seq1 = pF1KB7050.tfa, 1512 bp
seq2 = pF1KB7050/gi568815589f_22347066.tfa (gi568815589f:22347066_22551908), 204843 bp

>pF1KB7050 1512
>gi568815589f:22347066_22551908 (Chr9)

1-667  (100001-100667)   100% ->
668-1512  (103999-104843)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGTCACAGTGTGGCAGCAGAGACCGAGGCGTTAGCGGCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGTCACAGTGTGGCAGCAGAGACCGAGGCGTTAGCGGCCGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCACTTGGCCCCTGGGCTAGTGGTGGCTGCCCCTCCGCCCCCGTCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCACTTGGCCCCTGGGCTAGTGGTGGCTGCCCCTCCGCCCCCGTCCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTTGCCGGTACCATCGGGGATGCAGGTTCCCCCAGCGTTCCTGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTTGCCGGTACCATCGGGGATGCAGGTTCCCCCAGCGTTCCTGCGGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAGCCTCTTTCTGCGAGCAGCGGCCGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAGCCTCTTTCTGCGAGCAGCGGCCGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCTCGGGAAGCGGAGGCTGCCCGCCGGCTCCCGGGCTGGAGAGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCTCGGGAAGCGGAGGCTGCCCGCCGGCTCCCGGGCTGGAGAGCGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGGCGCGGTGGGCTGCGGCTACCCGCGGACGCCCAAGTGCGCCCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGGCGCGGTGGGCTGCGGCTACCCGCGGACGCCCAAGTGCGCCCGCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGTAACCATGGTGTGGTGTCAGCGCTCAAGGGCCACAAGCGCTTCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGTAACCATGGTGTGGTGTCAGCGCTCAAGGGCCACAAGCGCTTCTGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGGCGGGACTGCGCGTGTGCCAAGTGCACCCTGATCGCCGAGCGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGGCGGGACTGCGCGTGTGCCAAGTGCACCCTGATCGCCGAGCGCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGTCATGGCCGCCCAGGTGGCGCTGCGCAGGCAGCAGGCGCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGTCATGGCCGCCCAGGTGGCGCTGCGCAGGCAGCAGGCGCAGGAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCGAAGCCCGGGGGCTACAGAGGCTCCTGTGCTCGGGGCTCTCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCGAAGCCCGGGGGCTACAGAGGCTCCTGTGCTCGGGGCTCTCCTGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCCGGTGGTCGGGCATCCGGGGGCGGCGGCAGAGCCGAGAATCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCCGGTGGTCGGGCATCCGGGGGCGGCGGCAGAGCCGAGAATCCACAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCACGGGCGGCCCTGCGGCGGGGGCTGCGCTGGGACTGGGTGCCTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCACGGGCGGCCCTGCGGCGGGGGCTGCGCTGGGACTGGGTGCCTTGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGGCCAGTGGTTCCGCGACCCCCGCTTTCGAAGTTTTCCAGCAAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGGCCAGTGGTTCCGCGACCCCCGCTTTCGAAGTTTTCCAGCAAGATTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCTGAGGAAAAACAAG         AACAAAAAGAGAGTAAATGTGAGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCTGAGGAAAAACAAGGTG...CAGAACAAAAAGAGAGTAAATGTGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CATGCCAGAATGGACAAGAAGAACTGATCTCCAAATCCCATCAGCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104023 CATGCCAGAATGGACAAGAAGAACTGATCTCCAAATCCCATCAGCTTTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTAGGATCATCTTCTAGGTCTAATGGTGTCATTGGGAAACAAAGTATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104073 CTAGGATCATCTTCTAGGTCTAATGGTGTCATTGGGAAACAAAGTATCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GTCATCTATTTCAGAATACTCCAACAAGCCTGATAGTATCCTGTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104123 GTCATCTATTTCAGAATACTCCAACAAGCCTGATAGTATCCTGTCTCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATCCTGGAGAGCAATCAGGAGGTGAAGAGAGTCCCAGGTCCTTATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104173 ATCCTGGAGAGCAATCAGGAGGTGAAGAGAGTCCCAGGTCCTTATCATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCTGATCTGGAATCAGGAAATGAAAGTGAATGGGTCAAAGACTTGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104223 TCTGATCTGGAATCAGGAAATGAAAGTGAATGGGTCAAAGACTTGACTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GACCAAGGCAAGCCTTCCGACAGTGTCCTCAAGACCAAGAGATCCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104273 GACCAAGGCAAGCCTTCCGACAGTGTCCTCAAGACCAAGAGATCCTCTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATATCCTTACTAAGATTTTCCCAAATTACAGGCGCAGCCGGCTAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104323 ATATCCTTACTAAGATTTTCCCAAATTACAGGCGCAGCCGGCTAGAAGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATTCTACGGTTCTGCAAAGGGGATGTGGTCCAAGCCATTGAACAGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104373 ATTCTACGGTTCTGCAAAGGGGATGTGGTCCAAGCCATTGAACAGGTTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AAATGGCAAAGAACACAAGCCAGACAACAGGAACCTAGCAAACTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104423 AAATGGCAAAGAACACAAGCCAGACAACAGGAACCTAGCAAACTCAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AACTGGAAAACACAGCCTTTCAGAGAGCTTCAAGTTTTAGTCTTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104473 AACTGGAAAACACAGCCTTTCAGAGAGCTTCAAGTTTTAGTCTTGCTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATTGGTTTTGGAACTCTAGGTAATAAATCAGCTTTCTCTCCTCTTCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104523 ATTGGTTTTGGAACTCTAGGTAATAAATCAGCTTTCTCTCCTCTTCAAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TACTTCTGCTTCTTATGGAGGTGATTCAAGTCTCTACGGCGTAAATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104573 TACTTCTGCTTCTTATGGAGGTGATTCAAGTCTCTACGGCGTAAATCCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GAGTAGGTATCAGTCCATTAAGGCTGGCATATTCTTCTGCAGGAAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104623 GAGTAGGTATCAGTCCATTAAGGCTGGCATATTCTTCTGCAGGAAGAGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TTATCTGGTTTTATGTCACCCTACCTAACACCTGGGTTAGTACCAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104673 TTATCTGGTTTTATGTCACCCTACCTAACACCTGGGTTAGTACCAACCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 ACCTTTTCGGCCAGCTTTGGATTATGCCTTTTCAGGGATGATTAGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104723 ACCTTTTCGGCCAGCTTTGGATTATGCCTTTTCAGGGATGATTAGAGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CTTCCTACCTTTCCAGTAAAGACTCAATAACTTGTGGCAGACTGTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104773 CTTCCTACCTTTCCAGTAAAGACTCAATAACTTGTGGCAGACTGTACTTC

   1500     .    :    .    :
   1492 AGACCAAATCAGGACAATCCG
        |||||||||||||||||||||
 104823 AGACCAAATCAGGACAATCCG