seq1 = pF1KB7061.tfa, 1965 bp
seq2 = pF1KB7061/gi568815585r_40459526.tfa (gi568815585r:40459526_40766212), 306687 bp

>pF1KB7061 1965
>gi568815585r:40459526_40766212 (Chr13)

(complement)

1-630  (100001-100630)   100% ->
631-1965  (205353-206687)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGGCGCCTCAGGTGGTGGAGATCGACCCGGACTTCGAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGGCGCCTCAGGTGGTGGAGATCGACCCGGACTTCGAGCCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCCGGCCGCGCTCGTGCACCTGGCCGCTGCCCAGGCCGGAGTTTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCCGGCCGCGCTCGTGCACCTGGCCGCTGCCCAGGCCGGAGTTTAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCCAACTCGGCCACCTCCAGCCCGGCGCCGTCGGGCAGCGCGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTCCAACTCGGCCACCTCCAGCCCGGCGCCGTCGGGCAGCGCGGCTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCCCGACGCCGCGGCGGGCCTGCCCTCGGCCTCGGCTGCCGCTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACCCCGACGCCGCGGCGGGCCTGCCCTCGGCCTCGGCTGCCGCTGTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCGACTTCATGAGCAACCTGAGCTTGCTGGAGGAGAGCGAGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCGACTTCATGAGCAACCTGAGCTTGCTGGAGGAGAGCGAGGACTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCAGGCGCCCGGCTCCGTGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCCGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCAGGCGCCCGGCTCCGTGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCCGCCGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCGCCACCGGGGGGCTGTGCGGGGACTTCCAGGGCCCGGAGGCGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCGCCACCGGGGGGCTGTGCGGGGACTTCCAGGGCCCGGAGGCGGGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGCACCCAGCGCCACCGCAGCCCCCGCCGCCCGGGCCGCTGTCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGCACCCAGCGCCACCGCAGCCCCCGCCGCCCGGGCCGCTGTCGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCGCCGGTGCCCCCCGCCGCCGCTGGGCCGCTCGCGGGGCAGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCGCCGGTGCCCCCCGCCGCCGCTGGGCCGCTCGCGGGGCAGCCGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGAGCAGCTCGTCCCGCCGCAACGCGTGGGGCAACCTGTCCTACGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGAGCAGCTCGTCCCGCCGCAACGCGTGGGGCAACCTGTCCTACGCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCATCACCAAGGCCATCGAGAGCTCGGCGGAGAAGCGGCTCACGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCATCACCAAGGCCATCGAGAGCTCGGCGGAGAAGCGGCTCACGCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGCAGATCTACGAGTGGATGGTCAAGAGCGTGCCCTACTTCAAGGATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGCAGATCTACGAGTGGATGGTCAAGAGCGTGCCCTACTTCAAGGATAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTGACAGCAACAGCTCGGCGGGCTGGAAG         AATTCAATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100601 GGTGACAGCAACAGCTCGGCGGGCTGGAAGGTG...CAGAATTCAATTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCATAATCTGTCCCTACACAGCAAGTTCATTCGTGTGCAGAATGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205364 TCATAATCTGTCCCTACACAGCAAGTTCATTCGTGTGCAGAATGAAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTGGAAAAAGTTCTTGGTGGATGCTCAATCCAGAGGGTGGCAAGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205414 CTGGAAAAAGTTCTTGGTGGATGCTCAATCCAGAGGGTGGCAAGAGCGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAATCTCCTAGGAGAAGAGCTGCATCCATGGACAACAACAGTAAATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205464 AAATCTCCTAGGAGAAGAGCTGCATCCATGGACAACAACAGTAAATTTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TAAGAGCCGAAGCCGAGCTGCCAAGAAGAAAGCATCTCTCCAGTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205514 TAAGAGCCGAAGCCGAGCTGCCAAGAAGAAAGCATCTCTCCAGTCTGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGGAGGGTGCTGGGGACAGCCCTGGATCACAGTTTTCCAAATGGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205564 AGGAGGGTGCTGGGGACAGCCCTGGATCACAGTTTTCCAAATGGCCTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGCCCTGGCTCTCACAGCAATGATGACTTTGATAACTGGAGTACATTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205614 AGCCCTGGCTCTCACAGCAATGATGACTTTGATAACTGGAGTACATTTCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCCTCGAACTAGCTCAAATGCTAGTACTATTAGTGGGAGACTCTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205664 