seq1 = pF1KB7062.tfa, 1992 bp
seq2 = pF1KB7062/gi568815590f_124375110.tfa (gi568815590f:124375110_124587641), 212532 bp

>pF1KB7062 1992
>gi568815590f:124375110_124587641 (Chr8)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-1992  (110722-112532)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCGTGGGGCCCCCGCAGCAGCAGGTGCGGATGGCCCATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCGTGGGGCCCCCGCAGCAGCAGGTGCGGATGGCCCATCAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCTGGGCGGCGCTCGAAGTGGCGCTCCGGGTGCCCTGCCTTTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCTGGGCGGCGCTCGAAGTGGCGCTCCGGGTGCCCTGCCTTTACATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGACGCCATCTTCAACTCCTACCCGGATTCCAGCCAAAGCCGGTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGACGCCATCTTCAACTCCTACCCGGATTCCAGCCAAAGCCGGTTCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGTGCTCCAGATCTTCCTCCGGCTCTTTG         GTGTATTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 ATCGTGCTCCAGATCTTCCTCCGGCTCTTTGGTA...TAGGTGTATTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCCAGTATTGTTCTGATCTTGTCACAACGATCACTTTTCAAGTTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110732 ATCCAGTATTGTTCTGATCTTGTCACAACGATCACTTTTCAAGTTTTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGTACAGCTCAGCCTTTCTGTTAGCTGCAACTTCAGTGTTGGTGAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110782 CGTACAGCTCAGCCTTTCTGTTAGCTGCAACTTCAGTGTTGGTGAATTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TATGCTTCTTTGCACATTGACTTCTATGGTGCCTACAACACGTCAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110832 TATGCTTCTTTGCACATTGACTTCTATGGTGCCTACAACACGTCAGCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGAATTGAGCTGCTTCCTCGAAAAGGTCCCTCGCTGTGGATGGCACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110882 TGGAATTGAGCTGCTTCCTCGAAAAGGTCCCTCGCTGTGGATGGCACTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCGTTCTACAGCTAACATTTGGAATTGGATACGTTACACTACTCCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110932 TCGTTCTACAGCTAACATTTGGAATTGGATACGTTACACTACTCCAGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CATTCCATCTATTCACAATTAATTATTTTGGATCTCTTGGTTCCTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110982 CATTCCATCTATTCACAATTAATTATTTTGGATCTCTTGGTTCCTGTAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGGCTTAATCACAGAGCTACCATTACACATCAGAGAGACTTTACTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111032 AGGCTTAATCACAGAGCTACCATTACACATCAGAGAGACTTTACTGTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTTCTTCCTTGATTCTCACATTAAATACAGTGTTTGTCCTGGCAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111082 CTTCTTCCTTGATTCTCACATTAAATACAGTGTTTGTCCTGGCAGTGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGAAGTGGTTTTATTATTCCACACGATATGTTTATCTTTTGGTGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111132 CTGAAGTGGTTTTATTATTCCACACGATATGTTTATCTTTTGGTGAGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CATGTATCGAATTTACGGATTACAGTTATTGATGGAGGACACATGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111182 CATGTATCGAATTTACGGATTACAGTTATTGATGGAGGACACATGGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGATTCGTTTCCCAGACATACTACGAGTCTTTTGGCTAACAAGAGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111232 GGATTCGTTTCCCAGACATACTACGAGTCTTTTGGCTAACAAGAGTTACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCTCAGGCTACAGTGTTAATGTACATCTTAAGGATGGCAAATGAAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111282 GCTCAGGCTACAGTGTTAATGTACATCTTAAGGATGGCAAATGAAACTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTCCTTCTTTATTTCTTGGGATGATTTTTGGGACCTCATTTGCAATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111332 TTCCTTCTTTATTTCTTGGGATGATTTTTGGGACCTCATTTGCAATCTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TAATTAGTGGGTGCGATTCTACACTAACTGTACTGGGCATGAGTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111382 TAATTAGTGGGTGCGATTCTACACTAACTGTACTGGGCATGAGTGCTGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATTTCCTCAGTAGCCCATTATTTGGGGCTTGGAATATTGGCCTTTATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111432 ATTTCCTCAGTAGCCCATTATTTGGGGCTTGGAATATTGGCCTTTATTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ATCAACTGAGGAAGATGACAGGCGTCTTGGCTTTGTTGCACCTGTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111482 