seq1 = pF1KB7054.tfa, 1722 bp
seq2 = pF1KB7054/gi568815587r_62652093.tfa (gi568815587r:62652093_62854062), 201970 bp

>pF1KB7054 1722
>gi568815587r:62652093_62854062 (Chr11)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-1722  (100348-101970)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTAGGGAGTTCTCGAAGTGGGGCGTAGAGGCATCGCCTGGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTAGGGAGTTCTCGAAGTGGGGCGTAGAGGCATCGCCTGGCAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGAGCGAAAAAGATCTCTACTTCGTGGAGCCGTTGGACGCTACCGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 CTGGGAGCGAAAAAGATCTCTACTTCGTGGAGCCGTTGGACGCTACCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GGAGCCACTGGTGGGGACCTTTTTTGGGCCCCCTTTCCTTCG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TG...CAGGGAGCCACTGGTGGGGACCTTTTTTGGGCCCCCTTTCCTTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGGGTACTATGGAGTTCCCAGAACACAGTCAGCAGCTGCTGCAGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100390 TGGGGTACTATGGAGTTCCCAGAACACAGTCAGCAGCTGCTGCAGAGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGGGAGCAGCGGTCCCAGGGTTTCCTTTGTGACTGCACCGTGATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100440 CCGGGAGCAGCGGTCCCAGGGTTTCCTTTGTGACTGCACCGTGATGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTAGTACCCAGTTCTTGGCCCATCGGGCTGTGCTGGCCTCCTGCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100490 GTAGTACCCAGTTCTTGGCCCATCGGGCTGTGCTGGCCTCCTGCAGCCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCTTCCAGCTTTTCTACAAGGAGCGGGAATTGGACAAGAGGGATCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100540 TTCTTCCAGCTTTTCTACAAGGAGCGGGAATTGGACAAGAGGGATCTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTGTATTCACAATGAAATTGTCACAGCCCCAGCCTTTGGGCTGCTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100590 GTGTATTCACAATGAAATTGTCACAGCCCCAGCCTTTGGGCTGCTTCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTTTATGTATGCTGGCCAGCTGACCCTGAGAGGGGATACCCCTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100640 ACTTTATGTATGCTGGCCAGCTGACCCTGAGAGGGGATACCCCTGTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GATGTGCTGGCAGCTGCCAGCTACTTGCACATGAATGACATCGTCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100690 GATGTGCTGGCAGCTGCCAGCTACTTGCACATGAATGACATCGTCAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTGTAAGCGGCGGCTTCAAGCCCGGGCCCTGGCAGAGGCAGACAGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100740 GTGTAAGCGGCGGCTTCAAGCCCGGGCCCTGGCAGAGGCAGACAGTACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGAAGGAGGAGGAAACCAACTCACAGCTTCCTAGTTTGGAGTTTTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100790 AGAAGGAGGAGGAAACCAACTCACAGCTTCCTAGTTTGGAGTTTTTGTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGTACTTCCCGTGGCACCCAACCTTCGTTGGCATCTGCTGAGACATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100840 AGTACTTCCCGTGGCACCCAACCTTCGTTGGCATCTGCTGAGACATCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCACTGGGGCAAAGGGGAATGGAAAGGCTCTGCTGCTCCCTCACCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100890 CCACTGGGGCAAAGGGGAATGGAAAGGCTCTGCTGCTCCCTCACCTACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCGTCCTCCAGATGAGCCACCAATGTCTAGTGGGGCTGACACTACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100940 TCCGTCCTCCAGATGAGCCACCAATGTCTAGTGGGGCTGACACTACACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCTGGCATGGAGGTTGACGCACCACATCTGCGGGCACCTCATCCACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100990 CCTGGCATGGAGGTTGACGCACCACATCTGCGGGCACCTCATCCACCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGCTGATGTCTCTCTTGCCAGCCCTAGTAGCTCCACTGAGACCATTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101040 