CCCTCGAACTAGCTCAAATGCTAGTACTATTAGTGGGAGACTCTCACCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTATGACCGAACAGGATGATCTTGGAGAAGGGGATGTGCATTCTATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205714 TTATGACCGAACAGGATGATCTTGGAGAAGGGGATGTGCATTCTATGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TACCCGCCATCTGCCGCAAAGATGGCCTCTACTTTACCCAGTCTGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205764 TACCCGCCATCTGCCGCAAAGATGGCCTCTACTTTACCCAGTCTGTCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GATAAGCAATCCCGAAAACATGGAAAATCTTTTGGATAATCTCAACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205814 GATAAGCAATCCCGAAAACATGGAAAATCTTTTGGATAATCTCAACCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCTCATCACCAACATCATTAACTGTTTCGACCCAGTCCTCACCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205864 TCTCATCACCAACATCATTAACTGTTTCGACCCAGTCCTCACCTGGCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATGATGCAGCAGACGCCGTGCTACTCGTTTGCGCCACCAAACACCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205914 ATGATGCAGCAGACGCCGTGCTACTCGTTTGCGCCACCAAACACCAGTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GAATTCACCCAGCCCAAACTACCAAAAATATACATATGGCCAATCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205964 GAATTCACCCAGCCCAAACTACCAAAAATATACATATGGCCAATCCAGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TGAGCCCTTTGCCCCAGATGCCTATACAAACACTTCAGGACAATAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206014 TGAGCCCTTTGCCCCAGATGCCTATACAAACACTTCAGGACAATAAGTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AGTTATGGAGGTATGAGTCAGTATAACTGTGCGCCTGGACTCTTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206064 AGTTATGGAGGTATGAGTCAGTATAACTGTGCGCCTGGACTCTTGAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GTTGCTGACTTCTGACTCTCCTCCCCATAATGACATTATGACACCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206114 GTTGCTGACTTCTGACTCTCCTCCCCATAATGACATTATGACACCAGTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ATCCTGGGGTAGCCCAGCCCAACAGCCGGGTTCTGGGCCAGAACGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206164 ATCCTGGGGTAGCCCAGCCCAACAGCCGGGTTCTGGGCCAGAACGTCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 ATGGGCCCTAATTCGGTCATGTCAACCTATGGCAGCCAGGCATCTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206214 ATGGGCCCTAATTCGGTCATGTCAACCTATGGCAGCCAGGCATCTCATAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CAAAATGATGAATCCCAGCTCCCATACCCACCCTGGACATGCTCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206264 CAAAATGATGAATCCCAGCTCCCATACCCACCCTGGACATGCTCAGCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CATCTGCAGTTAACGGGCGTCCCCTGCCCCACACGGTAAGCACCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206314 CATCTGCAGTTAACGGGCGTCCCCTGCCCCACACGGTAAGCACCATGCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CACACCTCGGGTATGAACCGCCTGACCCAAGTGAAGACACCTGTACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206364 CACACCTCGGGTATGAACCGCCTGACCCAAGTGAAGACACCTGTACAAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 GCCTCTGCCCCACCCCATGCAGATGAGTGCCCTGGGGGGCTACTCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206414 GCCTCTGCCCCACCCCATGCAGATGAGTGCCCTGGGGGGCTACTCCTCCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 TGAGCAGCTGCAATGGCTATGGCAGAATGGGCCTTCTCCACCAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206464 TGAGCAGCTGCAATGGCTATGGCAGAATGGGCCTTCTCCACCAGGAGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 CTCCCAAGTGACTTGGATGGCATGTTCATTGAGCGCTTAGACTGTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206514 CTCCCAAGTGACTTGGATGGCATGTTCATTGAGCGCTTAGACTGTGACAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 GGAATCCATCATTCGGAATGACCTCATGGATGGAGATACATTGGATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206564 GGAATCCATCATTCGGAATGACCTCATGGATGGAGATACATTGGATTTTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 ACTTTGACAATGTGTTGCCCAACCAAAGCTTCCCACACAGTGTCAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206614 ACTTTGACAATGTGTTGCCCAACCAAAGCTTCCCACACAGTGTCAAGACA

   1950     .    :    .    :
   1942 ACGACACATAGCTGGGTGTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||
 206664 ACGACACATAGCTGGGTGTCAGGC