seq1 = pF1KB7066.tfa, 2445 bp
seq2 = pF1KB7066/gi568815592r_16206332.tfa (gi568815592r:16206332_16428310), 221979 bp

>pF1KB7066 2445
>gi568815592r:16206332_16428310 (Chr6)

(complement)

1-1917  (100001-101917)   99% ->
1918-2445  (121452-121979)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAATCCAACCAAGAGCGGAGCAACGAATGCCTGCCTCCCAAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAATCCAACCAAGAGCGGAGCAACGAATGCCTGCCTCCCAAGAAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGATCCCCGCCACCAGCCGGTCCTCCGAGGAGAAGGCCCCTACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGATCCCCGCCACCAGCCGGTCCTCCGAGGAGAAGGCCCCTACCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGCGACAACCACCGGGTGGAGGGCACAGCATGGCTCCCGGGCAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGCGACAACCACCGGGTGGAGGGCACAGCATGGCTCCCGGGCAACCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGGCCGGGGCCACGGGGGCGGGAGGCATGGGCCGGCAGGGACCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGGCCGGGGCCACGGGGGCGGGAGGCATGGGCCGGCAGGGACCTCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGCTTGGTTTACAACAGGGAATAGGTTTACACAAAGCATTGTCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGCTTGGTTTACAACAGGGAATAGGTTTACACAAAGCATTGTCCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTGGACTACTCCCCGCCCAGCGCTCCCAGGTCTGTCCCCGTGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTGGACTACTCCCCGCCCAGCGCTCCCAGGTCTGTCCCCGTGGCCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGCTGCCTGCCGCGTACGCCACCCCGCAGCCAGGGACCCCGGTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACGCTGCCTGCCGCGTACGCCACCCCGCAGCCAGGGACCCCGGTGTCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGCAGTACGCTCACCTGCCGCACACCTTCCAGTTCATTGGGTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGCAGTACGCTCACCTGCCGCACACCTTCCAGTTCATTGGGTCCTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AATACAGTGGAACCTATGCCAGCTTCATCCCATCACAGCTGATCCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AATACAGTGGAACCTATGCCAGCTTCATCCCATCACAGCTGATCCCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCGCCAACCCCGTCACCAGTGCAGTGGCCTCGGCCGCAGGGGCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCGCCAACCCCGTCACCAGTGCAGTGGCCTCGGCCGCAGGGGCCACCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCCATCCCAGCGCTCCCAGCTGGAGGCCTATTCCACTCTGCTGGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCCATCCCAGCGCTCCCAGCTGGAGGCCTATTCCACTCTGCTGGCCAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGGCAGTCTGAGCCAGACGCCGGGACACAAGGCTGAGCAGCAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGGCAGTCTGAGCCAGACGCCGGGACACAAGGCTGAGCAGCAGCAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCAGCATCAGCAGCAGCAGCAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCTCAGCAGGGCTCCGGGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACCTCAGCAGGGCTCCGGGGCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCACCCCGGGGTCCCCCCCACCAGCCCAGCAGAACCAGTACGTCCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCACCCCGGGGTCCCCCCCACCAGCCCAGCAGAACCAGTACGTCCACATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCAGTTCTCCGCAGAACACCGGCCGCACCGCCTCTCCTCCGGCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCAGTTCTCCGCAGAACACCGGCCGCACCGCCTCTCCTCCGGCCATCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGTCCACCTCCACCCCCACCAGACGATGATCCCACACACGCTCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGTCCACCTCCACCCCCACCAGACGATGATCCCACACACGCTCACCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGCCCCCCTCCCAGGTCGTCATGCAATACGCCGACTCCGGCAGCCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGCCCCCCTCCCAGGTCGTCATGCAATACGCCGACTCCGGCAGCCACTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTCCCTCGGGAGGCCACCAAGAAAGCCGAGAGCAGCCGGCTGCAGCAGGC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100901 GTCCCTCGGGAGGCCACCAAGAAAGCTGAGAGCAGCCGGCTGCAGCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CATCCAGGCCAAGGAGGTCCTGAACGGTGAGATGGAGAAGAGCCGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CATCCAGGCCAAGGAGGTCCTGAACGGTGAGATGGAGAAGAGCCGGCGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACGGGGCCCCGTCCTCAGCCGACCTGGGCCTGGGCAAGGCAGGCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACGGGGCCCCGTCCTCAGCCGACCTGGGCCTGGGCAAGGCAGGCGGCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCGGTTCCTCACCCGTACGAGTCCAGGCACGTGGTGGTCCACCCGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCGGTTCCTCACCCGTACGAGTCCAGGCACGTGGTGGTCCACCCGAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTCAGACTACAGCAGTCGTGATCCTTCGGGGGTCCGGGCCTCTGTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTCAGACTACAGCAGTCGTGATCCTTCGGGGGTCCGGGCCTCTGTGATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TCCTGCCCAACAGCAACACGCCCGCAGCTGACCTGGAGGTGCAACAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TCCTGCCCAACAGCAACACGCCCGCAGCTGACCTGGAGGTGCAACAGGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACTCATCGTGAGGCCTCCCCTTCTACCCTCAACGACAAAAGTGGCCTGCA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACTCATCGTGAAGCCTCCCCTTCTACCCTCAACGACAAAAGTGGCCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTTAGGGAAGCCTGGCCACCGGTCCTACGCGCTCTCACCCCACACGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTAGGGAAGCCTGGCCACCGGTCCTACGCGCTCTCACCCCACACGGTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTCAGACCACACACAGTGCTTCAGAGCCACTCCCGGTGGGACTGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TTCAGACCACACACAGTGCTTCAGAGCCACTCCCGGTGGGACTGCCAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ACGGCCTTCTACGCAGGGACTCAACCCCCTGTCATCGGCTACCTGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ACGGCCTTCTACGCAGGGACTCAACCCCCTGTCATCGGCTACCTGAGCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCAGCAGCAAGCAATCACCTACGCCGGCAGCCTGCCCCAGCACCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCAGCAGCAAGCAATCACCTACGCCGGCAGCCTGCCCCAGCACCTGGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCCCCGGCACACAGCCCCTGCTCATCCCGGTCGGCAGCACTGACATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCCCCGGCACACAGCCCCTGCTCATCCCGGTCGGCAGCACTGACATGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCGTCGGGGGCAGCCCCGGCCATAGTCACGTCATCCCCCCAGTTTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCGTCGGGGGCAGCCCCGGCCATAGTCACGTCATCCCCCCAGTTTGCTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AGTGCCTCACACGTTCGTCACCACCGCCCTTCCCAAGAGCGAGAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AGTGCCTCACACGTTCGTCACCACCGCCCTTCCCAAGAGCGAGAACTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ACCCTGAGGCCCTGGTCACCCAGGCCGCCTACCCAGCCATGGTGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ACCCTGAGGCCCTGGTCACCCAGGCCGCCTACCCAGCCATGGTGCAGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CAGATCCACCTGCCTGTGGTGCAGTCCGTGGCCTCCCCGGCGGCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CAGATCCACCTGCCTGTGGTGCAGTCCGTGGCCTCCCCGGCGGCGGCTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CCCTACGCTGCCTCCCTACTTCATGAAAGGCTCCATCATCCAGTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCCTACGCTGCCTCCCTACTTCATGAAAGGCTCCATCATCCAGTTGGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ACGGGGAGCTAAAGAAGGTGGAAGACTTAAAAACAGAAGATTTCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ACGGGGAGCTAAAGAAGGTGGAAGACTTAAAAACAGAAGATTTCATCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AGTGCAGAGATAAGCAACGACCTGAAGATCGACTCCAGCACCGTAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AGTGCAGAGATAAGCAACGACCTGAAGATCGACTCCAGCACCGTAGAGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GATTGAAGACAGCCATAGCCCGGGCGTGGCCGTGATACAGTTCGCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GATTGAAGACAGCCATAGCCCGGGCGTGGCCGTGATACAGTTCGCCGTCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 GGGAGCACCGAGCCCAG         GTCAGCGTTGAAGTTTTGGTAGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101901 GGGAGCACCGAGCCCAGGTA...CAGGTCAGCGTTGAAGTTTTGGTAGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 TATCCTTTTTTTGTGTTTGGACAGGGCTGGTCATCCTGCTGTCCGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121476 TATCCTTTTTTTGTGTTTGGACAGGGCTGGTCATCCTGCTGTCCGGAGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 AACCAGCCAGCTCTTTGATTTGCCGTGTTCCAAACTCTCAGTTGGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121526 AACCAGCCAGCTCTTTGATTTGCCGTGTTCCAAACTCTCAGTTGGGGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 TCTGCATCTCGCTTACCCTCAAGAACCTGAAGAACGGCTCTGTTAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121576 TCTGCATCTCGCTTACCCTCAAGAACCTGAAGAACGGCTCTGTTAAAAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 GGCCAGCCCGTGGATCCCGCCAGCGTCCTGCTGAAGCACTCAAAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121626 GGCCAGCCCGTGGATCCCGCCAGCGTCCTGCTGAAGCACTCAAAGGCCGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 CGGCCTGGCGGGCAGCAGACACAGGTATGCCGAGCAGGAAAACGGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121676 CGGCCTGGCGGGCAGCAGACACAGGTATGCCGAGCAGGAAAACGGAATCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 ACCAGGGGAGTGCCCAGATGCTCTCTGAGAATGGCGAACTGAAGTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121726 ACCAGGGGAGTGCCCAGATGCTCTCTGAGAATGGCGAACTGAAGTTTCCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 GAGAAAATGGGATTGCCTGCAGCGCCCTTCCTCACCAAAATAGAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121776 GAGAAAATGGGATTGCCTGCAGCGCCCTTCCTCACCAAAATAGAACCCAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 CAAGCCCGCGGCAACGAGGAAGAGGAGGTGGTCGGCGCCAGAGAGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121826 CAAGCCCGCGGCAACGAGGAAGAGGAGGTGGTCGGCGCCAGAGAGCCGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342 AACTGGAGAAGTCAGAAGACGAACCACCTTTGACTCTTCCTAAGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121876 AACTGGAGAAGTCAGAAGACGAACCACCTTTGACTCTTCCTAAGCCTTCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 CTAATTCCTCAGGAGGTTAAGATTTGCATTGAAGGCCGGTCTAATGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121926 CTAATTCCTCAGGAGGTTAAGATTTGCATTGAAGGCCGGTCTAATGTAGG

   2450 
   2442 CAAG
        ||||
 121976 CAAG