seq1 = pF1KB7063.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KB7063/gi568815592f_108461209.tfa (gi568815592f:108461209_108764852), 303644 bp

>pF1KB7063 2019
>gi568815592f:108461209_108764852 (Chr6)

1-621  (100001-100621)   99% ->
622-2019  (202247-203644)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGGCACCGGCTTCCCCGGCCCCGCTCTCTCCGCTCGAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGGCACCGGCTTCCCCGGCCCCGCTCTCTCCGCTCGAAGTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGACCCGGAGTTCGAGCCCCAGAGCCGTCCGCGATCCTGTACGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGACCCGGAGTTCGAGCCCCAGAGCCGTCCGCGATCCTGTACGTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGCAAAGGCCGGAGCTCCAAGCGAGCCCTGCCAAGCCCTCGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGCAAAGGCCGGAGCTCCAAGCGAGCCCTGCCAAGCCCTCGGGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGGCCGCCGACTCCATGATCCCCGAGGAGGAGGACGATGAAGACGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACGGCCGCCGACTCCATGATCCCCGAGGAGGAGGACGATGAAGACGACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACGGCGGGGGACGGGCCGGCTCTGCCATGGCGATCGGCGGCGGCGGCG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACGGCGGGGGACGGGCCGGCTCGGCCATGGCGATCGGCGGCGGCGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAGCGGCACGCTGGGCTCCGGGCTGCTCCTTGAGGACTCGGCCCGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAGCGGCACGCTGGGCTCCGGGCTGCTCCTTGAGGACTCGGCCCGGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGCACCCGGAGGGCAAGACCCCGGGTCTGGGCCAGCCACCGCGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGCACCCGGAGGGCAAGACCCCGGGTCTGGGCCAGCCACCGCGGCGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGGCTGAGCGGGGGTACACAGGCGCTGCTGCAGCCTCAGCAACCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGGCTGAGCGGGGGTACACAGGCGCTGCTGCAGCCTCAGCAACCGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACCGCCGCAGCCGGGGGCGGCTGGGGGCTCCGGGCAGCCGAGGAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACCGCCGCAGCCGGGGGCGGCTGGGGGCTCCGGGCAGCCGAGGAAATGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCGTCGCGGCGGAACGCCTGGGGAAACCTGTCCTACGCGGACCTGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCGTCGCGGCGGAACGCCTGGGGAAACCTGTCCTACGCGGACCTGATCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGCGCCATCGAGAGCTCCCCGGACAAACGGCTCACTCTGTCCCAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGCGCCATCGAGAGCTCCCCGGACAAACGGCTCACTCTGTCCCAGATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGAGTGGATGGTGCGTTGCGTGCCCTACTTCAAGGATAAGGGCGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACGAGTGGATGGTGCGTTGCGTGCCCTACTTCAAGGATAAGGGCGACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AACAGCTCTGCCGGCTGGAAG         AACTCCATCCGGCACAACCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100601 AACAGCTCTGCCGGCTGGAAGGTG...CAGAACTCCATCCGGCACAACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GTCACTGCATAGTCGATTCATGCGGGTCCAGAATGAGGGAACTGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202267 GTCACTGCATAGTCGATTCATGCGGGTCCAGAATGAGGGAACTGGCAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCTCTTGGTGGATCATCAACCCTGATGGGGGGAAGAGCGGAAAAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202317 GCTCTTGGTGGATCATCAACCCTGATGGGGGGAAGAGCGGAAAAGCCCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGGCGGCGGGCTGTCTCCATGGACAATAGCAACAAGTATACCAAGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202367 CGGCGGCGGGCTGTCTCCATGGACAATAGCAACAAGTATACCAAGAGCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGGCCGCGCAGCCAAGAAGAAGGCAGCCCTGCAGACAGCCCCCGAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202417 TGGCCGCGCAGCCAAGAAGAAGGCAGCCCTGCAGACAGCCCCCGAATCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTGACGACAGTCCCTCCCAGCTCTCCAAGTGGCCTGGCAGCCCCACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202467 CTGACGACAGTCCCTCCCAGCTCTCCAAGTGGCCTGGCAGCCCCACGTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGCAGCAGTGATGAGCTGGATGCGTGGACGGACTTCCGTTCACGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202517 CGCAGCAGTGATGAGCTGGATGCGTGGACGGACTTCCGTTCACGCACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TTCTAACGCCAGCACAGTCAGTGGCCGCCTGTCGCCCATCATGGCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202567 