGCGGTGGCTTACAGCTTCAATTCCCATGGGTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTATCTCCATCTTTGGCCTGGTTGTTCTGTCATCTGGACTTTTTTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTATCTCCATCTTTGGCCTGGTTGTTCTGTCATCTGGACTTTTTTTACTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTCCAGTGCCTTGTGCTGGAAAGTGAGACAAAGGAGCAAGAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTCCAGTGCCTTGTGCTGGAAAGTGAGACAAAGGAGCAAGAAAGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGACGGGAGAGTCAAACAGCTCTCGTGGCAAATCAGAGAAGCTTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGACGGGAGAGTCAAACAGCTCTCGTGGCAAATCAGAGAAGCTTGTTTG

    400 
    401 CT
        ||
 100401 CT