ATCAACTGAGGAAGATGACAGGCGTCTTGGCTTTGTTGCACCTGTTTTAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTTTTATTTTGGCTCTTCAGACTGGGTTAAGTGGGCTAAGACCAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111532 TTTTTATTTTGGCTCTTCAGACTGGGTTAAGTGGGCTAAGACCAGAAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AGACTTATTCGCTTAAGTAGAAACATGTGCCTTTTATTAACTGCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111582 AGACTTATTCGCTTAAGTAGAAACATGTGCCTTTTATTAACTGCAGTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCATTTTATCCATGGAATGACAGACCCTGTATTAATGTCTCTCAGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111632 GCATTTTATCCATGGAATGACAGACCCTGTATTAATGTCTCTCAGTGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CTCATGTGTCATCTTTTCGTAGACATTTTCCTGTGCTGTTTGTCTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111682 CTCATGTGTCATCTTTTCGTAGACATTTTCCTGTGCTGTTTGTCTCTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TGCCTGTTTATTCTTCCTGTCTTACTCAGTTATGTTCTTTGGCATCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111732 TGCCTGTTTATTCTTCCTGTCTTACTCAGTTATGTTCTTTGGCATCACTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TGCACTAAATACATGGTTGTTTGCAGTTACAGCATTTTGTGTGGAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111782 TGCACTAAATACATGGTTGTTTGCAGTTACAGCATTTTGTGTGGAACTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GCTTAAAAGTAATTGTTTCTCTCACTGTTTATACGTTATTCATGATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111832 GCTTAAAAGTAATTGTTTCTCTCACTGTTTATACGTTATTCATGATTGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GGCTACTATAATGTCCTCTGGGAAAAGCTTGACGATTATGTCTACTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111882 GGCTACTATAATGTCCTCTGGGAAAAGCTTGACGATTATGTCTACTACGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TCGTTCAACAGGCAGTATTATTGAATTTATATTTGGAGTTGTAATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111932 TCGTTCAACAGGCAGTATTATTGAATTTATATTTGGAGTTGTAATGTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GAAATGGGGCTTACACTATGATGTTTGAGTCGGGAAGTAAAATTCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111982 GAAATGGGGCTTACACTATGATGTTTGAGTCGGGAAGTAAAATTCGGGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TTTATGATGTGCCTACATGCATATTTTAACATCTACTTACAAGCCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112032 TTTATGATGTGCCTACATGCATATTTTAACATCTACTTACAAGCCAAAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TGGCTGGAAGACATTTATGAATCGTAGGACTGCTGTGAAGAAAATTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112082 TGGCTGGAAGACATTTATGAATCGTAGGACTGCTGTGAAGAAAATTAATT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CACTTCCTGAAATAAAAGGGAGCCGCTTACAAGAAATAAATGATGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112132 CACTTCCTGAAATAAAAGGGAGCCGCTTACAAGAAATAAATGATGTATGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GCAATCTGCTATCATGAGTTTACAACATCTGCTCGTATTACACCGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112182 GCAATCTGCTATCATGAGTTTACAACATCTGCTCGTATTACACCGTGTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 TCATTATTTCCATGCACTTTGCCTTCGGAAATGGCTGTACATTCAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112232 TCATTATTTCCATGCACTTTGCCTTCGGAAATGGCTGTACATTCAAGATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 CTTGTCCAATGTGCCATCAGAAAGTATACATCGAAGATGATATCAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112282 CTTGTCCAATGTGCCATCAGAAAGTATACATCGAAGATGATATCAAGGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 AATTCAAATGTATCTAACAACAATGGATTTATTCCACCCAATGAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112332 AATTCAAATGTATCTAACAACAATGGATTTATTCCACCCAATGAAACTCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 AGAGGAAGCTGTAAGAGAAGCTGCTGCTGAATCTGACAGGGAATTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112382 AGAGGAAGCTGTAAGAGAAGCTGCTGCTGAATCTGACAGGGAATTGAACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 AAGATGACAGTACAGATTGTGATGATGATGTTCAAAGAGAAAGAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112432 AAGATGACAGTACAGATTGTGATGATGATGTTCAAAGAGAAAGAAATGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 GTGATTCAGCACACAGGCGCAGCAGCTGAAGAATTTAATGATGATACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112482 GTGATTCAGCACACAGGCGCAGCAGCTGAAGAATTTAATGATGATACTGA

   2000 
   1992 C
        |
 112532 C