TTCTAACGCCAGCACAGTCAGTGGCCGCCTGTCGCCCATCATGGCAAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CAGAGTTGGATGAAGTCCAGGACGATGATGCGCCTCTCTCGCCCATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202617 CAGAGTTGGATGAAGTCCAGGACGATGATGCGCCTCTCTCGCCCATGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TACAGCAGCTCAGCCAGCCTGTCACCTTCAGTAAGCAAGCCGTGCACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202667 TACAGCAGCTCAGCCAGCCTGTCACCTTCAGTAAGCAAGCCGTGCACGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGAACTGCCACGGCTGACTGATATGGCAGGCACCATGAATCTGAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202717 GGAACTGCCACGGCTGACTGATATGGCAGGCACCATGAATCTGAATGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GGCTGACTGAAAACCTCATGGACGACCTGCTGGATAACATCACGCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202767 GGCTGACTGAAAACCTCATGGACGACCTGCTGGATAACATCACGCTCCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CCATCCCAGCCATCGCCCACTGGGGGACTCATGCAGCGGAGCTCTAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202817 CCATCCCAGCCATCGCCCACTGGGGGACTCATGCAGCGGAGCTCTAGCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CCCGTATACCACCAAGGGCTCGGGCCTGGGCTCCCCAACCAGCTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202867 CCCGTATACCACCAAGGGCTCGGGCCTGGGCTCCCCAACCAGCTCCTTTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ACAGCACGGTGTTCGGACCTTCATCTCTGAACTCCCTACGCCAGTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202917 ACAGCACGGTGTTCGGACCTTCATCTCTGAACTCCCTACGCCAGTCTCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 ATGCAGACCATCCAAGAGAACAAGCCAGCTACCTTCTCTTCCATGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202967 ATGCAGACCATCCAAGAGAACAAGCCAGCTACCTTCTCTTCCATGTCACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CTATGGTAACCAGACACTCCAGGACCTGCTCACTTCGGACTCACTTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203017 CTATGGTAACCAGACACTCCAGGACCTGCTCACTTCGGACTCACTTAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ACAGCGATGTCATGATGACACAGTCGGACCCCTTGATGTCTCAGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203067 ACAGCGATGTCATGATGACACAGTCGGACCCCTTGATGTCTCAGGCCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 ACCGCTGTGTCTGCCCAGAATTCCCGCCGGAACGTGATGCTTCGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203117 ACCGCTGTGTCTGCCCAGAATTCCCGCCGGAACGTGATGCTTCGCAATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TCCGATGATGTCCTTTGCTGCCCAGCCTAACCAGGGAAGTTTGGTCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203167 TCCGATGATGTCCTTTGCTGCCCAGCCTAACCAGGGAAGTTTGGTCAATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AGAACTTGCTCCACCACCAGCACCAAACCCAGGGCGCTCTTGGTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203217 AGAACTTGCTCCACCACCAGCACCAAACCCAGGGCGCTCTTGGTGGCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CGTGCCTTGTCGAATTCTGTCAGCAACATGGGCTTGAGTGAGTCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203267 CGTGCCTTGTCGAATTCTGTCAGCAACATGGGCTTGAGTGAGTCCAGCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CCTTGGGTCAGCCAAACACCAGCAGCAGTCTCCTGTCAGCCAGTCTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203317 CCTTGGGTCAGCCAAACACCAGCAGCAGTCTCCTGTCAGCCAGTCTATGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 AAACCCTCTCGGACTCTCTCTCAGGCTCCTCCTTGTACTCAACTAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203367 AAACCCTCTCGGACTCTCTCTCAGGCTCCTCCTTGTACTCAACTAGTGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 AACCTGCCCGTCATGGGCCATGAGAAGTTCCCCAGCGACTTGGACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203417 AACCTGCCCGTCATGGGCCATGAGAAGTTCCCCAGCGACTTGGACCTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 CATGTTCAATGGGAGCTTGGAATGTGACATGGAGTCCATTATCCGTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203467 CATGTTCAATGGGAGCTTGGAATGTGACATGGAGTCCATTATCCGTAGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 AACTCATGGATGCTGATGGGTTGGATTTTAACTTTGATTCCCTCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203517 AACTCATGGATGCTGATGGGTTGGATTTTAACTTTGATTCCCTCATCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 ACACAGAATGTTGTTGGTTTGAACGTGGGGAACTTCACTGGTGCTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203567 ACACAGAATGTTGTTGGTTTGAACGTGGGGAACTTCACTGGTGCTAAGCA

   2000     .    :    .    :    .
   1992 GGCCTCATCTCAGAGCTGGGTGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 203617 GGCCTCATCTCAGAGCTGGGTGCCAGGC