GGCTGATGTCTCTCTTGCCAGCCCTAGTAGCTCCACTGAGACCATTCCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CAAACTACTTCTCTTCTGGCATCTCAGCAGTTTCATTGGAGCCACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101090 CAAACTACTTCTCTTCTGGCATCTCAGCAGTTTCATTGGAGCCACTGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCTCTTGATGTGGGTCCTGAGAGTCTGAGGGTGGTGGAACCAAAGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101140 TCTCTTGATGTGGGTCCTGAGAGTCTGAGGGTGGTGGAACCAAAGGATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGGAGGACCACTGCAAGGCTTCTATCCCCCAGCCTCAGCCCCAACGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101190 TGGAGGACCACTGCAAGGCTTCTATCCCCCAGCCTCAGCCCCAACGTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCCCAGCCCCTGTCTCAGCTCCAGTTCCATCCCAGGCTCCAGCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101240 CCCCAGCCCCTGTCTCAGCTCCAGTTCCATCCCAGGCTCCAGCCCCAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAAGCTGAGCTGGTCCAGGTGAAAGTTGAAGCTATTGTGATCTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101290 GAAGCTGAGCTGGTCCAGGTGAAAGTTGAAGCTATTGTGATCTCTGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AGAGACTGATGTGTCAGATGAACAGCCTCAGGGTCCTGAGAGAGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101340 AGAGACTGATGTGTCAGATGAACAGCCTCAGGGTCCTGAGAGAGCTTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CATCTGGAGGAGCAGTGTATGGGGCACAGCCCTCCCAGCCAGAGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101390 CATCTGGAGGAGCAGTGTATGGGGCACAGCCCTCCCAGCCAGAGGCTTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GAAGACCCAGGGGCAGCAGGACTGGAGGAGGTGGGGCCAAGTGACCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101440 GAAGACCCAGGGGCAGCAGGACTGGAGGAGGTGGGGCCAAGTGACCACTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CCTGCCAACAGACCCTCATCTACCCTACCATCTGCTGCCAGGTGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101490 CCTGCCAACAGACCCTCATCTACCCTACCATCTGCTGCCAGGTGCAGGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGTATCATCGAGGACTGGTGACCTCACCTCTGCCTGCACCCGCATCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101540 AGTATCATCGAGGACTGGTGACCTCACCTCTGCCTGCACCCGCATCCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 CATGAGCCACTTTACCTGTCTTCTGAGTACGAAGCAGCTCCAGGAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101590 CATGAGCCACTTTACCTGTCTTCTGAGTACGAAGCAGCTCCAGGAAGCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TGGGGTTTTTACTGAGGATGTTCCCACCTGCAAGACATGTGGGAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101640 TGGGGTTTTTACTGAGGATGTTCCCACCTGCAAGACATGTGGGAAGACCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TCTCATGCTCTTACACACTACGGCGACATGCCACGGTGCACACACGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101690 TCTCATGCTCTTACACACTACGGCGACATGCCACGGTGCACACACGTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CGACCCTATGAGTGCCGCTACTGCCTGCGGAGCTACACGCAGTCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101740 CGACCCTATGAGTGCCGCTACTGCCTGCGGAGCTACACGCAGTCAGGGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CCTCTACCGCCACATCCGCAAGGCTCACAATGAGGACCTGGCCAAACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101790 CCTCTACCGCCACATCCGCAAGGCTCACAATGAGGACCTGGCCAAACGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GCAAACCAGATCCAGAAGTGGGACCCCTTCTAGGGGTGCAGCCTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101840 GCAAACCAGATCCAGAAGTGGGACCCCTTCTAGGGGTGCAGCCTCTCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GGCTCCCCAACAGCAGACAGACAGAGCAGCAGTGGTGGAGGGCCACCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101890 GGCTCCCCAACAGCAGACAGACAGAGCAGCAGTGGTGGAGGGCCACCTAA

   1700     .    :    .    :    .    :
   1692 AGATTTTGTATTGGCCCCAAAAACTAACATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101940 AGATTTTGTATTGGCCCCAAAAACTAACATC