seq1 = pF1KB7055.tfa, 1746 bp
seq2 = pF1KB7055/gi568815578f_45121390.tfa (gi568815578f:45121390_45323378), 201989 bp

>pF1KB7055 1746
>gi568815578f:45121390_45323378 (Chr20)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-1746  (100320-101989)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTCCATCATCCTCTTTGTCCTTTCCCTGCTCCTTATCTTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTCCATCATCCTCTTTGTCCTTTCCCTGCTCCTTATCTTGGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAAGCAGCTGTGATGGGACAAAAAG         GTGGATCAAAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 GCAAGCAGCTGTGATGGGACAAAAAGGTG...CAGGTGGATCAAAAGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATTGCCAAGCGGATCTTCCCAATTTCCACATGGAAAAAAGGGCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100335 AATTGCCAAGCGGATCTTCCCAATTTCCACATGGACAAAAGGGCCAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATTTTGGACAAAAAGACCAACAACATACTAAATCCAAAGGCAGTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100385 TATTTTGGACAAAAAGACCAACAACATACTAAATCCAAAGGCAGTTTTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATTCAACACACATATCATGTAGACATCAATGATCATGACTGGACCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100435 TATTCAACACACATATCATGTAGACATCAATGATCATGACTGGACCCGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAAGTCAGCAGTATGATTTGAATGCCCTACATAAGGCGACAAAATCAAAA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100485 AAAGTCAGCAATATGATTTGAATGCCCTACATAAGGCGACAAAATCAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAACACCTAGGTGGAAGTCAACAACTGCTCAATTATAAACAAGAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100535 CAACACCTAGGTGGAAGTCAACAACTGCTCAATTATAAACAAGAAGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGACCATGATAAATCAAAAGGTCATTTTCACATGATAGTTATACATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100585 AGACCATGATAAATCAAAAGGTCATTTTCACATGATAGTTATACATCATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGGAGGCCAAGCTCATCATGGGACACAAAATCCTTCTCAAGATCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100635 AAGGAGGCCAAGCTCATCATGGGACACAAAATCCTTCTCAAGATCAGGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AATAGCCCATCTGGAAAGGGATTATCCAGTCAATGTTCAAACACAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100685 AATAGCCCATCTGGAAAGGGATTATCCAGTCAATGTTCAAACACAGAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAGGCTATGGGTTCATGGACTAAGTAAAGAACAAGCTTCAGCCTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100735 AAGGCTATGGGTTCATGGACTAAGTAAAGAACAAGCTTCAGCCTCTGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CACAAAAAGGTAGAACACAAGGTGGATCCCAAAGCAGTTATGTTCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100785 CACAAAAAGGTAGAACACAAGGTGGATCCCAAAGCAGTTATGTTCTCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACTGAAGAACTAGTAGTTAACAAACAACAACGTGAGACTAAAAATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100835 ACTGAAGAACTAGTAGTTAACAAACAACAACGTGAGACTAAAAATTCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCAAAATAAAGGGCATTACCAAAATGTGGTTGACGTGAGAGAGGAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100885 TCAAAATAAAGGGCATTACCAAAATGTGGTTGACGTGAGAGAGGAACATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAAGTAAACTACAAACTTCACTCCATCCTGCACATCAAGACAGACTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100935 CAAGTAAACTACAAACTTCACTCCATCCTGCACATCAAGACAGACTCCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CATGGACCCAAAGACATTTTTACTACCCAAGATGAGCTCCTAGTATATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100985 CATGGACCCAAAGACATTTTTACTACCCAAGATGAGCTCCTAGTATATAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAAGAATCAACACCAGACAAAAAATCTCAATCAAGATCAAGAGCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 101035 CAAGAATCAACACCAGACAAAAAATCTCAGTCAAGATCAAGAGCATGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGAAGGCACATAAAATATCATACCCGTCTTCACGTACAGAAGAAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101085 GGAAGGCACATAAAATATCATACCCGTCTTCACGTACAGAAGAAAGACAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTTCACCATGGAGAAAAGAGTGTACAGAAAGATGTATCCAAAGGCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101135 CTTCACCATGGAGAAAAGAGTGTACAGAAAGATGTATCCAAAGGCAGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TTCTATCCAAACTGAAGAGAAAATACATGGCAAGTCTCAAAACCAGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101185 TTCTATCCAAACTGAAGAGAAAATACATGGCAAGTCTCAAAACCAGGTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CAATTCATAGTCAAGATCAAGAGCATGGCCATAAGGAAAATAAAATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101235 CAATTCATAGTCAAGATCAAGAGCATGGCCATAAGGAAAATAAAATATCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TACCAATCTTCAAGTACAGAAGAAAGACATCTCAACTGTGGAGAAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101285 TACCAATCTTCAAGTACAGAAGAAAGACATCTCAACTGTGGAGAAAAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CATCCAGAAAGGTGTATCCAAAGGCAGTATTTCGATCCAAACTGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101335 CATCCAGAAAGGTGTATCCAAAGGCAGTATTTCGATCCAAACTGAAGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AAATACATGGCAAGTCTCAAAACCAGGTAAGAATTCCTAGTCAAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101385 AAATACATGGCAAGTCTCAAAACCAGGTAAGAATTCCTAGTCAAGCTCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GAGTATGGCCATAAGGAAAATAAAATATCATACCAATCTTCGAGTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101435 GAGTATGGCCATAAGGAAAATAAAATATCATACCAATCTTCGAGTACAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGAAAGACGTCTCAACAGTGGAGAAAAGGATGTACAGAAAGGTGTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101485 AGAAAGACGTCTCAACAGTGGAGAAAAGGATGTACAGAAAGGTGTATCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AAGGCAGTATTTCTATCCAAACTGAAGAGAAAATACATGGCAAGTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101535 AAGGCAGTATTTCTATCCAAACTGAAGAGAAAATACATGGCAAGTCTCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AACCAGGTAACAATTCCTAGTCAAGATCAAGAGCATGGCCATAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101585 AACCAGGTAACAATTCCTAGTCAAGATCAAGAGCATGGCCATAAGGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TAAAATGTCATACCAATCTTCAAGTACAGAAGAAAGACGACTCAACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101635 TAAAATGTCATACCAATCTTCAAGTACAGAAGAAAGACGACTCAACTATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GAGGAAAGAGCACGCAGAAAGATGTATCCCAAAGCAGTATTTCTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101685 GAGGAAAGAGCACGCAGAAAGATGTATCCCAAAGCAGTATTTCTTTCCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 ATTGAAAAGCTAGTAGAAGGCAAGTCTCAAATCCAGACACCAAATCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101735 ATTGAAAAGCTAGTAGAAGGCAAGTCTCAAATCCAGACACCAAATCCTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TCAAGATCAATGGTCTGGCCAAAATGCAAAAGGAAAGTCTGGTCAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101785 TCAAGATCAATGGTCTGGCCAAAATGCAAAAGGAAAGTCTGGTCAATCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CAGATAGCAAACAAGACCTACTCAGTCATGAACAAAAAGGCAGATACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101835 CAGATAGCAAACAAGACCTACTCAGTCATGAACAAAAAGGCAGATACAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CAGGAATCCAGTGAGTCACATAATATTGTAATTACTGAGCATGAGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101885 CAGGAATCCAGTGAGTCACATAATATTGTAATTACTGAGCATGAGGTTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CCAAGATGATCATTTGACACAACAATATAATGAAGACAGAAATCCAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101935 CCAAGATGATCATTTGACACAACAATATAATGAAGACAGAAATCCAATAT

   1750     .
   1742 CTACA
        |||||
 101985 CTACA